為深入挖掘甘蔗品種的抗旱性能,本研究挑選甘蔗品種中參與調(diào)控抗旱機(jī)制的主要轉(zhuǎn)錄因子GRAS的基因進(jìn)行表達(dá)分析。從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中調(diào)取GRAS轉(zhuǎn)錄因子基因序列信息,采用RACE-PCR和qRT-PCR技術(shù)從‘蔗茅99-2’中克隆得到1個(gè)GRAS基因,將其命名為EfGRAS(GenBank登錄號(hào)MT499789),并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析與干旱脅迫表達(dá)分析。結(jié)果表明,EfGRAS基因編碼547個(gè)氨基酸,CDS全長(zhǎng)1644 bp,該蛋白的分子式為C2645H4149N747O816S21,相對(duì)分子質(zhì)量為60.14 kDa,不穩(wěn)定系數(shù)為54.85,脂肪系數(shù)為84.37,GRAVY值為-0.293,是一類(lèi)不穩(wěn)定蛋白和親水蛋白;亞細(xì)胞定位表明其位于細(xì)胞核內(nèi),EfGRAS蛋白主要的二級(jí)結(jié)構(gòu)是α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲,與高粱親緣關(guān)系最近;qRT-PCR分析顯示,受到干旱脅迫后,‘蔗茅99-2’中基因表達(dá)量相比于對(duì)照組上調(diào)約57.6倍,‘滇蔗01-58’中基因表達(dá)量相比于對(duì)照上調(diào)約27.4倍,‘崖城89-9’中基因表達(dá)量相比于對(duì)照組上調(diào)倍數(shù)較低。本研究結(jié)果為進(jìn)一步研究EfGRAS基因在甘蔗中的功能提供理論基礎(chǔ)。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA提取及c DNA鏈合成
        1.2.2 引物設(shè)計(jì)及基因表達(dá)分析
        1.2.3 Ef GRAS基因克隆
        1.2.4 Ef GRAS基因生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 RNA的檢測(cè)結(jié)果
    2.2 Ef GRAS基因克隆
    2.3 Ef GRAS基因生物信息學(xué)分析
        2.3.1 Ef GRAS轉(zhuǎn)錄因子的氨基酸組成及理化性質(zhì)分析
        2.3.2 Ef GRAS蛋白親疏水性及保守結(jié)構(gòu)域
        2.3.3 Ef GRAS蛋白亞細(xì)胞定位及序列比對(duì)分析
        2.3.4 E f G R A S
    2.4 Ef GRAS基因在干旱脅迫下的定量表達(dá)分析
3 討論
    3.1 Ef GRAS基因表達(dá)量分析
    3.2 Ef GRAS轉(zhuǎn)錄因子抗旱性克隆分析



本文編號(hào)：3850711