弓背青鳉雌、雄激素受體基因?qū)Υ萍に仨憫?yīng)及雌二醇處理轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-21 21:53
環(huán)境雌激素(Environmental estrogens,EEs)是一種具有雌激素效應(yīng),在生物體內(nèi)模擬雌激素,并通過相應(yīng)受體介導(dǎo)而對生物體基因轉(zhuǎn)錄造成影響的一類化合物。雌激素受體(Estrogen receptor)與雄激素受體(Andorgen receptor)是核受體超家族的成員,介導(dǎo)性激素信號(hào)傳導(dǎo),參與性腺發(fā)育、成熟等生理過程。弓背青鳉(Oryzias curvinotus)作為湛江本地紅樹林主要種,具有繁殖力強(qiáng)、世代周期短、廣鹽性等特點(diǎn),具有開發(fā)為模式生物的潛力。本研究對弓背青鳉進(jìn)行了RT-qPCR的內(nèi)參基因篩選;初步探究了弓背青鳉雌、雄激素受體基因表達(dá)特征與功能。同時(shí)為了評估EEs給生物體帶來的潛在危害風(fēng)險(xiǎn),篩選出合適的EEs監(jiān)測生物標(biāo)志物,本研究對雌二醇(E2)處理24 h弓背青鳉仔魚進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,并篩選出顯著上調(diào)基因,評估其對雌激素處理的響應(yīng)特性及對雙酚A處理的敏感程度。主要結(jié)果如下:1、對弓背青鳉進(jìn)行RT-qPCR內(nèi)參基因的篩選,通過RefFinder預(yù)測,結(jié)合geNorm、NormFinder和Bestkeeper分析,結(jié)果顯示使用eef1...
【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
雌激素及其類似物誘導(dǎo)下的Chg與Vtg合成的簡圖(ChenX.2007)
弓背青鳉雌、雄激素受體基因?qū)Υ萍に仨憫?yīng)及雌二醇處理轉(zhuǎn)錄組分析122.2結(jié)果2.2.1管家基因引物檢驗(yàn)及cDNA和DNA擴(kuò)增產(chǎn)物比較各候選的管家基因PCR擴(kuò)增檢測結(jié)果如圖2-1所示,其中,各候選管家基因引物以cDNA為模板所擴(kuò)增的產(chǎn)物,均比以DNA為模板擴(kuò)增的產(chǎn)物片段短,這證實(shí)了所用的cDNA模板中無基因組DNA污染。與此同時(shí),測序成功的候選內(nèi)參基因序列信息經(jīng)與本地轉(zhuǎn)錄組預(yù)測序列比對,并通過blastn在線軟件證實(shí)其擴(kuò)增是特異性的。圖2-1不同模版(水、cDNA、DNA)檢測不同管家基因特異性引物Fig.2-1Testingofdifferenttemplates(ddH2O,cDNA,DNA)withspecificprimers注:1為DNA;2為水;3為cDNA;M為DL2000DNAMarkerNote:1:DNA;2:water;3:cDNA;M:DL2000DNAMarker2.2.2管家基因標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制根據(jù)在連續(xù)梯度稀釋濃度下的cDNA作為RT-qPCR模板所得各管家基因的Ct值,繪制出各管家基因RT-qPCR的擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)曲線圖,從而計(jì)算出擴(kuò)增曲線的斜率k以及線性相關(guān)系數(shù)R2,根據(jù)公式計(jì)算擴(kuò)增效率E=10-(1/k)-1,結(jié)果如圖2-2所示,各管家基因的線性相關(guān)系數(shù)為0.9914至0.9996,擴(kuò)增效率范圍為94.6%至103.4%。2.2.3管家基因表達(dá)穩(wěn)定性分析為了評估10種管家基因的mRNA表達(dá)穩(wěn)定性,以不同組織、不同胚胎發(fā)育階段、E2和BPA處理的cDNA作為模板進(jìn)行RT-qPCR擴(kuò)增。如圖2-3所示,各
弓背青鳉雌、雄激素受體基因?qū)Υ萍に仨憫?yīng)及雌二醇處理轉(zhuǎn)錄組分析14圖2-3各系列模板管家基因Ct值比較Fig.2-3Expressionprofilesofcandidatereferencegenes圖2-4geNorm分析所有管家基因的平均表達(dá)穩(wěn)定值MFig.2-4Theaverageexpressionstabilityvalue(M)ofallthehousekeepinggenesanalysedbygeNormsoftware
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]弓背青鳉的胚胎發(fā)育及自發(fā)熒光觀察[J]. 張海瑞,王中鐸,黃順楷,汪淳,郭昱嵩,董忠典,劉楚吾. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]多鱗鱚不同組織熒光定量PCR內(nèi)參基因篩選[J]. 張寧,杜文文,王中鐸,黃洋,杜濤,董忠典. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[3]海水青鳉雌激素受體基因的克隆、組織表達(dá)特性及環(huán)境雌激素EE2對其表達(dá)的影響[J]. 張民,安哲,彭會(huì). 大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
