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基于線粒體COI基因的雷州半島馬尾藻屬常見種DNA條形碼鑒定及系統(tǒng)進化分析

發(fā)布時間:2023-06-03 19:38
  采用DNA條形碼技術輔以傳統(tǒng)形態(tài)分類方法,對雷州半島馬尾藻屬(Sargassum)6常見種進行物種鑒定和系統(tǒng)進化分析。測得6種馬尾藻線粒體COI基因序列,該序列與Gen Bank和BOLD數(shù)據(jù)庫中馬尾藻序列同源性均大于或等于99%,該結果與形態(tài)分類學鑒定結果一致。COI基因序列特征分析表明,6種馬尾藻保守位點421個,變異位點58個,簡約信息位點21個,單一突變位點37個,變異率7.7%,T、C、A、G平均含量分別為39.1%、18.9%、19.1%、22.9%,A+T含量(58.2%)高于C+G含量(41.8%),UUU所編碼的苯丙氨酸(F)使用頻率最高,達12.5%,最大似然法估算的轉換顛換比值為2.42,種間遺傳距離多在0.030±0.0130.100±0.016之間。聚類分析結果與形態(tài)學鑒定、同源性分析結果一致。

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料采集
    1.2 形態(tài)學分類
    1.3 分子生物學鑒定
        1.3.1 基因組DNA提取
        1.3.2 mt DNA-COI序列PCR擴增與測序
        1.3.3 數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
    2.1 形態(tài)學分類與分子鑒定
    2.2 線粒體COI基因片段序列特征分析
    2.3 遺傳距離
    2.4 聚類分析
3 討論



本文編號:3829916

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