結(jié)縷草中鹽脅迫響應(yīng)基因的克隆與功能研究
本文關(guān)鍵詞:結(jié)縷草中鹽脅迫響應(yīng)基因的克隆與功能研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:我國鹽堿土地面積大,分布廣,水資源短缺,水污染嚴(yán)重,因此需要提高植物的抗旱耐鹽堿能力來適應(yīng)我國水資源缺乏以及鹽堿土面積大分布廣的現(xiàn)狀。結(jié)縷草是一種被廣泛應(yīng)用的抗旱耐鹽堿能力強(qiáng)的暖季型草坪草,因此,本研究從結(jié)縷草鹽脅迫條件下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫里篩選和克隆響應(yīng)鹽脅迫的基因進(jìn)行研究,希望對(duì)提高植物耐鹽性提供一定的理論基礎(chǔ),同時(shí)為通過生物技術(shù)提高植物耐鹽堿能力提供候選基因。在本研究中,通過RT-PCR和qRT-PCR技術(shù),從結(jié)縷草鹽脅迫條件下的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫里被注釋為ERF類的unigenes里篩選得到4個(gè)基因,然后以結(jié)縷草cDNA為模板,通過RACE技術(shù)克隆獲得了3個(gè)基因(ZjRAP2-11、ZjERF7和ZjERF10)的全長cDNA;此外,通過與其他物種同源基因的比對(duì)和驗(yàn)證,克隆得到了結(jié)縷草ZjCCS基因的完整ORF框序列。最后,分別對(duì)這4個(gè)基因進(jìn)行研究,4個(gè)基因的研究結(jié)果如下:通過RACE技術(shù)獲得ZjERF10的全長cDNA 767 bp,其中,5'UTR 117 bp,3' UTR 215 bp, ORF長435 bp,編碼145個(gè)氨基酸,blastp比對(duì)沒有檢測到保守的結(jié)構(gòu)域,亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示該基因是一個(gè)非核定位的基因。生物信息學(xué)分析顯示:該蛋白為不穩(wěn)定的親水性脂溶蛋白,具有跨膜區(qū)段,但不具有信號(hào)肽。qRT-PCR結(jié)果顯示:在鹽處理4 h之內(nèi)該基因在葉片與根系中均表達(dá)上調(diào),但表達(dá)模式不同,該基因不僅受到鹽脅迫的誘導(dǎo),對(duì)于ABA、乙烯等其他非生物脅迫也會(huì)響應(yīng)表達(dá)上調(diào)。該基因過表達(dá)轉(zhuǎn)入禾本科模式植物水稻,與野生型相比,轉(zhuǎn)基因植株出現(xiàn)嚴(yán)重?cái)∮、結(jié)實(shí)率顯著下降的表型;在浸種相同時(shí)間的條件下, T0代種子萌發(fā)早于野生型;培養(yǎng)相同時(shí)間,轉(zhuǎn)基因植株的T1代幼苗地上部分和地下部分均矮于野生型;在250 mM·L-1 NaCl處理5 h條件下,T1代轉(zhuǎn)基因植株的耐鹽性強(qiáng)于野生型。因此,推測該基因可能是一個(gè)編碼離子通道類蛋白的基因,在植物生長發(fā)育過程中起副調(diào)控作用,在植物響應(yīng)非生物脅迫過程中起正調(diào)控作用。通過RACE技術(shù)克隆得到ZjRAP2-11基因的全長cDNA 1269 bp,其中5’UTR 92bp,3'UTR 262 bp, ORF長915 bp,編碼305個(gè)氨基酸,具有AP2超家族的保守結(jié)構(gòu)域,與谷子、玉米、水稻等其他物種中預(yù)測的響應(yīng)乙烯的轉(zhuǎn)錄因子RAP2-11-like相似度很高,亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示該基因定位于細(xì)胞核中;RACE技術(shù)克隆得到結(jié)縷草ZjERF7基因的全長cDNA 577 bp,其中5'UTR 157 bp,3'UTR 159 bp,ORF長261 bp,編碼87個(gè)氨基酸,在NCBI中沒有檢測到保守結(jié)構(gòu)域,NCBI數(shù)據(jù)庫中只有2個(gè)基因的氨基酸序列可以與之比對(duì)上,但是相似度不高,只有33%,亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示該基因在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中均存在。