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微滴數(shù)字PCR分析肺癌患者外周血SHOX2基因甲基化的應(yīng)用價值

發(fā)布時間:2025-01-13 23:08
  肺癌是發(fā)病率和死亡率較高的惡性腫瘤。由于肺癌早期起病隱匿,大部分患者被診斷時多處于中晚期,易錯過最佳治療時期,五年生存率較低,提高肺癌的診斷率至關(guān)重要。目前,臨床診斷肺癌的方法主要有組織細(xì)胞學(xué)、影像學(xué)及血清腫瘤標(biāo)志物檢查。隨著對腫瘤發(fā)病機(jī)制的研究深入,DNA甲基化在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制備受關(guān)注,其中基因組低甲基化和CpG島局部高甲基化可通過介導(dǎo)腫瘤相關(guān)基因功能改變誘發(fā)腫瘤。人矮小同源盒基因2(short stature homeobox 2,SHOX2)屬于SHOX基因家族成員,主要編碼蛋白轉(zhuǎn)錄因子,該基因表達(dá)異常或表觀遺傳學(xué)改變可引起某些疾病。許多研究表明SHOX2基因甲基化與肺癌有關(guān)。目前SHOX2基因甲基化檢測主要借助組織活檢,這種方法具有侵入性、風(fēng)險較大且獲取的腫瘤組織有異質(zhì)性,而選用液體活檢,對血液或其它體液標(biāo)本進(jìn)行SHOX2基因甲基化檢測可彌補(bǔ)組織活檢的缺陷。通常用于SHOX2基因甲基化檢測的方法有甲基化特異性PCR、亞硫酸氫鹽測序和熒光定量PCR。這些方法雖然有較好的靈敏性和特異性,但仍存在一些不足,例如不易從復(fù)雜樣品中準(zhǔn)確地定量微量的靶核酸。近年來,新型的微滴數(shù)字PC...

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖3.1.1ddPCR優(yōu)化退火溫度結(jié)果(一維圖:藍(lán)色信號代表SHOX2基因甲基化陽性,灰色信號代表陰性)

圖3.1.1ddPCR優(yōu)化退火溫度結(jié)果(一維圖:藍(lán)色信號代表SHOX2基因甲基化陽性,灰色信號代表陰性)

退火溫度的結(jié)果顯示(圖3.1.1),在50℃<sup>6</sup>0℃之間,熒光信低先增強(qiáng)后減弱,當(dāng)溫度在56.3℃<sup>5</sup>8.3℃范圍時,觀察到陽較明顯,為了提高結(jié)果特異性,選擇58℃作為ddPCR檢測S的最適退火溫度。


圖3.1.2.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖譜

圖3.1.2.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖譜

圖3.1.2.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖譜(m:600bpLadder,1-2:甲基化對照品,3-4:非甲基化對照,5:空白對照)Figure3.1.2.1ElectrophoreticpatternofPCRproductoftargetgenes(m:600....


圖3.1.3標(biāo)準(zhǔn)品ddPCR檢測結(jié)果:一維圖顯示在不同甲基化水平的標(biāo)準(zhǔn)品中SHOX2基因甲基化檢測結(jié)果(A)和SHOX2基因甲基化水平(Ratio),誤差線表示泊松95%置信區(qū)間(B)

圖3.1.3標(biāo)準(zhǔn)品ddPCR檢測結(jié)果:一維圖顯示在不同甲基化水平的標(biāo)準(zhǔn)品中SHOX2基因甲基化檢測結(jié)果(A)和SHOX2基因甲基化水平(Ratio),誤差線表示泊松95%置信區(qū)間(B)

.1.3標(biāo)準(zhǔn)品ddPCR檢測結(jié)果:一維圖顯示在不同甲基化水平的標(biāo)準(zhǔn)品中SHOX2基檢測結(jié)果(A)和SHOX2基因甲基化水平(Ratio),誤差線表示泊松95%置信區(qū)間gure3.1.3ddPCRresults:1-Dgraphshowsresulto....


圖3.3.1SHOX2基因甲基化診斷肺癌ROC曲線(肺癌組III/IV期vs正常組)

圖3.3.1SHOX2基因甲基化診斷肺癌ROC曲線(肺癌組III/IV期vs正常組)

基因甲基化診斷肺癌ROC曲線(肺癌組III/ofthediagnosisoflungcancerbySHOX2methstageIII/IVlungcancerpatients)甲基化在肺癌中的臨床應(yīng)用價值疾病組中,肺癌組SHOX2基因甲病組....



本文編號:4026035

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