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綿羊KRTAP6-1基因生物信息學分析

發(fā)布時間:2021-11-08 08:24
  為探究綿羊KRTAP6-1基因潛在的生物學功能,以生物基因組學數(shù)據(jù)庫中KRTAP6-1基因序列為研究對象,采用生物信息學的預測相關軟件,進行生物信息學的預測分析。結果表明,KRTAP6-1基因總共編碼83個氨基酸,分子量8 427.18 Da,是穩(wěn)定的親水性蛋白,主要在細胞質(zhì)中起作用,沒有明顯的信號肽切割位點,其二級結構主要以無規(guī)卷曲和β螺旋的形式存在;綿羊KRTAP6-1基因編碼蛋白的氨基酸組成與普通牛和山羊的同源性最高,分別為95.0%和91.7%。通過對綿羊KRTAP6-1基因編碼產(chǎn)物的生物學分析,挖掘其潛在功能,結果為豐富綿羊基因組內(nèi)容及該基因的后續(xù)利用提供基礎信息。 

【文章來源】:中國草食動物科學. 2020,40(05)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

綿羊KRTAP6-1基因生物信息學分析


綿羊KRTAP6-1基因編碼蛋白質(zhì)疏水性/親水性預測分析

曲線圖,信號肽,綿羊,模型分析


基因編碼蛋白的跨膜結構的分析預測采用TMHMM 2.0在線軟件。結果顯示,該基因編碼的蛋白有2個明顯的跨膜螺旋區(qū),分別在氨基酸位點的第7~34和第64~83的位置(見圖4)。由此推測,綿羊KRTAP6-1基因編碼的蛋白質(zhì)是跨膜蛋白質(zhì),有可能在細胞中起一定的運輸作用。圖3 HMM模型分析KRTAP6-1基因編碼產(chǎn)物信號肽的曲線圖

曲線圖,信號肽,模型分析,基因


HMM模型分析KRTAP6-1基因編碼產(chǎn)物信號肽的曲線圖

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號:3483361

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