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白樺BpPR1基因生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2023-08-04 20:23
  利用生物信息學(xué)方法,對白樺BpPR1理化性質(zhì)、親水/疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)及與其他植物PR1蛋白的同源性進行了預(yù)測,同時對該基因啟動子的順式作用元件以及基因結(jié)構(gòu)進行了預(yù)測和分析。結(jié)果表明,①BpPR1的cDNA全長為816 bp,CDS為531 bp,編碼由176個氨基酸構(gòu)成的穩(wěn)定親水性蛋白,存在跨膜運輸結(jié)構(gòu),屬于CAP蛋白家族的一員。白樺BpPR1與葡萄、棗親緣關(guān)系較近;②BpPR1基因組結(jié)構(gòu)中含有2個外顯子和3個內(nèi)含子;③BpPR1啟動子含有多個真核生物啟動子的基本元件CAAT-box和TATA-box,還含有與低溫響應(yīng)、脫落酸響應(yīng)、茉莉酸甲酯響應(yīng)、生長素響應(yīng)、水楊酸響應(yīng)、細胞分裂素響應(yīng)相關(guān)的響應(yīng)元件以及MYBHv1結(jié)合位點等,說明該蛋白可能受多種生長調(diào)節(jié)劑調(diào)控,參與生物與非生物脅迫過程。

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料來源
    1.2 方法
2 結(jié)果與分析
    2.1 白樺BpPR1基因結(jié)構(gòu)分析
    2.2 白樺BpPR1理化性質(zhì)預(yù)測
    2.3 BpPR1信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)分析
    2.4 BpPR1二級、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.5 氨基酸序列同源性對比
    2.6 白樺BpPR1基因啟動子序列分析
3 小結(jié)與討論



本文編號:3838939

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