為了解香蕉MaHY5基因密碼子的使用特性,本研究利用生物信息學工具,分析了香蕉MaHY5基因的密碼子使用偏好性,并分別與其它31個物種的HY5基因以及模式生物基因組進行比較。結果顯示,香蕉MaHY5基因密碼子選擇偏好性弱且偏好以G/C結尾;自然選擇的作用對香蕉MaHY5密碼子偏性影響最大;多數(shù)雙子葉植物HY5密碼子可能偏好A/T結尾,而單子葉植物HY5密碼子可能偏好G/C結尾;基于HY5的CDS序列聚類結果比密碼子使用頻率分類結果更能反映物種間的進化規(guī)律;大腸桿菌原核表達系統(tǒng)更適用于香蕉MaHY5的異源表達試驗,擬南芥可能為香蕉MaHY5轉基因的最為理想受體。本研究分析了香蕉MaHY5基因及其他物種中HY5基因的密碼子偏好性與進化關系,同時篩選最適合MaHY5基因異源表達宿主及遺傳轉化受體,為深入探究MaHY5基因的功能提供理論基礎。

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【文章目錄】：
1 結果與分析
    1.1 香蕉Ma HY5基因的密碼子使用偏好性分析
        1.1.1 香蕉Ma HY5有效密碼子數(shù)及GC含量
        1.1.2 香蕉Ma HY5基因同義密碼子的相對使用頻率
    1.2 不同物種間Ma HY5基因密碼子使用偏好性比較
        1.2.1 HY5基因的ENc、CAI及GC含量分析
        1.2.2 HY5基因CDS序列及RSCU值的相關聚類分析
        1.2.3 HY5基因中性繪圖分析
        1.2.4 HY5基因ENc與GC3值繪圖分析
    1.3 香蕉Ma HY5基因遺傳轉化受體系統(tǒng)選擇
2 討論
    2.1 香蕉Ma HY5密碼子的偏好性
    2.2 香蕉Ma HY5的同源比較
    2.3 香蕉Ma HY5異源表達和遺傳轉化受體系統(tǒng)的選擇
3 材料與方法
    3.1 序列數(shù)據(jù)來源
    3.2 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
作者貢獻



本文編號：3762731