中間錦雞兒CiNAC036及其擬南芥同源基因的功能分析
發(fā)布時間:2021-11-25 03:24
中間錦雞兒分布于干旱和半干旱地區(qū),適應干旱和高溫逆境環(huán)境,被廣泛應用于固沙,水土保持,具有很高的生態(tài)價值,是研究抗逆基因的理想材料。NAC轉錄因子具有參與逆境脅迫應答的功能,本研究通過PCR擴增技術克隆CiNAC036與AtNAC036兩個NAC基因,并對其轉基因擬南芥進行干旱、鹽以及甘露醇等逆境脅迫處理,探究分析其基因功能。具體的研究結果如下:1.于中間錦雞兒干旱轉錄組數(shù)據(jù)庫中得到一條注釋為NAC基因序列,通過NCBI中的Blast進行比對,發(fā)現(xiàn)該基因具有完整的開放閱讀框(ORF),且其蛋白序列與擬南芥NAC036一致性達到74%,因此將該基因命名為CiNA C036。2.克隆CiNA C036基因,基因大小為909bp,編碼302個氨基酸,其蛋白具有完整的NAC結構域,同時克隆AtNAC036基因,基因大小為831 bp,編碼276個氨基酸。3.對CiNA C036基因的轉基因擬南芥進行干旱、鹽以及甘露醇等非生物脅迫處理,發(fā)現(xiàn)只有在甘露醇處理后出現(xiàn)響應非生物脅迫的表型,對于干旱和鹽處理,轉基因擬南芥未表現(xiàn)出響應非生物脅迫的表型。同時對其同源擬南芥AtNAC036基因進行甘露醇處理,...
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?NAC轉錄因子的結構??Fig.?1?Structure?of?NAC?transcription?factors??
,中間錦雞兒具有良好的再生能力,即使遭受到昆蟲及牲畜的啃??食,也能夠在較短的時間內(nèi)進行生長繁殖??中間錦雞兒對環(huán)境適應性的增強增加了中間錦雞兒自身的生態(tài)價值和飼草??價值。人們對中間錦雞兒抗逆機制的研究越來越重視,所報道的抗逆轉錄因子也??隨之增多,例如:NAC轉錄因子[37‘?1_]、WRKY轉錄因子M??MYB(myeloblastosis)轉錄因子[12tM25]和?bHLH(basic?Helix-Loop-?Helix)轉錄因子[126_??130]等??A:?|??圖3中間錦雞兒的圖片??Fig.?3?Images?of?Caragana?intermedia??1.2.2中間錦雞兒非生物脅迫耐受性的研究進展??中間錦雞兒作為研宄植物抗逆機制的理想材料m°],其抗逆基因的挖掘也隨??之增多。例如:在中間錦雞兒中,毛銘銖等人發(fā)現(xiàn)a奶?atm轉基因擬南芥在經(jīng)??過干旱處理后,轉基因擬南芥株系較野生型相比出現(xiàn)更易萎蔫的現(xiàn)象,檢測處理??后的株系的丙二醛含量得知轉基因株系的丙二醛含量高于野生型,所以通過此研??宄他們得出a奶認F6基因能降低轉基因擬南芥對干旱脅迫的耐受性[13S轉??況基因擬南芥減弱了植株對干旱脅迫的耐受能力,但卻增強了植株對??ABA的耐受能力[1W;轉0_}75基因擬南芥減弱了植株對鹽的耐受能力,同??時增強了?ABA對種子萌發(fā)期間抑制作用[132];劉坤等人發(fā)現(xiàn)轉aD應;C基因擬??南芥在經(jīng)過甘露醇處理后,其丙二醛的含量顯著較野生型低,葉綠素含量顯著較??野生型髙,轉基因株系表現(xiàn)出明顯的耐旱表型[133];岳文冉、于秀敏等人發(fā)現(xiàn)轉??a_PC/B22基因擬南芥在經(jīng)過鹽、ABA以及甘露醇的
20?中間錦雞兒及其擬南芥同源基因的功能分析???3結果與分析??3.1?及其擬南芥同源基因的克隆??3.1.1中間錦雞兒0^6基因的克隆??于中間錦雞兒干旱轉錄組數(shù)據(jù)庫中得到一條注釋為MC基因序列,通過??NCBI中的Blast進行比對分析后,發(fā)現(xiàn)該基因具有完整的開放閱讀框(ORF),且??其蛋白序列與擬南芥NAC036?—致性達到58.02%,因此將該基因命名為??aM4C03(5。利用?Primer?5.0?軟件設計特異性引物?CiNAC036-F(HA)與?CiNAC036-??R(HA),以中間錦雞兒的cDNA作為模板對aA^OU(5基因的進行克隆,結果如??圖5所示,其條帶大小為909?bp,編碼302個氨基酸。??m?■??i〇〇〇bp^—??750bp??■l??圖5中間錦雞兒OA^aW(5基因cDNA的克隆??Fig.5?The?cDNAcloning?of?CiNAC036?from?C.intermedia??注:圖中1、2均代表同一?PCR擴增產(chǎn)物;M:?DL?2000?bp?DNAmarker??3.1.2同源擬南芥基因的克隆??為了進一步確定基因的功能不是由于其在擬南芥中異源表達導致的,我們從??Tair(https://www.arabidopsis.org/)中查找得到?CViV/4C03(5?的同源基因?的??序列,利用Primer?5.0軟件設計特異性引物AtNAC036-F(HA)與AtNAC036-R(HA),??以擬南芥野生型(Col-O)cDNA為模板對基因進行克隆,結果如圖6所??示,其條帶大小為831?bp,編碼276個氨基酸。??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]毛竹bHLH轉錄因子的鑒定及其在干旱和鹽脅迫條件下的表達分析[J]. 徐秀榮,楊克彬,王思寧,高志民. 植物科學學報. 2019(05)
