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新疆小擬南芥MAPK和MKK基因家族的鑒定及表達特征分析

發(fā)布時間:2024-04-25 00:18
  促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)級聯(lián)是真核生物中普遍存在的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)模塊,在植物的生長發(fā)育、激素反應(yīng)和多種生物及非生物脅迫響應(yīng)過程中發(fā)揮重要作用。十字花科的短命植物小擬南芥(Arabidopsis pumila)生長在新疆干旱和半干旱的荒漠及鹽堿地環(huán)境,具有大量抗逆基因資源值得挖掘。因此,深入研究小擬南芥MAPK級聯(lián)及其功能,可以闡明植物抗逆的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò),為解析MAPK級聯(lián)介導(dǎo)的小擬南芥生長發(fā)育和抗逆反應(yīng)機制奠定基礎(chǔ)。目前,已在多種植物中鑒定了MAPK級聯(lián)中的3個基因家族:MAPK激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase kinase,MAPKKK或MEKK)、MAPK激酶(mitogen-activated protein kinase kinase,MAPKK或MKK)和MAPK,但小擬南芥中MAPK級聯(lián)基因家族的系統(tǒng)鑒定與分析尚未見報道。為了探索小擬南芥MAPK級聯(lián)基因家族的進化和功能,本研究通過全基因組分析鑒定了小擬南芥MAPK和MKK基因家族成員,并進行了進化及功...

【文章頁數(shù)】:80 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1MAPK級聯(lián)途徑模式(周秒依等,2020)

圖1-1MAPK級聯(lián)途徑模式(周秒依等,2020)

MAPK激酶(MAPKK、MEK或MKK)和MAPK。MAPKKK通常作用于MKK的S/T-xxxxx-S/T(S、T和x分別表示絲氨酸、蘇氨酸和任意氨基酸)位點將其磷酸化并激活,隨后,活化的MKK磷酸化MAPK的蘇氨酸和酪氨酸殘基(TXY)從而激活MAPK(XuandZhang....


圖1-2植物MAPK級聯(lián)反應(yīng)途徑激酶基因的數(shù)量Fig.1-2NumberofkinasegenesinplantMAPKcascadesresponsepathways

圖1-2植物MAPK級聯(lián)反應(yīng)途徑激酶基因的數(shù)量Fig.1-2NumberofkinasegenesinplantMAPKcascadesresponsepathways

cum)(Kongetal.,2012;Wuetal.,2014)、雷蒙德氏棉(Gossypiumraimondii)(Zhangetal.,2014;Yinetal.,2013;Zhangetal.,2012)、香蕉(Musaacuminate)(Asifetal.,2014;....


圖2-1不同激素濃度處理的小擬南芥幼苗表型Fig.2-1PhenotypeofArabidopsispumilaseedlingstreatedwithvarioushormoneconcentrationsA:SA處理3d后的幼苗生長情況;B:MeJA處理3d后的幼苗生長情況;C:IAA處理3d后的幼苗生長情況;D:ABA處理3d后的幼苗生長情況

圖2-1不同激素濃度處理的小擬南芥幼苗表型Fig.2-1PhenotypeofArabidopsispumilaseedlingstreatedwithvarioushormoneconcentrationsA:SA處理3d后的幼苗生長情況;B:MeJA處理3d后的幼苗生長情況;C:IAA處理3d后的幼苗生長情況;D:ABA處理3d后的幼苗生長情況

新疆小擬南芥MAPK和MKK基因家族的鑒定及表達特征分析13開始,根部變粗,有明顯的側(cè)根出現(xiàn),長出的根有根毛;于50μmol/L時,側(cè)根減少,只有少部分幼苗有側(cè)根出現(xiàn)。對于MeJA處理,50~100μmol/L之間,兩片子葉之間顏色逐漸加深;于150μmol/L時,下胚軸呈現(xiàn)紫色....


圖2-2小擬南芥ApMAPK基因的染色體分布圖

圖2-2小擬南芥ApMAPK基因的染色體分布圖

新疆小擬南芥MAPK和MKK基因家族的鑒定及表達特征分析19基于小擬南芥基因組的Hi-C組裝數(shù)據(jù)分析得知,小擬南芥有16條染色體。利用MG2C在線軟件對小擬南芥MAPK基因家族的38個基因成員進行染色體定位分析發(fā)現(xiàn),ApMAPK基因家族的所有成員不等分布在12條單獨的染色體上:每....



本文編號:3963718

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