菊花（Chrysanthemum×morifolium Ramat）是世界上重要的觀賞植物之一,具備觀賞、食用、藥用和茶用等多種價(jià)值。作為一種起源于我國的重要花卉,菊花變異之豐富在栽培植物中是比較罕見的,而且是在只有1600多年的栽培歷史中發(fā)生如此巨大變化,所以這種變異起源的問題一直是菊花研究者普遍關(guān)注的一個(gè)重要命題。DNA甲基化是研究相對較多的表觀遺傳修飾之一,涉及許多生物學(xué)過程,包括轉(zhuǎn)座子沉默和激活、基因印記和染色體失活,其在調(diào)控植物的生長發(fā)育方面有著重要的作用。DNA甲基化與菊花各種變異性狀的形成是否發(fā)揮作用,是需要探討的課題。而對菊花DNA甲基化修飾相關(guān)酶基因進(jìn)行鑒定與分析是解析這一問題的重要基礎(chǔ)。本研究以菊花‘金背大紅’、‘野菊（菊花腦,Chrysanthemum×nankingense）’和MET1干涉的菊花‘紫精靈’為實(shí)驗(yàn)材料。對‘金背大紅’和‘菊花腦’的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,初步鑒定了菊花DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶基因,熒光定量PCR技術(shù)檢測了其在不同組織和不同菊花品種中的表達(dá)量。此外,對MET1-_RNAi材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,從轉(zhuǎn)錄水平上揭... 

【文章來源】：河南大學(xué)河南省

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 緒論
    1.1 菊花
    1.2 表觀遺傳學(xué)
    1.3 植物DNA甲基化
        1.3.1 DNA甲基化的特點(diǎn)
        1.3.2 DNA甲基化的類型
        1.3.3 DNA去甲基化
        1.3.4 主要的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶
    1.4 DNA甲基化的研究
        1.4.1 DNA甲基化對植物表型和種子萌發(fā)的影響
        1.4.2 DNA甲基化與春化作用
        1.4.3 DNA甲基化對植物基因組防御的作用
        1.4.4 DNA甲基化參與植物逆境脅迫的調(diào)控
    1.5 高通量測序技術(shù)
    1.6 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)發(fā)展
    1.7 本研究目的及研究內(nèi)容
2 植物材料和實(shí)驗(yàn)方法
    2.1 植物材料
        2.1.1 三代測序材料及實(shí)時(shí)熒光定量PCR所需的材料
        2.1.2 轉(zhuǎn)錄組測序所需的材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.2 DNA甲基化相關(guān)酶基因鑒定的實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.3 MET1-_(RNAi)材料轉(zhuǎn)錄組分析的實(shí)驗(yàn)方法
3 結(jié)果分析
    3.1 菊花DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶基因的鑒定及表達(dá)分析
        3.1.1 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基酶基因的理化性質(zhì)分析和保守結(jié)構(gòu)域分析
        3.1.2 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析
        3.1.3 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶基因在“金背大紅”的不同組織及不同品種的表達(dá)分析
        3.1.4 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶基因在“菊花腦”不同組織的表達(dá)分析
    3.2 MET1-_(RNAi)材料轉(zhuǎn)錄組分析
        3.2.1 轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)量分析
        3.2.2 基因注釋與功能分類
        3.2.3 差異表達(dá)基因分析
        3.2.4 MET1-_(RNAi)材料與對照組差異表達(dá)基因qRT-PCR結(jié)果驗(yàn)證
4 討論
    4.1 菊花DNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶基因鑒定及系統(tǒng)發(fā)育樹分析
    4.2 菊花DNA甲基化相關(guān)酶基因表達(dá)分析
    4.3 MET1-_(RNAi)材料轉(zhuǎn)錄組分析
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
發(fā)表論文目錄
附錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]植物組織培養(yǎng)過程中的DNA甲基化研究進(jìn)展[J]. 石鵬,王永,金龍飛,張大鵬,趙志浩,曹紅星,雷新濤.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2019(01)
[2]轉(zhuǎn)錄組測序及其在甜菜功能基因挖掘中的應(yīng)用[J]. 張自強(qiáng),白晨,張惠忠,李曉東,付增娟,趙尚敏,鄂圓圓,張輝,王良,張必周.  北方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(05)
[3]WRKY轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J]. 張凡,尹俊龍,郭瑛琪,岳艷玲.  生物技術(shù)通報(bào). 2018(01)
[4]姜黃素對菊花DNA甲基化及其生長發(fā)育的影響[J]. 劉艷華,李忠愛,李杰,劉曉,王子成.  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[5]RNA-Seq高通量測序技術(shù)在果樹功能基因組學(xué)研究的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉歡,黃麗娜,張奮強(qiáng),姜夢嫣,周義杰,陳思源,王有年,楊明峰,馬蘭青.  生物技術(shù)進(jìn)展. 2017(02)
[6]DNA甲基化與植物生長發(fā)育的表觀遺傳調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 李亞嬌,郭九峰,王淑妍,劉曉婷,那日.  生態(tài)科學(xué). 2016(04)
[7]基于RNA-seq技術(shù)開發(fā)中間偃麥草基因組特異分子標(biāo)記[J]. 崔雨,鮑印廣,王洪剛,李興鋒.  麥類作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[8]基于RNA-seq的杜氏鹽藻全轉(zhuǎn)錄組測序與分析[J]. 朱立強(qiáng),李慶華,張彥婷,朱相展,關(guān)方霞,薛樂勛.  鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2016(03)
[9]菊花的藥食同源功效[J]. 戴思蘭,溫小蕙.  生命科學(xué). 2015(08)
[10]RNA依賴的RNA聚合酶（RdRP）與非編碼RNA（ncRNA）調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 丁超,張?zhí)m,曹潔,于文強(qiáng).  復(fù)旦學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(02)

博士論文
[1]丹參全基因組DNA甲基化譜及DNA甲基轉(zhuǎn)移酶與去甲基化酶基因的系統(tǒng)分析[D]. 李江.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2018
[2]干旱脅迫誘導(dǎo)水稻產(chǎn)生可遺傳表觀遺傳變異及其相關(guān)生理代謝變化的研究[D]. 張春玉.東北師范大學(xué) 2013
[3]基于EST數(shù)據(jù)庫和轉(zhuǎn)錄組測序的茶樹DNA分子標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用研究[D]. 王麗鴛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[4]草莓和蘋果DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因分離及表達(dá)分析[D]. 常琳琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]蘿卜春化作用及其與DNA甲基化水平的關(guān)系[D]. 汪炳良.浙江大學(xué) 2004

碩士論文
[1]低溫脅迫對桂花生理生化及表觀遺傳修飾的影響[D]. 沈堯.河南大學(xué) 2014
[2]人參根、莖、葉轉(zhuǎn)錄組測序及差異表達(dá)基因分析[D]. 林艷玲.長春中醫(yī)藥大學(xué) 2013
[3]外源肉桂酸對干旱脅迫下兩個(gè)黃瓜品種葉片DNA甲基化的影響[D]. 孫維娟.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]水稻甲基化轉(zhuǎn)移酶OsMET1-1和OsMET1-2基因串聯(lián)RNAi載體在粳稻中的表達(dá)[D]. 路云俠.東北師范大學(xué) 2009



本文編號：3475882