[4]抗肝纖維化藥物研發(fā)進(jìn)展[J]. 張文東,王瑞范,吳會(huì)敏,楊慧,王國成. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[5]模式生物海洋青鳉魚的視覺結(jié)構(gòu)與功能發(fā)育[J]. 陳劍明,劉肖岑,徐永健. 中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2018(02)
[6]中國青鳉屬魚類新紀(jì)錄:鰭斑青鳉[J]. 吳偉名,李建中. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2017(05)
[7]廣東淡水魚類弓背青鳉分類形態(tài)性狀再描述[J]. 張方方,姜昊辰,金錦錦,仇玉萍,陳國柱. 四川動(dòng)物. 2017(05)
[8]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 洪奇陽,畢行建,王大寧,李子真,俞海,夏寧邵,李少偉. 中國生化藥物雜志. 2017(06)
[9]雙酚A的內(nèi)分泌干擾效應(yīng)研究進(jìn)展[J]. 吳皓,孫東,蔡卓平,刁盼盼,石健,陳琪,段舜山. 生態(tài)科學(xué). 2017(03)
[10]興國紅鯉ER基因克隆表達(dá)及EE2暴露對肝中ER表達(dá)的影響[J]. 宋明月,單喜雙,陳細(xì)華,岳華梅,葉歡,楊曉鴿,李創(chuàng)舉. 水生生物學(xué)報(bào). 2017(01)
博士論文
[1]雙酚A (BPA)對稀有鮈鯽精子發(fā)生的影響及分子機(jī)制研究[D]. 張瑩瑩.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[2]典型紅樹林濕地中多環(huán)芳烴的含量、來源和遷移研究[D]. 張軍.廈門大學(xué) 2006
碩士論文
[1]雷州半島紅樹林區(qū)仔稚幼魚多樣性及弓背青鳉對壬基酚的響應(yīng)[D]. 廖健.廣東海洋大學(xué) 2017
[2]七彩神仙魚(Symphysodon haraldi)性腺轉(zhuǎn)錄組分析及vasa基因的時(shí)空表達(dá)[D]. 林睿涓.上海海洋大學(xué) 2017
[3]興國紅鯉ERs、AR基因的克隆表達(dá)及EE2、MT暴露對幼魚肝中ERs、AR基因表達(dá)的影響[D]. 宋明月.上海海洋大學(xué) 2016
[4]金錢魚雄激素受體的克隆及其表達(dá)模式的研究[D]. 戴明莉.廣東海洋大學(xué) 2015
[5]17β-雌二醇對斑馬魚的毒性研究[D]. 李國超.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[6]稀有鮈鯽ER基因的克隆及內(nèi)分泌干擾物對其表達(dá)的影響[D]. 王厚鵬.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[7]大黃魚雌激素受體與雄激素受體基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 蒲魯魯.集美大學(xué) 2011
[8]南方鲇雄激素受體(AR)全長cDNA的克隆及分析[D]. 黃寶鋒.西南大學(xué) 2008
[9]雌激素受體在小鼠早期胚胎發(fā)育中的表達(dá)[D]. 李丹丹.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[10]唐魚雌激素受體cDNA克隆及表達(dá)分析[D]. 管昕.華南師范大學(xué) 2007
本文編號(hào):3510317
【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
雌激素及其類似物誘導(dǎo)下的Chg與Vtg合成的簡圖(ChenX.2007)
弓背青鳉雌、雄激素受體基因?qū)Υ萍に仨憫?yīng)及雌二醇處理轉(zhuǎn)錄組分析122.2結(jié)果2.2.1管家基因引物檢驗(yàn)及cDNA和DNA擴(kuò)增產(chǎn)物比較各候選的管家基因PCR擴(kuò)增檢測結(jié)果如圖2-1所示,其中,各候選管家基因引物以cDNA為模板所擴(kuò)增的產(chǎn)物,均比以DNA為模板擴(kuò)增的產(chǎn)物片段短,這證實(shí)了所用的cDNA模板中無基因組DNA污染。與此同時(shí),測序成功的候選內(nèi)參基因序列信息經(jīng)與本地轉(zhuǎn)錄組預(yù)測序列比對,并通過blastn在線軟件證實(shí)其擴(kuò)增是特異性的。圖2-1不同模版(水、cDNA、DNA)檢測不同管家基因特異性引物Fig.2-1Testingofdifferenttemplates(ddH2O,cDNA,DNA)withspecificprimers注:1為DNA;2為水;3為cDNA;M為DL2000DNAMarkerNote:1:DNA;2:water;3:cDNA;M:DL2000DNAMarker2.2.2管家基因標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制根據(jù)在連續(xù)梯度稀釋濃度下的cDNA作為RT-qPCR模板所得各管家基因的Ct值,繪制出各管家基因RT-qPCR的擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)曲線圖,從而計(jì)算出擴(kuò)增曲線的斜率k以及線性相關(guān)系數(shù)R2,根據(jù)公式計(jì)算擴(kuò)增效率E=10-(1/k)-1,結(jié)果如圖2-2所示,各管家基因的線性相關(guān)系數(shù)為0.9914至0.9996,擴(kuò)增效率范圍為94.6%至103.4%。2.2.3管家基因表達(dá)穩(wěn)定性分析為了評估10種管家基因的mRNA表達(dá)穩(wěn)定性,以不同組織、不同胚胎發(fā)育階段、E2和BPA處理的cDNA作為模板進(jìn)行RT-qPCR擴(kuò)增。如圖2-3所示,各
