強(qiáng)直性脊柱炎致病相關(guān)基因的篩選及RUNX1參與破骨細(xì)胞分化的可能機(jī)制
發(fā)布時間:2021-11-04 14:07
第一部分 基于RNA高通量測序篩選強(qiáng)直性脊柱炎的差異表達(dá)基因研究背景強(qiáng)直性脊柱炎是一種慢性自身免疫性疾病,以反復(fù)發(fā)作的炎癥及進(jìn)行性的骨化為特征,主要累及中軸骨關(guān)節(jié)和軟組織附著點(diǎn),具備高度遺傳性,疾病由多因素誘發(fā),但病因及發(fā)病機(jī)制尚未研究清楚。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的與強(qiáng)直性脊柱炎密切相關(guān)的基因包括人類白細(xì)胞抗原B27(HLA-B27)、腫瘤壞死因子α(TNF-α)、人類白細(xì)胞抗原B60(HLA-B60)等,這些致病基因是強(qiáng)制性脊柱炎發(fā)病的遺傳因素。RNA測序(RNA-Seq)更加全面、精確、經(jīng)濟(jì)及可行,RNA測序是第二代測序技術(shù),成本低、精度高、測序快。RNA測序能夠鑒別差異表達(dá)基因(DEGs)并精確定量外顯子及其亞型。既往的研究已經(jīng)用RNA測序來識別疾病的相關(guān)基因,但尚沒有對強(qiáng)直性脊柱炎進(jìn)行RNA測序的報道。通過RNA測序,可以篩選AS患者外周血差異表達(dá)基因,并構(gòu)建功能注釋、蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。研究目的篩選強(qiáng)直性脊柱炎患者的差異表達(dá)基因,并構(gòu)建功能注釋、蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)一些有意義的致病基因,并探索其生物學(xué)功能。研究方法1.血標(biāo)本總RNA提取:勻漿處理、氯仿萃取、RNA純...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:157 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
AS患者前50位的差異表達(dá)基因熱圖像
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]PCR-RFLP技術(shù)與結(jié)合SYBR GreenⅠ熒光染料的實(shí)時熒光PCR技術(shù)對HBV拉米夫定耐藥基因檢測效果分析[J]. 卜范峰,朱曉艷,彭德志,王睿,田欣欣,王燕,周永坤. 山東醫(yī)藥. 2018(08)
[2]基于Cytoscape等生物信息學(xué)分析軟件預(yù)測蓽茇明堿抗腫瘤靶基因[J]. 滕文靜,李洪霖,李雁. 廣州中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2017(05)
[3]柚皮素對破骨細(xì)胞特異性基因及OPG/RANKL/RANK表達(dá)的影響[J]. 吳新濤,石晶,高樂才,吳文元,龐石磊. 河北醫(yī)藥. 2017(02)
[4]RUNX1基因與腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 李娜,李勇,鞏平. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(06)
[5]原發(fā)性骨質(zhì)疏松癥的骨骼免疫機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 劉連勇,鄭勝喜,甄燕,趙東寶,胡曉暉. 中國骨質(zhì)疏松雜志. 2016(07)
[6]炎癥狀態(tài)下NF-κB-mTOR通路及轉(zhuǎn)錄因子RUNX1調(diào)控腎小管上皮細(xì)胞DC-SIGN表達(dá)研究[J]. 羅茂財,周思源,馮丹穎,王紅艷,許春娣,周同. 現(xiàn)代免疫學(xué). 2016(03)
[7]豬戊型肝炎病毒TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 閆蕾,涂亞斌,李海,張交兒,王剛,劉永剛,陳志寶,蔡雪輝. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2016(04)
[8]連接酶檢測反應(yīng)技術(shù)應(yīng)用于乙型肝炎病毒拉米夫定耐藥和阿德福韋耐藥突變的研究[J]. 單幼蘭,江培學(xué). 暨南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版). 2015(06)
