小鼠睪丸熒光定量PCR分析的內(nèi)參基因篩選
發(fā)布時(shí)間:2021-11-21 20:18
旨在篩選出小鼠睪丸組織中最優(yōu)內(nèi)參基因,為研究小鼠睪丸發(fā)育過程中的目的基因表達(dá)提供基礎(chǔ)依據(jù).以小鼠作為研究對(duì)象,采用Trizol法提取4個(gè)不同發(fā)育時(shí)期(1周齡、3周齡、6周齡、9周齡)睪丸組織總RNA并反轉(zhuǎn)錄獲得其cDNA.且根據(jù)已有報(bào)道,選出小鼠常見相對(duì)穩(wěn)定的7種內(nèi)參基因β-肌動(dòng)蛋白(β-actin)、肽基異構(gòu)酶A(PPIA)、酸性核糖體磷酸蛋白(ARBP)、18S核糖體RNA(18S rRNA)、琥珀酸脫氫酶復(fù)合黃蛋白亞基A(SDHA)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)和次黃嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶1(HPRT1)的GenBank登陸序列設(shè)計(jì)所需熒光定量引物,結(jié)合實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-qPCR)技術(shù)分別驗(yàn)證候選基因引物特異性并構(gòu)建以睪丸組織為模板各基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線,并通過GeNorm程序?qū)Ω骰蚍(wěn)定性進(jìn)行分析,篩選出小鼠睪丸中最適內(nèi)參基因.結(jié)果表明,各個(gè)時(shí)期睪丸組織RNA電泳條帶沒有出現(xiàn)彌散和拖帶的現(xiàn)象;所設(shè)計(jì)的候選基因引物條帶單一沒有雜帶且RT-qPCR溶解曲線均呈現(xiàn)單一信號(hào)峰,并具有良好的線性關(guān)系;候選基因穩(wěn)定性值(M值)進(jìn)行排序:PPIA=β-actin>ARBP>...
【文章來源】:西南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,46(05)
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
睪丸組織RNA的電泳結(jié)果
使用GeNorm程序?qū)⒛骋粋(gè)內(nèi)參基因與其他選擇的內(nèi)參基因表達(dá)水平的兩兩比值經(jīng)對(duì)數(shù)變換,然后計(jì)算出的平均標(biāo)準(zhǔn)差作為基因表達(dá)穩(wěn)定性的平均值(M值).本研究所選7個(gè)管家基因PPIA、β-actin、ARBP、HPRT1、SDHA、18S rRNA和GAPDH對(duì)應(yīng)的M值分別為0.513、0.513、0.804、1.154、3.179、4.481、5.021,表達(dá)穩(wěn)定性順序?yàn)镻PIA=β-actin>ARBP>HPRT1>SDHA>18S rRNA>GAPDH.如圖所示,7種候選內(nèi)參基因最穩(wěn)定的是PPIA和β-actin,最不穩(wěn)定的為GAPDH(圖5).圖3 小鼠睪丸組織中7個(gè)內(nèi)參基因RT-qPCR溶解曲線
小鼠睪丸組織中7個(gè)內(nèi)參基因RT-qPCR溶解曲線
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小鼠卵巢組織定量PCR分析中內(nèi)參基因的篩選[J]. 楊顯英,熊顯榮,韓杰,黃向月,王艷,阿果約達(dá),李鍵. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]乳腺癌細(xì)胞(MCF-7)內(nèi)參基因的選擇[J]. 李光超,武小虎,馬友記,張勇,趙興緒. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(02)
[3]家兔不同發(fā)育階段和組織中內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析[J]. 陳瑞,楊曉農(nóng),曾婉秋,文娟. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(03)
本文編號(hào):3510169
【文章來源】:西南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,46(05)
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
睪丸組織RNA的電泳結(jié)果
使用GeNorm程序?qū)⒛骋粋(gè)內(nèi)參基因與其他選擇的內(nèi)參基因表達(dá)水平的兩兩比值經(jīng)對(duì)數(shù)變換,然后計(jì)算出的平均標(biāo)準(zhǔn)差作為基因表達(dá)穩(wěn)定性的平均值(M值).本研究所選7個(gè)管家基因PPIA、β-actin、ARBP、HPRT1、SDHA、18S rRNA和GAPDH對(duì)應(yīng)的M值分別為0.513、0.513、0.804、1.154、3.179、4.481、5.021,表達(dá)穩(wěn)定性順序?yàn)镻PIA=β-actin>ARBP>HPRT1>SDHA>18S rRNA>GAPDH.如圖所示,7種候選內(nèi)參基因最穩(wěn)定的是PPIA和β-actin,最不穩(wěn)定的為GAPDH(圖5).圖3 小鼠睪丸組織中7個(gè)內(nèi)參基因RT-qPCR溶解曲線
小鼠睪丸組織中7個(gè)內(nèi)參基因RT-qPCR溶解曲線
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小鼠卵巢組織定量PCR分析中內(nèi)參基因的篩選[J]. 楊顯英,熊顯榮,韓杰,黃向月,王艷,阿果約達(dá),李鍵. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]乳腺癌細(xì)胞(MCF-7)內(nèi)參基因的選擇[J]. 李光超,武小虎,馬友記,張勇,趙興緒. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(02)
[3]家兔不同發(fā)育階段和組織中內(nèi)參基因的穩(wěn)定性分析[J]. 陳瑞,楊曉農(nóng),曾婉秋,文娟. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(03)
本文編號(hào):3510169
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