合并XCI與印記效應的X染色體致病基因定位方法研究
發(fā)布時間:2021-11-09 17:09
背景:X染色體在很多伴性遺傳病中有著非常重要的作用。然而,人們目前發(fā)現(xiàn)的X染色體上與疾病相關(guān)聯(lián)的單核苷酸多態(tài)性位點卻很少。與常染色體相比,定位X染色體上的疾病位點顯得更加困難。究其原因,一方面是由于男性和女性X染色體的數(shù)量不同;另一方面,為了防止女性的基因表達量是男性的2倍,女性個體體內(nèi)細胞會選擇其中一條X染色體失活以達到劑量補償?shù)淖饔谩S腥N類型的失活機制:逃逸失活、隨機失活和偏倚失活。此外,印記基因?qū)φ5纳L發(fā)育起著至關(guān)重要的作用,而變異的遺傳印記則會影響個體的生長發(fā)育,導致各種疾病。研究發(fā)現(xiàn)人類中某些復雜性狀也與X染色體上的印記基因相關(guān)聯(lián)。目前,人們已經(jīng)提出一些適用于定位X染色體上致病位點的關(guān)聯(lián)分析方法,這些方法考慮了X染色體失活。然而,沒有一種方法合并了印記效應的信息。目的:基于病例對照數(shù)據(jù),在不需要指定遺傳模型的前提下,我們提出一種可以合并X染色體失活和印記效應的定位疾病位點的方法。方法:假設(shè)男性和女性的致病基因相同,將數(shù)據(jù)按照性別分層,分別構(gòu)造檢驗統(tǒng)計量,然后將這些檢驗統(tǒng)計量按照樣本量加權(quán)合并得到最終的檢驗統(tǒng)計量ZXCII。通過大量的計算機模擬研究比較新提出的ZXCII方...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省
【文章頁數(shù)】:127 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
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【參考文獻】:
博士論文
[1]X染色體失活的統(tǒng)計度量及合并X染色體失活的關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 汪鵬.南方醫(yī)科大學 2018
碩士論文
[1]基于三聯(lián)體家庭數(shù)據(jù)X染色體偏倚失活的統(tǒng)計度量研究[D]. 徐思琦.南方醫(yī)科大學 2019
[2]X染色體印記效應檢驗及合并X染色體失活與印記效應的關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 鄒綺蕾.南方醫(yī)科大學 2017
本文編號:3485744
【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省
【文章頁數(shù)】:127 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1.在偏倚系數(shù)為1的失活、完全母源印記效應和隨機婚配情況下,基于10000次模??擬、樣本量W?=?1000、0,〇?=?0m〇?=?0/〇1??
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【參考文獻】:
博士論文
[1]X染色體失活的統(tǒng)計度量及合并X染色體失活的關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 汪鵬.南方醫(yī)科大學 2018
碩士論文
[1]基于三聯(lián)體家庭數(shù)據(jù)X染色體偏倚失活的統(tǒng)計度量研究[D]. 徐思琦.南方醫(yī)科大學 2019
[2]X染色體印記效應檢驗及合并X染色體失活與印記效應的關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 鄒綺蕾.南方醫(yī)科大學 2017
本文編號:3485744
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