研究背景與目的盡管肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的臨床治療手段近年來取得了重大的進(jìn)展,但其仍然是常見的消化道惡性腫瘤。迫切需要尋找新的預(yù)后生物標(biāo)志物和分子靶標(biāo)。因此,本研究旨在鑒定腫瘤微環(huán)境相關(guān)的潛在預(yù)后關(guān)鍵基因,并通過聯(lián)合臨床特征構(gòu)建肝癌預(yù)后模型。研究方法基于癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中HCC患者的基因表達(dá)譜,使用ESTIMATE算法計(jì)算每個(gè)患者腫瘤樣本中免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞的浸潤(rùn)水平(即免疫評(píng)分和基質(zhì)評(píng)分)。然后篩選高免疫/基質(zhì)評(píng)分組和低免疫/基質(zhì)評(píng)分組之間的差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs),并利用生物信息學(xué)分析這些DEGs涉及的細(xì)胞生物學(xué)過程和信號(hào)傳導(dǎo)通路。隨后使用單因素cox分析篩選其中和預(yù)后相關(guān)的DEGs,并通過四個(gè)其他的HCC隊(duì)列驗(yàn)證這些預(yù)后基因,再使用套索回歸進(jìn)一步篩選其中的預(yù)后關(guān)鍵基因。最后利用這些關(guān)鍵基因構(gòu)建預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分和預(yù)后模型。預(yù)后模型通過C指數(shù)和校準(zhǔn)曲線來評(píng)估區(qū)分度和一致性。結(jié)果免疫/基質(zhì)評(píng)分高的HCC患者比低評(píng)分的HCC患者具有...

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

圖1高免疫評(píng)分和基質(zhì)評(píng)分與肝癌患者的更好預(yù)后顯著相關(guān)（A）根據(jù)免疫評(píng)分將患者分成兩組比較無復(fù)發(fā)生存期；（B）根據(jù)免疫評(píng)分將患者分成兩組比較無復(fù)發(fā)生存期；（C）根據(jù)基質(zhì)評(píng)分將患者分成兩組比較無復(fù)發(fā)生存期；（D）根據(jù)基質(zhì)評(píng)分將患者分成兩組比較總體生存期；（E-J）高免疫評(píng)分組

圖2肝癌中與預(yù)后相關(guān)的差異表達(dá)基因的功能富集分析

圖4147個(gè)預(yù)后相關(guān)差異基因在4個(gè)HCC隊(duì)列中的驗(yàn)證

圖6TCGA肝癌隊(duì)列中10個(gè)關(guān)鍵基因與OS的相關(guān)性Kaplan-Meier生存曲線是通過使用KaplanMeierplotter網(wǎng)站（http://kmplot.com/analysis）繪制而成

本文編號(hào)：3885872