[2]轉錄因子DREB、ERF和NAC在介導植物響應生物和非生物脅迫中的作用[J]. 文錦芬,趙凱,鄧明華. 湖南生態(tài)科學學報. 2019(03)
[3]花生AhbHLH63基因的克隆與表達分析[J]. 崔維佩,谷朝陽,唐桂英,徐平麗,柳展基,單雷. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2019(09)
[4]WRKY轉錄因子在植物非生物脅迫抗逆育種中的應用[J]. 司愛君,陳紅,余渝,孔憲輝,劉麗,王旭文,田琴. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2019(16)
[5]植物NAC轉錄因子的生物學功能[J]. 張慧珍,白雪芹,曾幼玲. 植物生理學報. 2019(07)
[6]西洋參bHLH轉錄因子家族生物信息學分析[J]. 閆艷,王希,周珂輝,李紀冬,韓鵬,邸鵬. 吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(03)
[7]MYB轉錄因子在植物非生物脅迫中的研究進展[J]. 關淑艷,焦鵬,蔣振忠,齊拙,夏海豐,曲靜,馬義勇. 吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(03)
[8]蒺藜苜蓿MtbHLH148轉錄因子的克隆與轉化及其功能分析[J]. 王菊萍,王珍,張鐵軍,龍瑞才,楊青川,康俊梅. 西北植物學報. 2019(06)
[9]煙草‘云煙87’葉片衰老中WRKY轉錄因子的表達及功能預測[J]. 張柳,何曉健,林春,李軍營,楊煥文,毛自朝. 分子植物育種. 2019(08)
[10]植物WRKY類轉錄因子在非生物脅迫下的功能與作用機制[J]. 戚瑩雪,王蕾,王堯堯,蒲高斌,劉謙,張永清. 分子植物育種. 2019(18)
博士論文
[1]檸條錦雞兒與中間錦雞兒中4個E3泛素連接酶基因的功能分析[D]. 岳文冉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]中間錦雞兒瞬時表達體系的建立及AP2/ERF基因家族的鑒定、分析和功能研究[D]. 劉坤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]中間錦雞兒WRKY基因家族的鑒定及兩個CiWRKYs基因功能的研究[D]. 萬永青.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[4]中間錦雞兒響應脫水脅迫的轉錄組學研究及部分次生代謝相關基因的表達分析[D]. 王光霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]水稻ONAC家族基因重疊表達特性及其在抗病抗逆中的功能研究[D]. 孫利軍.浙江大學 2012
[6]水稻葉片響應干旱和滲透脅迫的蛋白質(zhì)組學研究[D]. 舒烈波.華中農(nóng)業(yè)大學 2010
[7]大豆MYB轉錄因子基因的克隆及其表達研究[D]. 楊文杰.四川農(nóng)業(yè)大學 2007
碩士論文
[1]中間錦雞兒CiCPK32基因的克隆與功能分析[D]. ?∶.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]中間錦雞兒3個DUF基因的生物信息學分析和CiDUF966-1基因功能分析[D]. 楊天瑞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]中間錦雞兒參與葉片衰老基因CibHLH027的克隆和功能研究[D]. 李娜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]中間錦雞兒兩個WRKY基因的功能分析[D]. 毛銘銖.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[5]植物LEA基因家族的分子進化研究和一擬南芥非典型LEA基因功能的初步分析[D]. 李翔.江蘇大學 2016
[6]中間錦雞兒干旱脅迫下的葉片全長cDNA文庫構建[D]. 吳葉寧.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[7]大豆誘導型NAC轉錄因子基因啟動子克隆及功能研究[D]. 楊丹.山東大學 2015
[8]亞洲棉NAC轉錄因子家族的生物信息學分析及相關NAC基因的克隆和功能研究[D]. 王中娜.西南大學 2015
[9]擬南芥LEA7基因功能的研究[D]. 孫娜娜.河南大學 2013
[10]玉米WRKY家族轉錄因子基因ZmWRKY33的克隆及功能分析[D]. 黎華.揚州大學 2011
本文編號:3517305
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?NAC轉錄因子的結構??Fig.?1?Structure?of?NAC?transcription?factors??
