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茶樹(shù)脂肪酸去飽和酶家族基因的克隆與表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-21 22:03
  以茶樹(shù)品種‘鐵觀音’為試材,利用RT-PCR技術(shù)克隆得到5個(gè)脂肪酸去飽和酶(fatty acid desaturase,FAD)家族基因的cDNA序列,分別命名為Cs FAD2-2、CsFAD3、Δ7-CsFAD、Δ8-CsFAD和CsFAB2,其編碼序列長(zhǎng)度1 137~1 320 bp。系統(tǒng)發(fā)育與基序分析結(jié)果表明,茶樹(shù)FAD成員來(lái)自4個(gè)亞家族,即ω3/ω6-FAD亞家族、Δ7/Δ9-FAD亞家族、FrontendFAD亞家族和FAB亞家族。同一亞家族成員的保守基序一致,而不同亞家族的保守基序存在較大不同。熒光定量PCR結(jié)果表明,5個(gè)CsFAD家族基因都顯著響應(yīng)低溫誘導(dǎo),Δ8-CsFAD對(duì)低溫脅迫響應(yīng)最強(qiáng)烈,表達(dá)水平上調(diào)千倍;外源ABA處理后,除CsFAD3外,其他4個(gè)CsFAD基因的表達(dá)均上調(diào)2倍以上;干旱脅迫下,5個(gè)Cs FAD中CsFAD2-2、Δ7-CsFAD和Δ8-CsFAD表達(dá)水平都上調(diào)1.5倍以上,其中Δ8-CsFAD的表達(dá)上調(diào)最大,達(dá)5.5倍,而CsFAD3和CsFAB2的表達(dá)受到干旱處理抑制顯著下調(diào)?寺〔⒎治靓8-CsFAD啟動(dòng)子,發(fā)現(xiàn)存在多種與逆境脅迫響應(yīng)相關(guān)的順... 

【文章來(lái)源】:園藝學(xué)報(bào). 2020,47(06)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)

【部分圖文】:

茶樹(shù)脂肪酸去飽和酶家族基因的克隆與表達(dá)分析


5個(gè)CsFAD基因的擴(kuò)增

蛋白,基序,家族,同屬


通過(guò)MEME在線程序?qū)?個(gè)茶樹(shù)FAD家族成員與其同源的擬南芥FAD成員進(jìn)行保守基序分析。如圖3所示,同一亞家族的FAD成員間保守基序完全一致,而不同亞家族的保守基序存在較大不同。其中,同屬于ω3/ω6-FAD亞家族的Cs FAD2-2、Cs FAD3、AtFAD2a和AtFAD3a存在相同5個(gè)保守基序(基序1、2、3、4和5);同屬于Δ7/Δ9-FAD亞家族的Δ7-CsFAD和AtFAD5存在相同3個(gè)保守基序(基序1、5和6);同屬于Front end FAD亞家族的Δ8-CsFAD和AtSLD1.2存在相同的基序2和基序7;同屬于FAB亞家族的CsFAB2和AtFAB2.1存在相同的基序7和基序8。這些特異的保守基序暗示不同的FAD亞家族成員在植物中發(fā)揮不同的功能。圖3 CsFAD蛋白的保守基序分析

蛋白,基序


CsFAD蛋白的保守基序分析

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3510334

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