目的關(guān)于異常寡核苷酸結(jié)合折疊域蛋白基因(OBGs)通過(guò)微小染色體維持(MCM)復(fù)合物影響肝細(xì)胞癌DNA復(fù)制起始的報(bào)道較少。文中旨在探討逆轉(zhuǎn)錄相關(guān)基因(RTGs)在肝細(xì)胞癌中的作用及可變剪接和單核苷酸位點(diǎn)變異(SNV)與基因表達(dá)異常的相關(guān)性。方法選取150只潔凈級(jí)昆明小鼠,采用隨機(jī)數(shù)字表法取100只,雙前肢腋下注射對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期肝細(xì)胞癌細(xì)胞株H22等滲鹽水懸液作為H22組,余50只注射0.2 mL不含H22的等滲鹽水作為對(duì)照組。從H22組小鼠中選出成瘤小鼠,解剖取出瘤體,從對(duì)照組小鼠中取健康肝組織。提取H22組和對(duì)照組總RNA,分析差異表達(dá)基因。篩選差異表達(dá)的逆轉(zhuǎn)錄相關(guān)DEGs(RDEGs),對(duì)RDEGs進(jìn)行GO和KEGG分析。對(duì)RDEGs編碼蛋白進(jìn)行互作分析,對(duì)RDEGs多態(tài)性與基因表達(dá)進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果肝細(xì)胞癌中有193個(gè)差異表達(dá)的RTGs,共參與2個(gè)生物學(xué)程序、3個(gè)細(xì)胞組分、1個(gè)分子功能、3個(gè)信號(hào)通路和3個(gè)功能部位;其功能主要集中在DNA復(fù)制,尤其復(fù)制起始中OBGs參與的MCM復(fù)合體及端粒復(fù)合體構(gòu)建。可變剪接分析結(jié)果顯示,4個(gè)RDEGs在基因的3個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了差異表達(dá)的可變剪接,且可變...

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【文章目錄】：
0 引 言
1 材料與方法
    1.1 動(dòng)物模型構(gòu)建及樣本獲取
    1.2 RNA提取和測(cè)序
    1.3 差異表達(dá)基因分析
    1.4 RDEGs的篩選
    1.5 RDEGs的功能分析
    1.6 RDEGs編碼蛋白的互作分析
    1.7 RDEGs多態(tài)性與基因表達(dá)的相關(guān)性分析
    1.8 RT-qPCR驗(yàn)證RDEGs
2 結(jié) 果
    2.1 測(cè)序數(shù)據(jù)
    2.2 RDEGs分析
    2.3 RDEGs的功能分析
    2.4 肝細(xì)胞癌及健康肝組織中的可變剪接和SNV/INDEL
3 討 論



本文編號(hào)：3743161