在植物中,小熱激蛋白(sHSPs)是含量最豐富,分布最廣泛的熱激蛋白,其保守的結(jié)構(gòu)特征是在細(xì)菌和真核生物分化之前進(jìn)化而來的。sHSPs作為分子伴侶,有助于抑制蛋白質(zhì)聚集、細(xì)胞骨架蛋白動(dòng)力學(xué)、細(xì)胞生長(zhǎng)、轉(zhuǎn)錄、分化等在內(nèi)的多種不同的細(xì)胞進(jìn)程。研究表明:番茄中SlHSP20基因簇在同一條染色體47.54Mb區(qū)域上串聯(lián)重復(fù)排列。根據(jù)基因家族成員自身的進(jìn)化分析,SlHSP20基因簇屬于定位于細(xì)胞質(zhì)/細(xì)胞核的CI類亞族sHSPs,并根據(jù)蛋白質(zhì)的分子量命名為SlHSP17.6A、SlHSP17.6B、SlHSP17.6C和SlHSP17.7A。這些SlHSP20基因的基因組織結(jié)構(gòu)與其同物種內(nèi)sHSPs基因存在旁系同源關(guān)系,該基因簇中4個(gè)基因所編碼的氨基酸序列具有高度同源性,但其5’-UTR中順式作用元件不同,基因簇在番茄生長(zhǎng)發(fā)育的表達(dá)及對(duì)激素和外源糖處理的表達(dá)都存在明顯差異。共表達(dá)分析顯示基因簇的互作基因也各不相同。以上研究結(jié)果為進(jìn)一步分析番茄sHSPs基因的進(jìn)化起源及其功能奠定了基礎(chǔ)。

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圖1番茄SlHSP20基因簇成員序列比對(duì)

根據(jù)同源性序列分析發(fā)現(xiàn)，基因簇成員基因序列具有高度的相似性，同源性達(dá)到95.74%。堿基序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)4個(gè)串聯(lián)重復(fù)的基因具有相同的基因結(jié)構(gòu)，均不含內(nèi)含子，且CDS序列與基因序列基本一致(圖1)。根據(jù)番茄SlHSP20基因簇成員染色體的定位情況可知，在番茄第6條染色體上發(fā)現(xiàn)4個(gè)串聯(lián)....

圖2番茄SlHSP20基因簇進(jìn)化樹分析及蛋白基序類型

對(duì)番茄SlHSP20基因簇成員的進(jìn)化樹分析顯示，SlHSP17.6A、SlHSP17.6B、SlHSP17.6C和SlHSP17.7A定位于CI類亞族(細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核)，說明這4個(gè)串聯(lián)重復(fù)基因編碼的蛋白分布在細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中。根據(jù)SlHSP20基因簇進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)....

圖3番茄SlHSP20基因簇基序及保守結(jié)構(gòu)域β鏈分析

圖2番茄SlHSP20基因簇進(jìn)化樹分析及蛋白基序類型根據(jù)氨基酸同源性分析，基因簇成員具有高度的同源性(圖4和表2)。所有的SlHSP20在C端均具有共同保守的熱激序列,熱激序列又分為保守序列I和保守序列II，中間有不同長(zhǎng)度的親水結(jié)合域。保守序列I都含有共同的M殘基：Pro-....

圖4番茄SlHSP20基因簇氨基酸序列的多序列比對(duì)及保守結(jié)構(gòu)域分析

根據(jù)氨基酸同源性分析，基因簇成員具有高度的同源性(圖4和表2)。所有的SlHSP20在C端均具有共同保守的熱激序列,熱激序列又分為保守序列I和保守序列II，中間有不同長(zhǎng)度的親水結(jié)合域。保守序列I都含有共同的M殘基：Pro-X(14)-Gly-Val-Leu；保守序列II的相似氨....

本文編號(hào)：3940873