目的了解2018年云南省昆明市手足口病病原譜,并對柯薩奇病毒A組6型(coxsackievirus A6, CV-A6)完整VP1區(qū)基因特征進行分析。方法收集2018年云南省昆明市手足口病實驗室監(jiān)測系統(tǒng)采集的兒童病例糞便標(biāo)本757份,對標(biāo)本中腸道病毒(enterovirus, EV)VP1區(qū)基因進行逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和測序。用MEGA 5.2軟件構(gòu)建CV-A6系統(tǒng)進化樹,進行基因特征和分子流行病學(xué)分析。結(jié)果 2018年云南省昆明市手足口病病例中的EV核酸檢測陽性率為11.62%(88/757),其中CV-A4、CV-A6、CV-A10、CV-A16和EV-A71的陽性率依次為0.66%(5/757)、4.89%(37/757)、2.51%(19/757)、0.92%(7/757)和2.38%(18/757),CV-A9和E11的陽性率均為0.13%(1/757)。CV-A6基因進化分析表明,37株CV-A6均為D3亞型,與國內(nèi)報道的結(jié)果一致。結(jié)論 2018年昆明市發(fā)生了以CV-A6為主的手足口病暴發(fā),同時存在CV-A10、CV-A16和EV-A71的共同流行。CV-A6毒株在昆明市...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 標(biāo)本來源
    1.2 方法
        1.2.1 標(biāo)本處理
        1.2.2 病毒RNA提取
        1.2.3 逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)和病毒型別鑒定
        1.2.4 CV-A6病毒VP1區(qū)基因參考序列的選擇
        1.2.5 病毒遺傳系統(tǒng)進化樹分析
2 結(jié) 果
    2.1 病毒血清型的基因鑒定結(jié)果
    2.2 CV-A6云南分離株完整VP1區(qū)基因特征
    2.3 CV-A6各基因型之間的核苷酸和氨基酸差異率
    2.4 昆明CV-A6各分支之間的核苷酸和氨基酸差異率
3 討 論



本文編號：3811752