噬瓊膠假交替單胞菌胞外多糖對環(huán)境因子擾動的變構(gòu)調(diào)節(jié)及轉(zhuǎn)錄組基因表達差異分析
發(fā)布時間:2023-08-04 20:25
微生物胞外多糖是由微生物生產(chǎn)并分泌到胞外的一種糖類聚合物,在不斷變化的海洋環(huán)境中,胞外多糖的分泌可以減輕外界環(huán)境擾動對微生物自身的傷害,提高微生物存活的能力。本課題以噬瓊膠假交替單胞菌Pseudoalteromonas agarivorans Hao2018為研究對象,分別改變溫度和發(fā)酵初始p H,提取并純化了其所產(chǎn)的胞外多糖。通過高效液相色譜法和傅里葉紅外光譜法對胞外多糖單糖組成、糖環(huán)形式和糖苷鍵構(gòu)型進行測定,分析了環(huán)境因子擾動對胞外多糖產(chǎn)量和結(jié)構(gòu)的影響,之后以胞外多糖對羥基、DPPH和ABTS三種自由基的清除能力為指標,對其抗氧化活性進行評價比較。最后對發(fā)酵初始p H7(S157)和p H9(S159)條件下的噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018進行了轉(zhuǎn)錄組測序,對比分析了雙組分系統(tǒng)相關(guān)基因,細菌趨化性相關(guān)基因及胞外多糖合成相關(guān)基因的表達量情況。課題研究結(jié)果如下:溫度和發(fā)酵初始p H會對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖粗品的產(chǎn)量產(chǎn)生影響,胞外多糖主要由葡萄糖、甘露糖和鼠李糖組成,其中甘露糖和鼠李糖的比例隨著溫度的升高呈現(xiàn)先降低后升高的趨勢,隨著發(fā)酵初始p H的升高呈現(xiàn)一直降低趨...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 海洋細菌胞外多糖
1.1.1 海洋環(huán)境中胞外多糖產(chǎn)生菌
1.1.2 海洋細菌胞外多糖初級結(jié)構(gòu)分析
1.1.3 海洋細菌胞外多糖的生態(tài)意義
1.2 抗氧化活性
1.2.1 自由基概念
1.2.2 抗氧化活性的測定方法
1.3 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
1.4 立題依據(jù)及研究內(nèi)容
1.4.1 立題依據(jù)
1.4.2 研究內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
第2章 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖結(jié)構(gòu)的影響
2.1 實驗材料
2.1.1 菌株與培養(yǎng)基
2.1.2 實驗試劑
2.1.3 儀器和設備
2.2 實驗方法
2.2.1 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的制備
2.2.2 Sevag法除蛋白
2.2.3 DEAE-52纖維素離子交換層析
2.2.4 Sephadex G-100 葡聚糖凝膠柱層析
2.2.5 透析及冷凍干燥
2.2.6 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的單糖組成分析
2.2.7 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的紅外光譜分析
2.3 實驗結(jié)果及討論
2.3.1 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖粗品產(chǎn)量的影響
2.3.2 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖單糖組成的影響
2.3.3 環(huán)境因子擾動下噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的紅外光譜分析
2.4 本章小結(jié)
第3章 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的抗氧化活性的影響
3.1 實驗材料
3.1.1 實驗試劑
3.1.2 實驗儀器
3.2 實驗方法
3.2.1 羥自由基清除能力測定
3.2.2 DPPH自由基清除能力測定
3.2.3 ABTS自由基清除能力測定
3.3 實驗結(jié)果與討論
3.3.1 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖羥自由基清除能力的影響
3.3.2 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018 胞外多糖DPPH自由基清除能力的影響
3.3.3 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018 胞外多糖ABTS自由基清除能力的影響
3.4 本章小結(jié)
第4章 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018轉(zhuǎn)錄組基因表達差異分析
4.1 材料
4.1.1 測序樣品的制備
4.2 實驗方法
4.2.1 RNA提取及檢測
4.2.2 cDNA文庫構(gòu)建及測序
