中間錦雞兒CiNAC036及其擬南芥同源基因的功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-25 03:24
中間錦雞兒分布于干旱和半干旱地區(qū),適應(yīng)干旱和高溫逆境環(huán)境,被廣泛應(yīng)用于固沙,水土保持,具有很高的生態(tài)價(jià)值,是研究抗逆基因的理想材料。NAC轉(zhuǎn)錄因子具有參與逆境脅迫應(yīng)答的功能,本研究通過(guò)PCR擴(kuò)增技術(shù)克隆CiNAC036與AtNAC036兩個(gè)NAC基因,并對(duì)其轉(zhuǎn)基因擬南芥進(jìn)行干旱、鹽以及甘露醇等逆境脅迫處理,探究分析其基因功能。具體的研究結(jié)果如下:1.于中間錦雞兒干旱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中得到一條注釋為NAC基因序列,通過(guò)NCBI中的Blast進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)該基因具有完整的開(kāi)放閱讀框(ORF),且其蛋白序列與擬南芥NAC036一致性達(dá)到74%,因此將該基因命名為CiNA C036。2.克隆CiNA C036基因,基因大小為909bp,編碼302個(gè)氨基酸,其蛋白具有完整的NAC結(jié)構(gòu)域,同時(shí)克隆AtNAC036基因,基因大小為831 bp,編碼276個(gè)氨基酸。3.對(duì)CiNA C036基因的轉(zhuǎn)基因擬南芥進(jìn)行干旱、鹽以及甘露醇等非生物脅迫處理,發(fā)現(xiàn)只有在甘露醇處理后出現(xiàn)響應(yīng)非生物脅迫的表型,對(duì)于干旱和鹽處理,轉(zhuǎn)基因擬南芥未表現(xiàn)出響應(yīng)非生物脅迫的表型。同時(shí)對(duì)其同源擬南芥AtNAC036基因進(jìn)行甘露醇處理,...
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?NAC轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)??Fig.?1?Structure?of?NAC?transcription?factors??
,中間錦雞兒具有良好的再生能力,即使遭受到昆蟲(chóng)及牲畜的啃??食,也能夠在較短的時(shí)間內(nèi)進(jìn)行生長(zhǎng)繁殖??中間錦雞兒對(duì)環(huán)境適應(yīng)性的增強(qiáng)增加了中間錦雞兒自身的生態(tài)價(jià)值和飼草??價(jià)值。人們對(duì)中間錦雞兒抗逆機(jī)制的研究越來(lái)越重視,所報(bào)道的抗逆轉(zhuǎn)錄因子也??隨之增多,例如:NAC轉(zhuǎn)錄因子[37‘?1_]、WRKY轉(zhuǎn)錄因子M??MYB(myeloblastosis)轉(zhuǎn)錄因子[12tM25]和?bHLH(basic?Helix-Loop-?Helix)轉(zhuǎn)錄因子[126_??130]等??A:?|??圖3中間錦雞兒的圖片??Fig.?3?Images?of?Caragana?intermedia??1.2.2中間錦雞兒非生物脅迫耐受性的研究進(jìn)展??中間錦雞兒作為研宄植物抗逆機(jī)制的理想材料m°],其抗逆基因的挖掘也隨??之增多。例如:在中間錦雞兒中,毛銘銖等人發(fā)現(xiàn)a奶?atm轉(zhuǎn)基因擬南芥在經(jīng)??過(guò)干旱處理后,轉(zhuǎn)基因擬南芥株系較野生型相比出現(xiàn)更易萎蔫的現(xiàn)象,檢測(cè)處理??后的株系的丙二醛含量得知轉(zhuǎn)基因株系的丙二醛含量高于野生型,所以通過(guò)此研??宄他們得出a奶認(rèn)F6基因能降低轉(zhuǎn)基因擬南芥對(duì)干旱脅迫的耐受性[13S轉(zhuǎn)??況基因擬南芥減弱了植株對(duì)干旱脅迫的耐受能力,但卻增強(qiáng)了植株對(duì)??ABA的耐受能力[1W;轉(zhuǎn)0_}75基因擬南芥減弱了植株對(duì)鹽的耐受能力,同??時(shí)增強(qiáng)了?ABA對(duì)種子萌發(fā)期間抑制作用[132];劉坤等人發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)aD應(yīng);C基因擬??南芥在經(jīng)過(guò)甘露醇處理后,其丙二醛的含量顯著較野生型低,葉綠素含量顯著較??野生型髙,轉(zhuǎn)基因株系表現(xiàn)出明顯的耐旱表型[133];岳文冉、于秀敏等人發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)??a_PC/B22基因擬南芥在經(jīng)過(guò)鹽、ABA以及甘露醇的
