Hippo信號(hào)通路在動(dòng)物生長發(fā)育過程中起到關(guān)鍵作用。根據(jù)已知的Hippo通路組成基因序列,利用BLAST軟件同源鑒定野桑蠶(Bombyx mandarina)轉(zhuǎn)錄組中的Hippo通路組成基因序列,利用生物信息學(xué)工具(ORFinder、web CD-search tool、Expasy-protparam、EMBL-EBI、MEME)分析蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量、等電點(diǎn)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、保守結(jié)構(gòu)域和保守基序等。利用Clustalx和MEGA 6.0進(jìn)行同源序列比對(duì)并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。在野桑蠶中鑒定了salvador、warts、mats、yorkie和scalloped同源基因,并預(yù)測(cè)了ORF框和編碼蛋白。結(jié)果表明,野桑蠶Warts、Sav和Mats與家蠶同源蛋白的一致性均在98%以上,Yki和Scalloped與家蠶一致性分別為89.02%和79.13%。比較兩者差異,家蠶Yki、Sd蛋白分別缺失了近WW2結(jié)構(gòu)域和在YAP結(jié)合結(jié)構(gòu)域中存在蛋白片段插入,野桑蠶Sd蛋白缺失了核定位信號(hào)基序和脯氨酸富集基序之間的鉸鏈區(qū)。Yki和Sd可按照物種科屬分別聚類,野桑蠶與家蠶聚為一支,表明這些同源蛋白在功能相似的...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 序列比對(duì)和基因鑒定
    1.3 結(jié)構(gòu)域分析
    1.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
    2.1 野桑蠶Hippo通路關(guān)鍵基因的同源鑒定
    2.2 表達(dá)分析
    2.3 YAP和Scalloped的序列比較
    2.4 系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 小結(jié)與討論



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