大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運體基因家族的鑒定與表達分析
發(fā)布時間:2025-01-15 09:52
該研究基于已公布的大豆基因組序列信息,對大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運體基因家族進行了全基因組鑒定,并對該家族成員的基因特征、蛋白結(jié)構(gòu)、染色體定位、基因復(fù)制和表達模式等進行了全面分析,為進一步了解該家族基因的功能及培育鉀高效大豆品種提供理論支撐。結(jié)果表明:(1)在大豆基因組中共鑒定30個KUP/HAK/KT基因(簡寫為GmHAK01GmHAK30),這些基因分布在大豆的15條染色體上,串聯(lián)復(fù)制和片段復(fù)制可能導(dǎo)致了GmHAKs基因在大豆基因組中的擴增。(2)大豆GmHAKs蛋白間序列一致性很高,均具有12~14個跨膜區(qū),且都定位于質(zhì)膜上。(3)進化分析表明大豆GmHAKs可聚為4個進化簇ClusterⅠⅣ,其中ClusterⅡ的成員數(shù)目最多(16個),ClusterⅣ的成員數(shù)目最少(1個)。(4)所有GmHAKs基因均包含內(nèi)含子和外顯子,其內(nèi)含子數(shù)目在7~9個之間,且同一亞家族的GmHAKs基因大部分具有相似的內(nèi)含子-外顯子分布模式。(5)表達模式分析表明,大豆GmHAKs的表達大致可分為兩類:一類是一些組織特異性表達的基因,包括了Cluste...
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 KUP/HAK/KT家族成員的鑒定
1.2 序列分析
1.3 進化樹的構(gòu)建
1.4 基因結(jié)構(gòu)示意圖的繪制
1.5 染色體定位和基因復(fù)制分析
1.6 基因表達模式分析
2 結(jié)果與分析
2.1 大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運體家族成員的鑒定
2.2 大豆KUP/HAK/KT家族成員的蛋白序列分析
2.3 大豆KUP/HAK/KT家族成員的進化分析
2.4 大豆KUP/HAK/KT家族成員的基因結(jié)構(gòu)分析
2.5 大豆KUP/HAK/KT家族成員的染色體定位及復(fù)制
2.6 大豆KUP/HAK/KT家族基因的表達模式分析
3 討論
本文編號:4027229
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1 材料和方法
1.1 KUP/HAK/KT家族成員的鑒定
1.2 序列分析
1.3 進化樹的構(gòu)建
1.4 基因結(jié)構(gòu)示意圖的繪制
1.5 染色體定位和基因復(fù)制分析
1.6 基因表達模式分析
2 結(jié)果與分析
2.1 大豆KUP/HAK/KT鉀轉(zhuǎn)運體家族成員的鑒定
2.2 大豆KUP/HAK/KT家族成員的蛋白序列分析
2.3 大豆KUP/HAK/KT家族成員的進化分析
2.4 大豆KUP/HAK/KT家族成員的基因結(jié)構(gòu)分析
2.5 大豆KUP/HAK/KT家族成員的染色體定位及復(fù)制
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