20?中間錦雞兒及其擬南芥同源基因的功能分析???3結(jié)果與分析??3.1?及其擬南芥同源基因的克隆??3.1.1中間錦雞兒0^6基因的克隆??于中間錦雞兒干旱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中得到一條注釋為MC基因序列,通過(guò)??NCBI中的Blast進(jìn)行比對(duì)分析后,發(fā)現(xiàn)該基因具有完整的開(kāi)放閱讀框(ORF),且??其蛋白序列與擬南芥NAC036?—致性達(dá)到58.02%,因此將該基因命名為??aM4C03(5。利用?Primer?5.0?軟件設(shè)計(jì)特異性引物?CiNAC036-F(HA)與?CiNAC036-??R(HA),以中間錦雞兒的cDNA作為模板對(duì)aA^OU(5基因的進(jìn)行克隆,結(jié)果如??圖5所示,其條帶大小為909?bp,編碼302個(gè)氨基酸。??m?■??i〇〇〇bp^—??750bp??■l??圖5中間錦雞兒OA^aW(5基因cDNA的克隆??Fig.5?The?cDNAcloning?of?CiNAC036?from?C.intermedia??注:圖中1、2均代表同一?PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;M:?DL?2000?bp?DNAmarker??3.1.2同源擬南芥基因的克隆??為了進(jìn)一步確定基因的功能不是由于其在擬南芥中異源表達(dá)導(dǎo)致的,我們從??Tair(https://www.arabidopsis.org/)中查找得到?CViV/4C03(5?的同源基因?的??序列,利用Primer?5.0軟件設(shè)計(jì)特異性引物AtNAC036-F(HA)與AtNAC036-R(HA),??以擬南芥野生型(Col-O)cDNA為模板對(duì)基因進(jìn)行克隆,結(jié)果如圖6所??示,其條帶大小為831?bp,編碼276個(gè)氨基酸。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]毛竹bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及其在干旱和鹽脅迫條件下的表達(dá)分析[J]. 徐秀榮,楊克彬,王思寧,高志民. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]轉(zhuǎn)錄因子DREB、ERF和NAC在介導(dǎo)植物響應(yīng)生物和非生物脅迫中的作用[J]. 文錦芬,趙凱,鄧明華. 湖南生態(tài)科學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[3]花生AhbHLH63基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 崔維佩,谷朝陽(yáng),唐桂英,徐平麗,柳展基,單雷. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[4]WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫抗逆育種中的應(yīng)用[J]. 司愛(ài)君,陳紅,余渝,孔憲輝,劉麗,王旭文,田琴. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(16)
[5]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能[J]. 張慧珍,白雪芹,曾幼玲. 植物生理學(xué)報(bào). 2019(07)
[6]西洋參bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析[J]. 閆艷,王希,周珂輝,李紀(jì)冬,韓鵬,邸鵬. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[7]MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫中的研究進(jìn)展[J]. 關(guān)淑艷,焦鵬,蔣振忠,齊拙,夏海豐,曲靜,馬義勇. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[8]蒺藜苜蓿MtbHLH148轉(zhuǎn)錄因子的克隆與轉(zhuǎn)化及其功能分析[J]. 王菊萍,王珍,張鐵軍,龍瑞才,楊青川,康俊梅. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(06)
