Hippo信號通路在動物生長發(fā)育過程中起到關鍵作用。根據(jù)已知的Hippo通路組成基因序列,利用BLAST軟件同源鑒定野桑蠶(Bombyx mandarina)轉(zhuǎn)錄組中的Hippo通路組成基因序列,利用生物信息學工具(ORFinder、web CD-search tool、Expasy-protparam、EMBL-EBI、MEME)分析蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量、等電點、二級結構、保守結構域和保守基序等。利用Clustalx和MEGA 6.0進行同源序列比對并構建系統(tǒng)進化樹。在野桑蠶中鑒定了salvador、warts、mats、yorkie和scalloped同源基因,并預測了ORF框和編碼蛋白。結果表明,野桑蠶Warts、Sav和Mats與家蠶同源蛋白的一致性均在98%以上,Yki和Scalloped與家蠶一致性分別為89.02%和79.13%。比較兩者差異,家蠶Yki、Sd蛋白分別缺失了近WW2結構域和在YAP結合結構域中存在蛋白片段插入,野桑蠶Sd蛋白缺失了核定位信號基序和脯氨酸富集基序之間的鉸鏈區(qū)。Yki和Sd可按照物種科屬分別聚類,野桑蠶與家蠶聚為一支,表明這些同源蛋白在功能相似的...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 序列比對和基因鑒定
    1.3 結構域分析
    1.4 系統(tǒng)進化樹構建
2 結果與分析
    2.1 野桑蠶Hippo通路關鍵基因的同源鑒定
    2.2 表達分析
    2.3 YAP和Scalloped的序列比較
    2.4 系統(tǒng)進化分析
3 小結與討論



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