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基于MHC-DRB基因的塔里木馬鹿遺傳多樣性及適應(yīng)性進(jìn)化研究

發(fā)布時(shí)間:2024-05-10 00:33
  主要組織相容性復(fù)合體(Major Histocompatibility Complex,MHC)是脊椎動(dòng)物免疫系統(tǒng)的一個(gè)多基因家族,是有高度多態(tài)性基因座組成的、與免疫應(yīng)答和抗病性密切相關(guān)的多基家族。MHC基因已被認(rèn)為是研究脊椎動(dòng)物適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制的最佳候選標(biāo)記,這一觀點(diǎn)已經(jīng)被大量的研究認(rèn)定。目前,進(jìn)化遺傳學(xué)和分子生態(tài)學(xué)最為熱點(diǎn)就研究MHC基因多態(tài)性及其進(jìn)化機(jī)制。到目前為止,在鹿科動(dòng)物MHC-DRB基因的進(jìn)化機(jī)制方面的研究一直缺乏來(lái)自塔里木馬鹿的研究證據(jù)。塔里木馬鹿(Cervus elaphus yarkandensis)是新疆馬鹿之中高度適應(yīng)荒漠生境而形成的特殊亞種,是國(guó)家Ⅱ級(jí)保護(hù)動(dòng)物,又是重要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物。本研究MHC-DRB基因作為分子標(biāo)記,研究塔里木馬鹿MHC-DRB的多態(tài)性及適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制。主要研究結(jié)果如下:1.本研究通過(guò)PCR-SSCP和克隆測(cè)序技術(shù),利用牛DRB3特異性引物,從51個(gè)塔里木馬鹿樣本中檢測(cè)出13個(gè)DRB等位基因,該13個(gè)等位基因序列包含76個(gè)核苷酸變異(24個(gè)單突變位點(diǎn)和52個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)),總位點(diǎn)數(shù)中變異位點(diǎn)數(shù)占30.5%。本研究所得的13條等位基因序列中G、C...

【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1野生塔里木馬鹿Fig1-1WildCervuselaphusyarkandensis

圖1-1野生塔里木馬鹿Fig1-1WildCervuselaphusyarkandensis

其數(shù)量減少到100頭左右[37],其目前情況相當(dāng)危險(xiǎn);2006年結(jié)果表塔里木河中游馬鹿種群數(shù)量為21-71頭左右(采用截線抽樣法調(diào)查)[27];最近道的研究結(jié)果為:塔里木河下游馬鹿種群數(shù)量為50-102頭,種群總數(shù)量降低451頭處于極瀕危狀態(tài)[38,39]。1.....


圖1-2MHCI類和II類分子的結(jié)構(gòu)示意圖(HughesandYeager,1998)

圖1-2MHCI類和II類分子的結(jié)構(gòu)示意圖(HughesandYeager,1998)

鍵作用的多基因家族之一,通常具有高度多態(tài)性以抵御各種病原體;诮Y(jié)構(gòu)和功能上,MHC一般分為I、II和III類。mhcI和II類分子都作為體發(fā)揮作用。MHCI分子類異二聚體由MHC蛋白和非MHCβ2微球蛋白成[60]。相比之下,MHCⅡ類蛋白作為....


圖2-1基因組DNA的電泳檢測(cè)結(jié)果

圖2-1基因組DNA的電泳檢測(cè)結(jié)果

新疆大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文后續(xù)分析。用DnaSPVersion6[140]軟件來(lái)計(jì)算種群內(nèi)的核苷酸多樣度(Nucleotidediversity,π)單倍型多樣性(Haplotypediversity,H)。2.5實(shí)驗(yàn)結(jié)果2.5.1基因組DNA的檢測(cè)從血液和肌肉樣....


圖2-2NanoDropND-1000微量核酸蛋白檢測(cè)儀檢測(cè)樣品的基因組DNA濃度和純度Fig.2-2GenomicDNAcheckedusingNanoDrop1000UV-VisSpectrophotometer

圖2-2NanoDropND-1000微量核酸蛋白檢測(cè)儀檢測(cè)樣品的基因組DNA濃度和純度Fig.2-2GenomicDNAcheckedusingNanoDrop1000UV-VisSpectrophotometer

2-2NanoDropND-1000微量核酸蛋白檢測(cè)儀檢測(cè)樣品的基因組DNA濃度和Fig.2-2GenomicDNAcheckedusingNanoDrop1000UV-VisSpectrophotomet.5.3塔里木馬鹿MHC-DRB的PCR產(chǎn)物....



本文編號(hào):3968589

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