基于權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的肺腺癌風(fēng)險預(yù)測模型構(gòu)建
發(fā)布時間:2024-01-26 22:52
研究背景與目的:在世界范圍內(nèi),肺癌是發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一,其中肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LAC)是肺癌最常見的病理類型之一。由于肺癌患者早期缺乏明顯的臨床癥狀,當(dāng)患者出現(xiàn)癥狀就診發(fā)現(xiàn)肺癌時往往已經(jīng)錯過了治療的最佳時機(jī)。目前臨床上發(fā)現(xiàn)和診斷肺癌主要通過影像學(xué)檢查和組織活檢,這些手段在肺癌的早期診斷上尚未普及。下一代測序(Next-generation sequencing,NGS)技術(shù)為探索疾病的分子特征和機(jī)制、發(fā)現(xiàn)新的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)提供了高通量數(shù)據(jù)和新途徑。本研究旨識別高風(fēng)險的LAC患者,以便制定更適合的治療手段和隨訪策略,從而改善整體預(yù)后,同時發(fā)現(xiàn)LAC新的生物標(biāo)志物和分子機(jī)制,以促進(jìn)其診斷、預(yù)后、預(yù)測、疾病監(jiān)測和新興療法的發(fā)展。方法:本研究收集了公共數(shù)據(jù)庫腫瘤基因圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)上498例含有臨床隨訪信息的LAC腫瘤組織的RNA-seq數(shù)據(jù),通過低表達(dá)過濾及去重復(fù)處理后保留12914個蛋白編碼基因信息。將498例LAC患者按病理分期分層隨機(jī)分為348例的測試集和150例的驗證集。對測試集中123...
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:博士
本文編號:3885839
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圖1-3權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)??
圖1-4模塊4臨床特征的相關(guān)性??注:每一列代表…個基因模塊,每一行代表一個臨床特征,每個單元格?
圖2-]通過十則交叉驗證選擇A??注?.紅點(diǎn)及豎線代表了每個A對應(yīng)的對數(shù)偏似然函數(shù)值士標(biāo)準(zhǔn)誤差(Standard?errof,SE),??
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