研究背景與目的盡管肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的臨床治療手段近年來取得了重大的進展,但其仍然是常見的消化道惡性腫瘤。迫切需要尋找新的預后生物標志物和分子靶標。因此,本研究旨在鑒定腫瘤微環(huán)境相關的潛在預后關鍵基因,并通過聯(lián)合臨床特征構建肝癌預后模型。研究方法基于癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中HCC患者的基因表達譜,使用ESTIMATE算法計算每個患者腫瘤樣本中免疫細胞和基質細胞的浸潤水平(即免疫評分和基質評分)。然后篩選高免疫/基質評分組和低免疫/基質評分組之間的差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs),并利用生物信息學分析這些DEGs涉及的細胞生物學過程和信號傳導通路。隨后使用單因素cox分析篩選其中和預后相關的DEGs,并通過四個其他的HCC隊列驗證這些預后基因,再使用套索回歸進一步篩選其中的預后關鍵基因。最后利用這些關鍵基因構建預后風險評分和預后模型。預后模型通過C指數(shù)和校準曲線來評估區(qū)分度和一致性。結果免疫/基質評分高的HCC患者比低評分的HCC患者具有...

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【學位級別】：碩士

圖1高免疫評分和基質評分與肝癌患者的更好預后顯著相關（A）根據(jù)免疫評分將患者分成兩組比較無復發(fā)生存期；（B）根據(jù)免疫評分將患者分成兩組比較無復發(fā)生存期；（C）根據(jù)基質評分將患者分成兩組比較無復發(fā)生存期；（D）根據(jù)基質評分將患者分成兩組比較總體生存期；（E-J）高免疫評分組

圖2肝癌中與預后相關的差異表達基因的功能富集分析

圖4147個預后相關差異基因在4個HCC隊列中的驗證

圖6TCGA肝癌隊列中10個關鍵基因與OS的相關性Kaplan-Meier生存曲線是通過使用KaplanMeierplotter網(wǎng)站（http://kmplot.com/analysis）繪制而成

本文編號：3885872