[9]煙草‘云煙87’葉片衰老中WRKY轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)及功能預(yù)測(cè)[J]. 張柳,何曉健,林春,李軍營(yíng),楊煥文,毛自朝. 分子植物育種. 2019(08)
[10]植物WRKY類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子在非生物脅迫下的功能與作用機(jī)制[J]. 戚瑩雪,王蕾,王堯堯,蒲高斌,劉謙,張永清. 分子植物育種. 2019(18)
博士論文
[1]檸條錦雞兒與中間錦雞兒中4個(gè)E3泛素連接酶基因的功能分析[D]. 岳文冉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]中間錦雞兒瞬時(shí)表達(dá)體系的建立及AP2/ERF基因家族的鑒定、分析和功能研究[D]. 劉坤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]中間錦雞兒WRKY基因家族的鑒定及兩個(gè)CiWRKYs基因功能的研究[D]. 萬(wàn)永青.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]中間錦雞兒響應(yīng)脫水脅迫的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究及部分次生代謝相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 王光霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]水稻ONAC家族基因重疊表達(dá)特性及其在抗病抗逆中的功能研究[D]. 孫利軍.浙江大學(xué) 2012
[6]水稻葉片響應(yīng)干旱和滲透脅迫的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 舒烈波.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[7]大豆MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其表達(dá)研究[D]. 楊文杰.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]中間錦雞兒CiCPK32基因的克隆與功能分析[D]. 牛俊美.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]中間錦雞兒3個(gè)DUF基因的生物信息學(xué)分析和CiDUF966-1基因功能分析[D]. 楊天瑞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]中間錦雞兒參與葉片衰老基因CibHLH027的克隆和功能研究[D]. 李娜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]中間錦雞兒兩個(gè)WRKY基因的功能分析[D]. 毛銘銖.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]植物L(fēng)EA基因家族的分子進(jìn)化研究和一擬南芥非典型LEA基因功能的初步分析[D]. 李翔.江蘇大學(xué) 2016
[6]中間錦雞兒干旱脅迫下的葉片全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建[D]. 吳葉寧.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]大豆誘導(dǎo)型NAC轉(zhuǎn)錄因子基因啟動(dòng)子克隆及功能研究[D]. 楊丹.山東大學(xué) 2015
[8]亞洲棉NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析及相關(guān)NAC基因的克隆和功能研究[D]. 王中娜.西南大學(xué) 2015
[9]擬南芥LEA7基因功能的研究[D]. 孫娜娜.河南大學(xué) 2013
[10]玉米WRKY家族轉(zhuǎn)錄因子基因ZmWRKY33的克隆及功能分析[D]. 黎華.揚(yáng)州大學(xué) 2011
本文編號(hào):3517305
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?NAC轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)??Fig.?1?Structure?of?NAC?transcription?factors??