弓背青鳉雌、雄激素受體基因?qū)Υ萍に仨憫?yīng)及雌二醇處理轉(zhuǎn)錄組分析14圖2-3各系列模板管家基因Ct值比較Fig.2-3Expressionprofilesofcandidatereferencegenes圖2-4geNorm分析所有管家基因的平均表達(dá)穩(wěn)定值MFig.2-4Theaverageexpressionstabilityvalue(M)ofallthehousekeepinggenesanalysedbygeNormsoftware
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]弓背青鳉的胚胎發(fā)育及自發(fā)熒光觀察[J]. 張海瑞,王中鐸,黃順楷,汪淳,郭昱嵩,董忠典,劉楚吾. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]多鱗鱚不同組織熒光定量PCR內(nèi)參基因篩選[J]. 張寧,杜文文,王中鐸,黃洋,杜濤,董忠典. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[3]海水青鳉雌激素受體基因的克隆、組織表達(dá)特性及環(huán)境雌激素EE2對其表達(dá)的影響[J]. 張民,安哲,彭會(huì). 大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
[4]抗肝纖維化藥物研發(fā)進(jìn)展[J]. 張文東,王瑞范,吳會(huì)敏,楊慧,王國成. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[5]模式生物海洋青鳉魚的視覺結(jié)構(gòu)與功能發(fā)育[J]. 陳劍明,劉肖岑,徐永健. 中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2018(02)
[6]中國青鳉屬魚類新紀(jì)錄:鰭斑青鳉[J]. 吳偉名,李建中. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2017(05)
[7]廣東淡水魚類弓背青鳉分類形態(tài)性狀再描述[J]. 張方方,姜昊辰,金錦錦,仇玉萍,陳國柱. 四川動(dòng)物. 2017(05)
[8]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 洪奇陽,畢行建,王大寧,李子真,俞海,夏寧邵,李少偉. 中國生化藥物雜志. 2017(06)
[9]雙酚A的內(nèi)分泌干擾效應(yīng)研究進(jìn)展[J]. 吳皓,孫東,蔡卓平,刁盼盼,石健,陳琪,段舜山. 生態(tài)科學(xué). 2017(03)
[10]興國紅鯉ER基因克隆表達(dá)及EE2暴露對肝中ER表達(dá)的影響[J]. 宋明月,單喜雙,陳細(xì)華,岳華梅,葉歡,楊曉鴿,李創(chuàng)舉. 水生生物學(xué)報(bào). 2017(01)
博士論文
[1]雙酚A (BPA)對稀有鮈鯽精子發(fā)生的影響及分子機(jī)制研究[D]. 張瑩瑩.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[2]典型紅樹林濕地中多環(huán)芳烴的含量、來源和遷移研究[D]. 張軍.廈門大學(xué) 2006
碩士論文
[1]雷州半島紅樹林區(qū)仔稚幼魚多樣性及弓背青鳉對壬基酚的響應(yīng)[D]. 廖健.廣東海洋大學(xué) 2017
[2]七彩神仙魚(Symphysodon haraldi)性腺轉(zhuǎn)錄組分析及vasa基因的時(shí)空表達(dá)[D]. 林睿涓.上海海洋大學(xué) 2017
[3]興國紅鯉ERs、AR基因的克隆表達(dá)及EE2、MT暴露對幼魚肝中ERs、AR基因表達(dá)的影響[D]. 宋明月.上海海洋大學(xué) 2016
[4]金錢魚雄激素受體的克隆及其表達(dá)模式的研究[D]. 戴明莉.廣東海洋大學(xué) 2015
[5]17β-雌二醇對斑馬魚的毒性研究[D]. 李國超.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[6]稀有鮈鯽ER基因的克隆及內(nèi)分泌干擾物對其表達(dá)的影響[D]. 王厚鵬.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[7]大黃魚雌激素受體與雄激素受體基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 蒲魯魯.集美大學(xué) 2011
[8]南方鲇雄激素受體(AR)全長cDNA的克隆及分析[D]. 黃寶鋒.西南大學(xué) 2008
[9]雌激素受體在小鼠早期胚胎發(fā)育中的表達(dá)[D]. 李丹丹.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[10]唐魚雌激素受體cDNA克隆及表達(dá)分析[D]. 管昕.華南師范大學(xué) 2007
本文編號(hào):3510317
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