4.2.3 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估
4.2.4 比對分析
4.2.5 表達量分析
4.2.6 差異表達分析
4.2.7 GO富集分析
4.2.8 KEGG富集分析
4.3 結(jié)果與討論
4.3.1 測序數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估
4.3.2 比對分析
4.3.3 表達量分析
4.3.4 差異表達分析
4.3.5 GO富集分析
4.3.6 KEGG富集分析
4.3.7 雙組分系統(tǒng)及細菌趨化性相關(guān)基因表達情況分析
4.3.8 胞外多糖合成基因表達情況分析
4.4 本章小結(jié)
第5章 總結(jié)與展望
5.1 總結(jié)
5.2 展望
參考文獻
致謝
在學期間主要科研成果
本文編號:3838941
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 海洋細菌胞外多糖
1.1.1 海洋環(huán)境中胞外多糖產(chǎn)生菌
1.1.2 海洋細菌胞外多糖初級結(jié)構(gòu)分析
1.1.3 海洋細菌胞外多糖的生態(tài)意義
1.2 抗氧化活性
1.2.1 自由基概念
1.2.2 抗氧化活性的測定方法
1.3 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
1.4 立題依據(jù)及研究內(nèi)容
1.4.1 立題依據(jù)
1.4.2 研究內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
第2章 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖結(jié)構(gòu)的影響
2.1 實驗材料
2.1.1 菌株與培養(yǎng)基
2.1.2 實驗試劑
2.1.3 儀器和設備
2.2 實驗方法
2.2.1 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的制備
2.2.2 Sevag法除蛋白
2.2.3 DEAE-52纖維素離子交換層析
2.2.4 Sephadex G-100 葡聚糖凝膠柱層析
2.2.5 透析及冷凍干燥
2.2.6 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的單糖組成分析
2.2.7 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的紅外光譜分析
2.3 實驗結(jié)果及討論
2.3.1 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖粗品產(chǎn)量的影響
2.3.2 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖單糖組成的影響
2.3.3 環(huán)境因子擾動下噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的紅外光譜分析
2.4 本章小結(jié)
第3章 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖的抗氧化活性的影響
3.1 實驗材料
3.1.1 實驗試劑
3.1.2 實驗儀器
3.2 實驗方法
3.2.1 羥自由基清除能力測定
3.2.2 DPPH自由基清除能力測定
3.2.3 ABTS自由基清除能力測定
3.3 實驗結(jié)果與討論
3.3.1 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018胞外多糖羥自由基清除能力的影響
3.3.2 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018 胞外多糖DPPH自由基清除能力的影響
3.3.3 環(huán)境因子擾動對噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018 胞外多糖ABTS自由基清除能力的影響
3.4 本章小結(jié)
第4章 噬瓊膠假交替單胞菌Hao2018轉(zhuǎn)錄組基因表達差異分析
4.1 材料
4.1.1 測序樣品的制備
4.2 實驗方法
4.2.1 RNA提取及檢測
4.2.2 cDNA文庫構(gòu)建及測序
4.2.3 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估
4.2.4 比對分析
4.2.5 表達量分析
4.2.6 差異表達分析
4.2.7 GO富集分析
4.2.8 KEGG富集分析
4.3 結(jié)果與討論
4.3.1 測序數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估
4.3.2 比對分析
4.3.3 表達量分析
4.3.4 差異表達分析
4.3.5 GO富集分析
4.3.6 KEGG富集分析
4.3.7 雙組分系統(tǒng)及細菌趨化性相關(guān)基因表達情況分析
4.3.8 胞外多糖合成基因表達情況分析
4.4 本章小結(jié)
第5章 總結(jié)與展望
5.1 總結(jié)
5.2 展望
參考文獻
致謝
在學期間主要科研成果
本文編號:3838941
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