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茶樹脂肪酸去飽和酶家族基因的克隆與表達分析

發(fā)布時間:2021-11-21 22:03
  以茶樹品種‘鐵觀音’為試材,利用RT-PCR技術克隆得到5個脂肪酸去飽和酶(fatty acid desaturase,FAD)家族基因的cDNA序列,分別命名為Cs FAD2-2、CsFAD3、Δ7-CsFAD、Δ8-CsFAD和CsFAB2,其編碼序列長度1 137~1 320 bp。系統(tǒng)發(fā)育與基序分析結果表明,茶樹FAD成員來自4個亞家族,即ω3/ω6-FAD亞家族、Δ7/Δ9-FAD亞家族、FrontendFAD亞家族和FAB亞家族。同一亞家族成員的保守基序一致,而不同亞家族的保守基序存在較大不同。熒光定量PCR結果表明,5個CsFAD家族基因都顯著響應低溫誘導,Δ8-CsFAD對低溫脅迫響應最強烈,表達水平上調(diào)千倍;外源ABA處理后,除CsFAD3外,其他4個CsFAD基因的表達均上調(diào)2倍以上;干旱脅迫下,5個Cs FAD中CsFAD2-2、Δ7-CsFAD和Δ8-CsFAD表達水平都上調(diào)1.5倍以上,其中Δ8-CsFAD的表達上調(diào)最大,達5.5倍,而CsFAD3和CsFAB2的表達受到干旱處理抑制顯著下調(diào)?寺〔⒎治靓8-CsFAD啟動子,發(fā)現(xiàn)存在多種與逆境脅迫響應相關的順... 

【文章來源】:園藝學報. 2020,47(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:12 頁

【部分圖文】:

茶樹脂肪酸去飽和酶家族基因的克隆與表達分析


5個CsFAD基因的擴增

蛋白,基序,家族,同屬


通過MEME在線程序對5個茶樹FAD家族成員與其同源的擬南芥FAD成員進行保守基序分析。如圖3所示,同一亞家族的FAD成員間保守基序完全一致,而不同亞家族的保守基序存在較大不同。其中,同屬于ω3/ω6-FAD亞家族的Cs FAD2-2、Cs FAD3、AtFAD2a和AtFAD3a存在相同5個保守基序(基序1、2、3、4和5);同屬于Δ7/Δ9-FAD亞家族的Δ7-CsFAD和AtFAD5存在相同3個保守基序(基序1、5和6);同屬于Front end FAD亞家族的Δ8-CsFAD和AtSLD1.2存在相同的基序2和基序7;同屬于FAB亞家族的CsFAB2和AtFAB2.1存在相同的基序7和基序8。這些特異的保守基序暗示不同的FAD亞家族成員在植物中發(fā)揮不同的功能。圖3 CsFAD蛋白的保守基序分析

蛋白,基序


CsFAD蛋白的保守基序分析

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3510334

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