,中間錦雞兒具有良好的再生能力,即使遭受到昆蟲(chóng)及牲畜的啃??食,也能夠在較短的時(shí)間內(nèi)進(jìn)行生長(zhǎng)繁殖??中間錦雞兒對(duì)環(huán)境適應(yīng)性的增強(qiáng)增加了中間錦雞兒自身的生態(tài)價(jià)值和飼草??價(jià)值。人們對(duì)中間錦雞兒抗逆機(jī)制的研究越來(lái)越重視,所報(bào)道的抗逆轉(zhuǎn)錄因子也??隨之增多,例如:NAC轉(zhuǎn)錄因子[37‘?1_]、WRKY轉(zhuǎn)錄因子M??MYB(myeloblastosis)轉(zhuǎn)錄因子[12tM25]和?bHLH(basic?Helix-Loop-?Helix)轉(zhuǎn)錄因子[126_??130]等??A:?|??圖3中間錦雞兒的圖片??Fig.?3?Images?of?Caragana?intermedia??1.2.2中間錦雞兒非生物脅迫耐受性的研究進(jìn)展??中間錦雞兒作為研宄植物抗逆機(jī)制的理想材料m°],其抗逆基因的挖掘也隨??之增多。例如:在中間錦雞兒中,毛銘銖等人發(fā)現(xiàn)a奶?atm轉(zhuǎn)基因擬南芥在經(jīng)??過(guò)干旱處理后,轉(zhuǎn)基因擬南芥株系較野生型相比出現(xiàn)更易萎蔫的現(xiàn)象,檢測(cè)處理??后的株系的丙二醛含量得知轉(zhuǎn)基因株系的丙二醛含量高于野生型,所以通過(guò)此研??宄他們得出a奶認(rèn)F6基因能降低轉(zhuǎn)基因擬南芥對(duì)干旱脅迫的耐受性[13S轉(zhuǎn)??況基因擬南芥減弱了植株對(duì)干旱脅迫的耐受能力,但卻增強(qiáng)了植株對(duì)??ABA的耐受能力[1W;轉(zhuǎn)0_}75基因擬南芥減弱了植株對(duì)鹽的耐受能力,同??時(shí)增強(qiáng)了?ABA對(duì)種子萌發(fā)期間抑制作用[132];劉坤等人發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)aD應(yīng);C基因擬??南芥在經(jīng)過(guò)甘露醇處理后,其丙二醛的含量顯著較野生型低,葉綠素含量顯著較??野生型髙,轉(zhuǎn)基因株系表現(xiàn)出明顯的耐旱表型[133];岳文冉、于秀敏等人發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)??a_PC/B22基因擬南芥在經(jīng)過(guò)鹽、ABA以及甘露醇的
20?中間錦雞兒及其擬南芥同源基因的功能分析???3結(jié)果與分析??3.1?及其擬南芥同源基因的克隆??3.1.1中間錦雞兒0^6基因的克隆??于中間錦雞兒干旱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中得到一條注釋為MC基因序列,通過(guò)??NCBI中的Blast進(jìn)行比對(duì)分析后,發(fā)現(xiàn)該基因具有完整的開(kāi)放閱讀框(ORF),且??其蛋白序列與擬南芥NAC036?—致性達(dá)到58.02%,因此將該基因命名為??aM4C03(5。利用?Primer?5.0?軟件設(shè)計(jì)特異性引物?CiNAC036-F(HA)與?CiNAC036-??R(HA),以中間錦雞兒的cDNA作為模板對(duì)aA^OU(5基因的進(jìn)行克隆,結(jié)果如??圖5所示,其條帶大小為909?bp,編碼302個(gè)氨基酸。??m?■??i〇〇〇bp^—??750bp??■l??圖5中間錦雞兒OA^aW(5基因cDNA的克隆??Fig.5?The?cDNAcloning?of?CiNAC036?from?C.intermedia??注:圖中1、2均代表同一?PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;M:?DL?2000?bp?DNAmarker??3.1.2同源擬南芥基因的克隆??為了進(jìn)一步確定基因的功能不是由于其在擬南芥中異源表達(dá)導(dǎo)致的,我們從??Tair(https://www.arabidopsis.org/)中查找得到?CViV/4C03(5?的同源基因?的??序列,利用Primer?5.0軟件設(shè)計(jì)特異性引物AtNAC036-F(HA)與AtNAC036-R(HA),??以擬南芥野生型(Col-O)cDNA為模板對(duì)基因進(jìn)行克隆,結(jié)果如圖6所??示,其條帶大小為831?bp,編碼276個(gè)氨基酸。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]毛竹bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及其在干旱和鹽脅迫條件下的表達(dá)分析[J]. 徐秀榮,楊克彬,王思寧,高志民. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]轉(zhuǎn)錄因子DREB、ERF和NAC在介導(dǎo)植物響應(yīng)生物和非生物脅迫中的作用[J]. 文錦芬,趙凱,鄧明華. 湖南生態(tài)科學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[3]花生AhbHLH63基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 崔維佩,谷朝陽(yáng),唐桂英,徐平麗,柳展基,單雷. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(09)
[4]WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫抗逆育種中的應(yīng)用[J]. 司愛(ài)君,陳紅,余渝,孔憲輝,劉麗,王旭文,田琴. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(16)
