白樺BpPR1基因生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-08-04 20:23
利用生物信息學(xué)方法,對(duì)白樺BpPR1理化性質(zhì)、親水/疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)及與其他植物PR1蛋白的同源性進(jìn)行了預(yù)測,同時(shí)對(duì)該基因啟動(dòng)子的順式作用元件以及基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行了預(yù)測和分析。結(jié)果表明,①BpPR1的cDNA全長為816 bp,CDS為531 bp,編碼由176個(gè)氨基酸構(gòu)成的穩(wěn)定親水性蛋白,存在跨膜運(yùn)輸結(jié)構(gòu),屬于CAP蛋白家族的一員。白樺BpPR1與葡萄、棗親緣關(guān)系較近;②BpPR1基因組結(jié)構(gòu)中含有2個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子;③BpPR1啟動(dòng)子含有多個(gè)真核生物啟動(dòng)子的基本元件CAAT-box和TATA-box,還含有與低溫響應(yīng)、脫落酸響應(yīng)、茉莉酸甲酯響應(yīng)、生長素響應(yīng)、水楊酸響應(yīng)、細(xì)胞分裂素響應(yīng)相關(guān)的響應(yīng)元件以及MYBHv1結(jié)合位點(diǎn)等,說明該蛋白可能受多種生長調(diào)節(jié)劑調(diào)控,參與生物與非生物脅迫過程。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料來源
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 白樺BpPR1基因結(jié)構(gòu)分析
2.2 白樺BpPR1理化性質(zhì)預(yù)測
2.3 BpPR1信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)分析
2.4 BpPR1二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.5 氨基酸序列同源性對(duì)比
2.6 白樺BpPR1基因啟動(dòng)子序列分析
3 小結(jié)與討論
本文編號(hào):3838939
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1 材料與方法
1.1 材料來源
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 白樺BpPR1基因結(jié)構(gòu)分析
2.2 白樺BpPR1理化性質(zhì)預(yù)測
2.3 BpPR1信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)分析
2.4 BpPR1二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.5 氨基酸序列同源性對(duì)比
2.6 白樺BpPR1基因啟動(dòng)子序列分析
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