生物信息學(xué)分析結(jié)果推測ZjAP2-11基因編碼的蛋白為不穩(wěn)定的親水性脂溶蛋白,不具有跨膜區(qū)段;2jERF7基因編碼的蛋白為不穩(wěn)定的親水性脂溶蛋白,具有跨膜區(qū)段。qRT-PCR結(jié)果顯示,ZjRAP2-11和ZjERF7在ABA、乙烯、Air Dry和Cool 4種非生物脅迫均會(huì)表達(dá)上調(diào),但是,在AirDry脅迫下,ZjRAP2-11的表達(dá)量上升不明顯,同時(shí),根系和葉片中的ZjRAP2-11和ZjERF7對(duì)于鹽脅迫均會(huì)做出響應(yīng)表達(dá)上調(diào),但是表達(dá)模式不同,因此認(rèn)為ZjRAP2-11和ZjERF7基因在結(jié)縷草響應(yīng)非生物脅迫過程中發(fā)揮作用。為了解Cu/Zn超氧化物歧化酶分子伴侶基因(CCS)在結(jié)縷草非生物脅迫過程中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制,以結(jié)縷草轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫為依據(jù),結(jié)縷草cDNA為模板,通過RT-PCR技術(shù),克隆了924 bp結(jié)縷草ZjCCS核酸序列,編碼一個(gè)含有307個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。生物信息學(xué)分析顯示:該蛋白穩(wěn)定的疏水性脂溶蛋白,具有跨膜區(qū)段;與小米、玉米、甘蔗和水稻具有較高的同源性,含有植物CCS蛋白所特有的3個(gè)保守結(jié)構(gòu)域。qRT-PCR結(jié)果顯示,在鹽脅迫條件下,ZjCCS基因的表達(dá)量呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢,在4 h表達(dá)量達(dá)到最大值,相對(duì)于鹽脅迫,干旱脅迫和重金屬脅迫對(duì)ZjCCS基因的表達(dá)量影響不大,推測ZjCCS基因在結(jié)縷草響應(yīng)鹽脅迫過程中發(fā)揮作用。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)縷草 基因克隆 生物信息學(xué)分析 非生物脅迫 轉(zhuǎn)基因
【學(xué)位授予單位】:北京林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S688.4
【目錄】:
- 摘要3-5
- ABSTRACT5-10
- 1. 引言10-18
- 1.1. 研究背景10-16
- 1.1.1. 土壤鹽堿化的危害10
- 1.1.2. 植物對(duì)鹽脅迫的感受機(jī)制10-11
- 1.1.3. 根系中響應(yīng)鹽脅迫的基因調(diào)控11-12
- 1.1.4. Na~+和K~+的運(yùn)輸網(wǎng)絡(luò)12-13
- 1.1.5. NHX和SOS在維持細(xì)胞質(zhì)中低Na~+的作用13-14
- 1.1.6. HKT是植物耐鹽和Na~+由根系向上運(yùn)輸?shù)闹饕獏⑴c者14-16
- 1.1.7. 結(jié)縷草基因的研究進(jìn)展16
- 1.2. 研究的目的與意義16-17
- 1.3. 研究內(nèi)容與技術(shù)路線17-18
- 2. 結(jié)縷草鹽脅迫響應(yīng)基因的克隆與篩選18-34
- 2.1. 材料與方法18-28
- 2.1.1. 實(shí)驗(yàn)材料18-20
- 2.1.2. 實(shí)驗(yàn)方法20-28
- 2.2. 結(jié)果與分析28-32
- 2.2.1. PCR擴(kuò)增28-29
- 2.2.2. qRT-PCR驗(yàn)證29-30
- 2.2.3. RACE全長克隆30-32
- 2.3. 討論與結(jié)論32-34
- 3. 結(jié)縷草ZjERF10基因的克隆與功能研究34-56
- 3.1. 材料與方法34-41
- 3.1.1. 實(shí)驗(yàn)材料34-35