[5]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能[J]. 張慧珍,白雪芹,曾幼玲. 植物生理學(xué)報(bào). 2019(07)
[6]西洋參bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析[J]. 閆艷,王希,周珂輝,李紀(jì)冬,韓鵬,邸鵬. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[7]MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫中的研究進(jìn)展[J]. 關(guān)淑艷,焦鵬,蔣振忠,齊拙,夏海豐,曲靜,馬義勇. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(03)
[8]蒺藜苜蓿MtbHLH148轉(zhuǎn)錄因子的克隆與轉(zhuǎn)化及其功能分析[J]. 王菊萍,王珍,張鐵軍,龍瑞才,楊青川,康俊梅. 西北植物學(xué)報(bào). 2019(06)
[9]煙草‘云煙87’葉片衰老中WRKY轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)及功能預(yù)測(cè)[J]. 張柳,何曉健,林春,李軍營(yíng),楊煥文,毛自朝. 分子植物育種. 2019(08)
[10]植物WRKY類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子在非生物脅迫下的功能與作用機(jī)制[J]. 戚瑩雪,王蕾,王堯堯,蒲高斌,劉謙,張永清. 分子植物育種. 2019(18)
博士論文
[1]檸條錦雞兒與中間錦雞兒中4個(gè)E3泛素連接酶基因的功能分析[D]. 岳文冉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]中間錦雞兒瞬時(shí)表達(dá)體系的建立及AP2/ERF基因家族的鑒定、分析和功能研究[D]. 劉坤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]中間錦雞兒WRKY基因家族的鑒定及兩個(gè)CiWRKYs基因功能的研究[D]. 萬(wàn)永青.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]中間錦雞兒響應(yīng)脫水脅迫的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究及部分次生代謝相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 王光霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]水稻ONAC家族基因重疊表達(dá)特性及其在抗病抗逆中的功能研究[D]. 孫利軍.浙江大學(xué) 2012
[6]水稻葉片響應(yīng)干旱和滲透脅迫的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 舒烈波.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[7]大豆MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其表達(dá)研究[D]. 楊文杰.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]中間錦雞兒CiCPK32基因的克隆與功能分析[D]. 牛俊美.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]中間錦雞兒3個(gè)DUF基因的生物信息學(xué)分析和CiDUF966-1基因功能分析[D]. 楊天瑞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]中間錦雞兒參與葉片衰老基因CibHLH027的克隆和功能研究[D]. 李娜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]中間錦雞兒兩個(gè)WRKY基因的功能分析[D]. 毛銘銖.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]植物L(fēng)EA基因家族的分子進(jìn)化研究和一擬南芥非典型LEA基因功能的初步分析[D]. 李翔.江蘇大學(xué) 2016
[6]中間錦雞兒干旱脅迫下的葉片全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建[D]. 吳葉寧.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]大豆誘導(dǎo)型NAC轉(zhuǎn)錄因子基因啟動(dòng)子克隆及功能研究[D]. 楊丹.山東大學(xué) 2015
[8]亞洲棉NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)分析及相關(guān)NAC基因的克隆和功能研究[D]. 王中娜.西南大學(xué) 2015
[9]擬南芥LEA7基因功能的研究[D]. 孫娜娜.河南大學(xué) 2013
[10]玉米WRKY家族轉(zhuǎn)錄因子基因ZmWRKY33的克隆及功能分析[D]. 黎華.揚(yáng)州大學(xué) 2011
本文編號(hào):3517305
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3517305.html
最近更新
教材專(zhuān)著