目的:探討模型小鼠肝細(xì)胞癌組織（TM）內(nèi)差異表達(dá)的外泌體來源RNA剪接基因（exosome-derived RNAsplicing-related DEGs,ERDs）的變化圖譜及AS、SNV和INDEL與基因表達(dá)的關(guān)系。方法:以健康小鼠肝組織（生理微環(huán)境,PM）、模型小鼠無瘤體肝組織（細(xì)胞癌前微環(huán)境,PTM）和模型小鼠肝細(xì)胞癌組織（腫瘤微環(huán)境,TM）為材料,分別提取各組樣本中的總RNA進(jìn)行RNA-seq和生物信息學(xué)分析,并通過RT-qPCR驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果。結(jié)果:與PTM比較,TM中有158個(gè)高表達(dá)的ERDs;與PM比較,TM中有141個(gè)高表達(dá)的ERDs;兩類對(duì)比樣本中有21個(gè)相同的ERDs在TM中高表達(dá)。這21個(gè)ERDs主要參與了4個(gè)生物學(xué)過程（BP）、5個(gè)細(xì)胞組分（CC）、2個(gè)分子功能（MF）和1個(gè)信號(hào)通路（KEGG pathway）。其功能主要富集在剪接體的功能上,尤其是在剪接體執(zhí)行剪接過程中ploy（A）RNA結(jié)合、核來源的第二步剪接小體的催化作用以及剪接體snRNP組裝。結(jié)論:TM中高表達(dá)的ERDs主要通過poly（A）RNA結(jié)合異常,介導(dǎo)錯(cuò)誤的RNA剪接和剪接體snRNP組裝... 

【文章來源】：贛南醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2020,40(09)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

ERDs的功能

ERDs參與剪接體的過程（紅星表示該基因在TM中表達(dá)上調(diào)）

ERDs編碼蛋白的互作關(guān)系

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3516360