- 3.1.2. 試驗(yàn)方法35-41
- 3.2. 結(jié)果與分析41-53
- 3.2.1. 結(jié)縷草ZjERF10基因的RACE克隆41-42
- 3.2.2. 結(jié)縷草ZjERF10基因預(yù)測蛋白的理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)特征分析42-43
- 3.2.3. 結(jié)縷草ZjERF10基因的亞細(xì)胞定位43
- 3.2.4. 結(jié)縷草ZjERF10基因過表達(dá)載體的構(gòu)建與水稻遺傳轉(zhuǎn)化43-46
- 3.2.5. 結(jié)縷草ZjERF10基因?qū)Ψ巧锩{迫的響應(yīng)46-48
- 3.2.6. 結(jié)縷草ZjERF10基因過表達(dá)轉(zhuǎn)基因水稻的表型及功能觀察48-53
- 3.3. 討論與結(jié)論53-56
- 4. 結(jié)縷草ZjERF1基因的克隆與表達(dá)分析56-66
- 4.1. 材料與方法56
- 4.1.1. 實(shí)驗(yàn)材料56
- 4.1.2. 試驗(yàn)方法56
- 4.2. 結(jié)果與分析56-64
- 4.2.1. 結(jié)縷草ZjERF1基因的RACE克隆56-58
- 4.2.2. 結(jié)縷草ZjERF1基因預(yù)測蛋白的理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特征分析58
- 4.2.3.結(jié)縷草ZjRAP2/11/基因氨基酸序列的同源性比對(duì)和進(jìn)化樹分析58-60
- 4.2.4. 結(jié)縷草ZjERF1基因的亞細(xì)胞定位60-61
- 4.2.5. 結(jié)縷草ZjERF1對(duì)非生物脅迫的響應(yīng)61-64
- 4.3. 討論與結(jié)論64-66
- 5. 結(jié)縷草ZjERF7基因的克隆與表達(dá)分析66-74
- 5.1. 材料與方法66
- 5.1.1. 實(shí)驗(yàn)材料66
- 5.1.2. 試驗(yàn)方法66
- 5.2. 結(jié)果與分析66-72
- 5.2.1. 結(jié)縷草ZjERF7基因的RACE克隆66-67
- 5.2.2. 結(jié)縷草ZjERF7基因預(yù)測蛋白的理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)特征分析67-68
- 5.2.3. 結(jié)縷草ZjERF7基因的亞細(xì)胞定位68-69
- 5.2.4. 結(jié)縷草ZjERF7基因?qū)Ψ巧锩{迫的響應(yīng)69-72
- 5.3. 討論與結(jié)論72-74
- 6. 結(jié)縷草ZjCCS基因的克隆與表達(dá)分析74-86
- 6.1. 材料與方法74-75
- 6.1.1. 實(shí)驗(yàn)材料74
- 6.1.2. 實(shí)驗(yàn)方法74-75
- 6.2. 結(jié)果與分析75-83
- 6.2.1. 結(jié)縷草ZjCCS基因的克隆75-78
- 6.2.2. 結(jié)縷草ZjCCS蛋白理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)特征分析78
- 6.2.3. 結(jié)縷草ZjCCS基因氨基酸序列的同源性和進(jìn)化樹分析78-82
- 6.2.4. 結(jié)縷草ZjCCS基因表達(dá)分析82-83
- 6.3. 討論與結(jié)論83-86
- 6.3.1. ZjCCS蛋白功能預(yù)測83-85
- 6.3.2. 鹽、干旱和重金屬脅迫下結(jié)縷草ZjCCS基因的差異表達(dá)85-86
- 7. 結(jié)論與展望86-88
- 7.1. 全文總結(jié)86
- 7.2. 研究展望86-88
- 參考文獻(xiàn)88-98
- 個(gè)人簡介98-100
- 導(dǎo)師簡介100-102
- 獲得成果目錄102-104
- 致謝104
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本文編號(hào):395567
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