為探究綿羊KRTAP6-1基因潛在的生物學(xué)功能,以生物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫中KRTAP6-1基因序列為研究對(duì)象,采用生物信息學(xué)的預(yù)測相關(guān)軟件,進(jìn)行生物信息學(xué)的預(yù)測分析。結(jié)果表明,KRTAP6-1基因總共編碼83個(gè)氨基酸,分子量8 427.18 Da,是穩(wěn)定的親水性蛋白,主要在細(xì)胞質(zhì)中起作用,沒有明顯的信號(hào)肽切割位點(diǎn),其二級(jí)結(jié)構(gòu)主要以無規(guī)卷曲和β螺旋的形式存在;綿羊KRTAP6-1基因編碼蛋白的氨基酸組成與普通牛和山羊的同源性最高,分別為95.0%和91.7%。通過對(duì)綿羊KRTAP6-1基因編碼產(chǎn)物的生物學(xué)分析,挖掘其潛在功能,結(jié)果為豐富綿羊基因組內(nèi)容及該基因的后續(xù)利用提供基礎(chǔ)信息。 

【文章來源】：中國草食動(dòng)物科學(xué). 2020,40(05)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

綿羊KRTAP6-1基因編碼蛋白質(zhì)疏水性/親水性預(yù)測分析

基因編碼蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)的分析預(yù)測采用TMHMM 2.0在線軟件。結(jié)果顯示，該基因編碼的蛋白有2個(gè)明顯的跨膜螺旋區(qū)，分別在氨基酸位點(diǎn)的第7～34和第64～83的位置（見圖4）。由此推測，綿羊KRTAP6-1基因編碼的蛋白質(zhì)是跨膜蛋白質(zhì)，有可能在細(xì)胞中起一定的運(yùn)輸作用。圖3 HMM模型分析KRTAP6-1基因編碼產(chǎn)物信號(hào)肽的曲線圖

HMM模型分析KRTAP6-1基因編碼產(chǎn)物信號(hào)肽的曲線圖

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3483361