,中間錦雞兒具有良好的再生能力,即使遭受到昆蟲及牲畜的啃??食,也能夠在較短的時間內(nèi)進行生長繁殖??中間錦雞兒對環(huán)境適應性的增強增加了中間錦雞兒自身的生態(tài)價值和飼草??價值。人們對中間錦雞兒抗逆機制的研究越來越重視,所報道的抗逆轉錄因子也??隨之增多,例如:NAC轉錄因子[37‘?1_]、WRKY轉錄因子M??MYB(myeloblastosis)轉錄因子[12tM25]和?bHLH(basic?Helix-Loop-?Helix)轉錄因子[126_??130]等??A:?|??圖3中間錦雞兒的圖片??Fig.?3?Images?of?Caragana?intermedia??1.2.2中間錦雞兒非生物脅迫耐受性的研究進展??中間錦雞兒作為研宄植物抗逆機制的理想材料m°],其抗逆基因的挖掘也隨??之增多。例如:在中間錦雞兒中,毛銘銖等人發(fā)現(xiàn)a奶?atm轉基因擬南芥在經(jīng)??過干旱處理后,轉基因擬南芥株系較野生型相比出現(xiàn)更易萎蔫的現(xiàn)象,檢測處理??后的株系的丙二醛含量得知轉基因株系的丙二醛含量高于野生型,所以通過此研??宄他們得出a奶認F6基因能降低轉基因擬南芥對干旱脅迫的耐受性[13S轉??況基因擬南芥減弱了植株對干旱脅迫的耐受能力,但卻增強了植株對??ABA的耐受能力[1W;轉0_}75基因擬南芥減弱了植株對鹽的耐受能力,同??時增強了?ABA對種子萌發(fā)期間抑制作用[132];劉坤等人發(fā)現(xiàn)轉aD應;C基因擬??南芥在經(jīng)過甘露醇處理后,其丙二醛的含量顯著較野生型低,葉綠素含量顯著較??野生型髙,轉基因株系表現(xiàn)出明顯的耐旱表型[133];岳文冉、于秀敏等人發(fā)現(xiàn)轉??a_PC/B22基因擬南芥在經(jīng)過鹽、ABA以及甘露醇的
20?中間錦雞兒及其擬南芥同源基因的功能分析???3結果與分析??3.1?及其擬南芥同源基因的克隆??3.1.1中間錦雞兒0^6基因的克隆??于中間錦雞兒干旱轉錄組數(shù)據(jù)庫中得到一條注釋為MC基因序列,通過??NCBI中的Blast進行比對分析后,發(fā)現(xiàn)該基因具有完整的開放閱讀框(ORF),且??其蛋白序列與擬南芥NAC036?—致性達到58.02%,因此將該基因命名為??aM4C03(5。利用?Primer?5.0?軟件設計特異性引物?CiNAC036-F(HA)與?CiNAC036-??R(HA),以中間錦雞兒的cDNA作為模板對aA^OU(5基因的進行克隆,結果如??圖5所示,其條帶大小為909?bp,編碼302個氨基酸。??m?■??i〇〇〇bp^—??750bp??■l??圖5中間錦雞兒OA^aW(5基因cDNA的克隆??Fig.5?The?cDNAcloning?of?CiNAC036?from?C.intermedia??注:圖中1、2均代表同一?PCR擴增產(chǎn)物;M:?DL?2000?bp?DNAmarker??3.1.2同源擬南芥基因的克隆??為了進一步確定基因的功能不是由于其在擬南芥中異源表達導致的,我們從??Tair(https://www.arabidopsis.org/)中查找得到?CViV/4C03(5?的同源基因?的??序列,利用Primer?5.0軟件設計特異性引物AtNAC036-F(HA)與AtNAC036-R(HA),??以擬南芥野生型(Col-O)cDNA為模板對基因進行克隆,結果如圖6所??示,其條帶大小為831?bp,編碼276個氨基酸。??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]毛竹bHLH轉錄因子的鑒定及其在干旱和鹽脅迫條件下的表達分析[J]. 徐秀榮,楊克彬,王思寧,高志民. 植物科學學報. 2019(05)
[2]轉錄因子DREB、ERF和NAC在介導植物響應生物和非生物脅迫中的作用[J]. 文錦芬,趙凱,鄧明華. 湖南生態(tài)科學學報. 2019(03)
[3]花生AhbHLH63基因的克隆與表達分析[J]. 崔維佩,谷朝陽,唐桂英,徐平麗,柳展基,單雷. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2019(09)