[9]ERAP1基因單核苷酸多態(tài)性與中國漢族人群強(qiáng)直性脊柱炎的易感性關(guān)聯(lián)分析[J]. 曲哲,錢邦平,邱勇,季明亮,江華,王斌,俞楊,朱澤章,蔣軍,毛賽虎. 中國脊柱脊髓雜志. 2015(09)
[10]翻譯后組蛋白乙酰化與骨代謝的研究進(jìn)展[J]. 鄧展?jié)?金潔雯,徐海棟,趙建寧. 臨床與病理雜志. 2015(08)
博士論文
[1]Runx1及其共轉(zhuǎn)錄因子Cbfβ在成骨細(xì)胞分化及骨發(fā)育中作用的研究[D]. 王祎萍.浙江大學(xué) 2014
[2]Runx1在腦死亡供體肝臟中作用機(jī)制研究[D]. 趙杰.中南大學(xué) 2014
[3]TNF-α對RANKL體外誘導(dǎo)破骨細(xì)胞分化的促進(jìn)作用及其機(jī)制探討[D]. 夏琳.山東大學(xué) 2013
本文編號:3475884
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:157 頁
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【部分圖文】:
AS患者前50位的差異表達(dá)基因熱圖像
^l¥2?KeisSft?;??Cpo^-cpk?ne?rector?ftefacto-??;wWl。?pS3_、pa:??*^1^.?SUphylxoccas^egs?f^oon?;??j?|?Osteal?i^efen^??,?*?〇462l?k^t?vfii?^?0m)??\?■saOMl-):?K/penrophiC?arttry^i?(HCM)??0?1?t?3?4?P—T?—? ̄1??肩??者KEGG通路富集分析。??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]基于Cytoscape等生物信息學(xué)分析軟件預(yù)測蓽茇明堿抗腫瘤靶基因[J]. 滕文靜,李洪霖,李雁. 廣州中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2017(05)
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[4]RUNX1基因與腫瘤關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 李娜,李勇,鞏平. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(06)
[5]原發(fā)性骨質(zhì)疏松癥的骨骼免疫機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 劉連勇,鄭勝喜,甄燕,趙東寶,胡曉暉. 中國骨質(zhì)疏松雜志. 2016(07)
[6]炎癥狀態(tài)下NF-κB-mTOR通路及轉(zhuǎn)錄因子RUNX1調(diào)控腎小管上皮細(xì)胞DC-SIGN表達(dá)研究[J]. 羅茂財,周思源,馮丹穎,王紅艷,許春娣,周同. 現(xiàn)代免疫學(xué). 2016(03)
[7]豬戊型肝炎病毒TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 閆蕾,涂亞斌,李海,張交兒,王剛,劉永剛,陳志寶,蔡雪輝. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2016(04)
[8]連接酶檢測反應(yīng)技術(shù)應(yīng)用于乙型肝炎病毒拉米夫定耐藥和阿德福韋耐藥突變的研究[J]. 單幼蘭,江培學(xué). 暨南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版). 2015(06)
[9]ERAP1基因單核苷酸多態(tài)性與中國漢族人群強(qiáng)直性脊柱炎的易感性關(guān)聯(lián)分析[J]. 曲哲,錢邦平,邱勇,季明亮,江華,王斌,俞楊,朱澤章,蔣軍,毛賽虎. 中國脊柱脊髓雜志. 2015(09)
[10]翻譯后組蛋白乙酰化與骨代謝的研究進(jìn)展[J]. 鄧展?jié)?金潔雯,徐海棟,趙建寧. 臨床與病理雜志. 2015(08)
博士論文
[1]Runx1及其共轉(zhuǎn)錄因子Cbfβ在成骨細(xì)胞分化及骨發(fā)育中作用的研究[D]. 王祎萍.浙江大學(xué) 2014
[2]Runx1在腦死亡供體肝臟中作用機(jī)制研究[D]. 趙杰.中南大學(xué) 2014
[3]TNF-α對RANKL體外誘導(dǎo)破骨細(xì)胞分化的促進(jìn)作用及其機(jī)制探討[D]. 夏琳.山東大學(xué) 2013
本文編號:3475884
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