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非整倍體對異源六倍體小麥全基因組范圍內(nèi)基因表達的影響

發(fā)布時間:2024-04-09 01:02
  基因復(fù)制是獲得新基因的主要途徑,它的發(fā)生會導(dǎo)致本身劑量的改變;驈(fù)制最大可達到全基因組的復(fù)制,形成多倍體;也可以小到單個基因的復(fù)制,但是當多個連續(xù)基因的復(fù)制就形成了非整倍體。因此多倍化和非整倍化都可能對新基因的產(chǎn)生做出貢獻。研究表明,在新合成的異源多倍體中常常伴隨著大量的非整倍體的出現(xiàn),包括染色體數(shù)目的變化和染色體結(jié)構(gòu)的變化。為什么會出現(xiàn)非整倍體?非整倍體的出現(xiàn)是不同物種雜交沖擊的偶然事件,還是異源多倍化物種形成過程中的必然產(chǎn)物,目前仍然沒有明確的答案。雖然伴隨異源多倍化產(chǎn)生的非整倍體的事件已經(jīng)被報道,但是其在基因表達水平的變化還鮮有研究。本文以異源多倍體的模式物種小麥(Triticum aestivum L.)為背景,基于傳統(tǒng)的遺傳學(xué)手段創(chuàng)制的不同類型的小麥非整倍體,主要以部分同源染色體組1的染色體數(shù)目變化為主,利用FISH/GISH技術(shù)與轉(zhuǎn)錄組測序相結(jié)合的方法,試圖揭示異源多倍體物種是如何應(yīng)答非整倍化事件的發(fā)生。通過對測序結(jié)果中不同層級的劃分,探究非整倍化在多倍化背景下所產(chǎn)生的影響及其表型結(jié)果。本研究表明,在轉(zhuǎn)錄水平上,非整倍化的發(fā)生能夠使異源六倍體小麥引起全局的響應(yīng),主要受順式...

【文章頁數(shù)】:89 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.1.非整倍體中觀察到的基因表達效應(yīng)類型的圖示

圖1.1.非整倍體中觀察到的基因表達效應(yīng)類型的圖示

圖1.1.非整倍體中觀察到的基因表達效應(yīng)類型的圖示[22]igure1.1.Diagrammaticrepresentationofthetypesofeffectsobservedforgeneexpressioaneuploids[22]倍化與表型....


圖2.1.所有小麥非整倍體及其整倍體萌發(fā)15天的幼苗植株

圖2.1.所有小麥非整倍體及其整倍體萌發(fā)15天的幼苗植株

圖2.1.所有小麥非整倍體及其整倍體萌發(fā)15天的幼苗植株。比例尺是1.8cm。Figure2.1.SeedlingsoftheallaneuploidstrainsandtheircommoneuploidCSat15daysafter....


圖2.2.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的概括

圖2.2.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的概括

圖2.2.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的概括。Figure2.2.SummaryoftheRNA-seqdataset.析stqc軟件包評估原始數(shù)據(jù)(rawdata)的質(zhì)量,然后去掉低質(zhì)量得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)(cleanreads);赥ophat2.0軟件將其與ts.ens....


圖2.3.所有轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對詳情

圖2.3.所有轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對詳情

圖2.3.所有轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對詳情。Figure2.3.SummaryofnumberofreadpairsforeachRNA-seqsample.劑量補償?shù)姆治隽垦a償,指的是即使基因拷貝數(shù)已經(jīng)發(fā)生了改變,但是其基因的表達量維持在本實驗材料中,選取涉及....



本文編號:3949076

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