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大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運(yùn)體基因家族的鑒定與表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2025-01-15 09:52
   該研究基于已公布的大豆基因組序列信息,對(duì)大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運(yùn)體基因家族進(jìn)行了全基因組鑒定,并對(duì)該家族成員的基因特征、蛋白結(jié)構(gòu)、染色體定位、基因復(fù)制和表達(dá)模式等進(jìn)行了全面分析,為進(jìn)一步了解該家族基因的功能及培育鉀高效大豆品種提供理論支撐。結(jié)果表明:(1)在大豆基因組中共鑒定30個(gè)KUP/HAK/KT基因(簡(jiǎn)寫為GmHAK01GmHAK30),這些基因分布在大豆的15條染色體上,串聯(lián)復(fù)制和片段復(fù)制可能導(dǎo)致了GmHAKs基因在大豆基因組中的擴(kuò)增。(2)大豆GmHAKs蛋白間序列一致性很高,均具有12~14個(gè)跨膜區(qū),且都定位于質(zhì)膜上。(3)進(jìn)化分析表明大豆GmHAKs可聚為4個(gè)進(jìn)化簇ClusterⅠ,其中ClusterⅡ的成員數(shù)目最多(16個(gè)),ClusterⅣ的成員數(shù)目最少(1個(gè))。(4)所有GmHAKs基因均包含內(nèi)含子和外顯子,其內(nèi)含子數(shù)目在7~9個(gè)之間,且同一亞家族的GmHAKs基因大部分具有相似的內(nèi)含子-外顯子分布模式。(5)表達(dá)模式分析表明,大豆GmHAKs的表達(dá)大致可分為兩類:一類是一些組織特異性表達(dá)的基因,包括了Cluste...

【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 KUP/HAK/KT家族成員的鑒定
    1.2 序列分析
    1.3 進(jìn)化樹的構(gòu)建
    1.4 基因結(jié)構(gòu)示意圖的繪制
    1.5 染色體定位和基因復(fù)制分析
    1.6 基因表達(dá)模式分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運(yùn)體家族成員的鑒定
    2.2 大豆KUP/HAK/KT家族成員的蛋白序列分析
    2.3 大豆KUP/HAK/KT家族成員的進(jìn)化分析
    2.4 大豆KUP/HAK/KT家族成員的基因結(jié)構(gòu)分析
    2.5 大豆KUP/HAK/KT家族成員的染色體定位及復(fù)制
    2.6 大豆KUP/HAK/KT家族基因的表達(dá)模式分析
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本文編號(hào):4027229

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