象草PAL基因克隆及其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2017-08-22 10:14
本文關(guān)鍵詞:象草PAL基因克隆及其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)
更多相關(guān)文章: 象草 木質(zhì)素 苯丙氨酸解氨酶 生物信息學(xué)
【摘要】:苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物木質(zhì)素生物合成途徑中的關(guān)鍵酶,參與木質(zhì)素、類黃酮和花青素等次生代謝產(chǎn)物的形成。本研究以‘N51’象草(Pennisetum purpureum)為材料,通過(guò)同源克隆、3′RACE和hi-Tail PCR的方法,對(duì)PAL基因進(jìn)行克隆,得到PpPALcDNA序列2429bp以及DNA序列全長(zhǎng)3907bp。PpPAL編碼的蛋白包含720個(gè)氨基酸,具有典型的GTITASGDLVPLSYIAG苯丙氨酸解氨酶保守活性基序。運(yùn)用生物信息學(xué)進(jìn)行分析,PpPAL基因cDNA序列與玉米(Zea mays L.)ZmPAL的相似性最高為94%,與其他禾本科植物也有著較高的相似性。在氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化分析中,PpPAL與ZmPAL遺傳距離最近,并與其他禾本科植物PAL聚為一類。PpPAL蛋白的三維結(jié)構(gòu)模型顯示,PpPAL蛋白具有典型的"海馬狀"結(jié)構(gòu),表明PpPAL是典型的苯丙氨酸解氨酶家族,對(duì)木質(zhì)素的合成起著重要的作用。
【作者單位】: 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)與風(fēng)景園林學(xué)院;廣東省草業(yè)工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 象草 木質(zhì)素 苯丙氨酸解氨酶 生物信息學(xué)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31272491,30972138) 教育部高等學(xué)校博士學(xué)科點(diǎn)專項(xiàng)科研基金(20124404110011)資助
【分類號(hào)】:S543.9;Q943.2
【正文快照】: 象草(Pennisetum purpureum)為禾本科(Gramineae)狼尾草屬多年生C4草本植物。原產(chǎn)于熱帶非洲大陸和Bioko島嶼,現(xiàn)已廣泛種植于熱帶和亞熱帶區(qū)域[1]。因具有產(chǎn)量高、營(yíng)養(yǎng)豐富、適口性良好、適應(yīng)性、抗逆性和再生能力強(qiáng)、生物質(zhì)產(chǎn)量和熱值高等特點(diǎn),使其成為熱帶、亞熱帶廣泛種植
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 朱瓊?cè)A;張向前;霍松;陳慧;李有涵;唐然;解新明;;象草CCR基因的克隆與生物信息學(xué)分析(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2012年02期
2 吳翰,余倩珠;象草葉的解剖研究[J];華南農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào);1983年04期
3 ;[J];;年期
,本文編號(hào):718537
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