[4]WRKY轉錄因子在植物非生物脅迫抗逆育種中的應用[J]. 司愛君,陳紅,余渝,孔憲輝,劉麗,王旭文,田琴. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2019(16)
[5]植物NAC轉錄因子的生物學功能[J]. 張慧珍,白雪芹,曾幼玲. 植物生理學報. 2019(07)
[6]西洋參bHLH轉錄因子家族生物信息學分析[J]. 閆艷,王希,周珂輝,李紀冬,韓鵬,邸鵬. 吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(03)
[7]MYB轉錄因子在植物非生物脅迫中的研究進展[J]. 關淑艷,焦鵬,蔣振忠,齊拙,夏海豐,曲靜,馬義勇. 吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(03)
[8]蒺藜苜蓿MtbHLH148轉錄因子的克隆與轉化及其功能分析[J]. 王菊萍,王珍,張鐵軍,龍瑞才,楊青川,康俊梅. 西北植物學報. 2019(06)
[9]煙草‘云煙87’葉片衰老中WRKY轉錄因子的表達及功能預測[J]. 張柳,何曉健,林春,李軍營,楊煥文,毛自朝. 分子植物育種. 2019(08)
[10]植物WRKY類轉錄因子在非生物脅迫下的功能與作用機制[J]. 戚瑩雪,王蕾,王堯堯,蒲高斌,劉謙,張永清. 分子植物育種. 2019(18)
博士論文
[1]檸條錦雞兒與中間錦雞兒中4個E3泛素連接酶基因的功能分析[D]. 岳文冉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]中間錦雞兒瞬時表達體系的建立及AP2/ERF基因家族的鑒定、分析和功能研究[D]. 劉坤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]中間錦雞兒WRKY基因家族的鑒定及兩個CiWRKYs基因功能的研究[D]. 萬永青.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[4]中間錦雞兒響應脫水脅迫的轉錄組學研究及部分次生代謝相關基因的表達分析[D]. 王光霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[5]水稻ONAC家族基因重疊表達特性及其在抗病抗逆中的功能研究[D]. 孫利軍.浙江大學 2012
[6]水稻葉片響應干旱和滲透脅迫的蛋白質(zhì)組學研究[D]. 舒烈波.華中農(nóng)業(yè)大學 2010
[7]大豆MYB轉錄因子基因的克隆及其表達研究[D]. 楊文杰.四川農(nóng)業(yè)大學 2007
碩士論文
[1]中間錦雞兒CiCPK32基因的克隆與功能分析[D]. ?∶.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]中間錦雞兒3個DUF基因的生物信息學分析和CiDUF966-1基因功能分析[D]. 楊天瑞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]中間錦雞兒參與葉片衰老基因CibHLH027的克隆和功能研究[D]. 李娜.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[4]中間錦雞兒兩個WRKY基因的功能分析[D]. 毛銘銖.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[5]植物LEA基因家族的分子進化研究和一擬南芥非典型LEA基因功能的初步分析[D]. 李翔.江蘇大學 2016
[6]中間錦雞兒干旱脅迫下的葉片全長cDNA文庫構建[D]. 吳葉寧.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[7]大豆誘導型NAC轉錄因子基因啟動子克隆及功能研究[D]. 楊丹.山東大學 2015
[8]亞洲棉NAC轉錄因子家族的生物信息學分析及相關NAC基因的克隆和功能研究[D]. 王中娜.西南大學 2015
[9]擬南芥LEA7基因功能的研究[D]. 孫娜娜.河南大學 2013
[10]玉米WRKY家族轉錄因子基因ZmWRKY33的克隆及功能分析[D]. 黎華.揚州大學 2011
本文編號:3517305
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