青枯菌誘導的馬鈴薯StSl-1基因的表達特征分析
發(fā)布時間:2021-11-04 16:28
馬鈴薯(Solanum tuberosum)在許多國家都是一種重要的主糧和經濟作物。馬鈴薯也是病原體青枯菌(茄科雷爾氏菌Ralstonia solanacearum)的寄主,除此以外,冷、熱、旱、鹽等非生物脅迫因子對馬鈴薯生長栽培等有顯著影響。研究馬鈴薯抗病的分子機制,是保持和提高馬鈴薯產量的重點。在高等植物中,Scarecrow-like蛋白(SCL)是一個屬于GRAS家族的轉錄因子。SCL可以調節(jié)根系生長和細胞周期,也可以抵抗環(huán)境脅迫。SCL作為轉錄因子可以編碼參與植物的信息傳遞和信號轉導。植物特異的SCL轉錄因子調節(jié)植物發(fā)育過程,參與抗脅迫反應。然而到目前為止,馬鈴薯中的SCL基因研究較少。本研究從馬鈴薯抗病基因型ED13中獲得了Scarecrow-like 21(SCL21)基因的全長cDNA序列,命名為StSl-1。利用qRT-PCR技術分析了該基因受青枯菌誘導和受三種植物激素水楊酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)和脫落酸(ABA)激發(fā)的基因表達譜,并利用原位雜交技術分析了該基因表達的組織和細胞學定位。主要結果如下:序列分析表明該基因序列長2,139bp。系統(tǒng)進化分析發(fā)現(xiàn)St...
【文章來源】:山西師范大學山西省
【文章頁數】:75 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
ABA和NO3ˉ對擬南芥根尖中SCR基因的表達有調節(jié)作用(Harrisetal,2017)
山西師范大學碩士學位論文18圖3-1StSl-1基因的DNA序列和預測的氨基酸序列馬鈴薯StSl-1序列的全長。該圖顯示了StSl-1基因的核苷酸和氨基酸序列,共2139bp和537個氨基酸。其中CDS區(qū)為313bp-1926bp。Figure3-1DNAsequenceandthepredictedaminoacidsequenceThefullDNAsequenceofthepotatoStSl-1genewereshowed.ThisfigureshowsthenucleotideandaminoacidsequencesoftheStSl-1gene,whichis2139bpand537aminoacidsintotal.TheCDSregionis313bp-1926bp.
山西師范大學碩士學位論文20圖3-2StSl-1基因編碼SCL蛋白的保守結構域及其三級結構StSl-1基因堿基順序和蛋白質氨基酸殘基起止號顯示在示意框上方,氨基酸殘基及序號顯示在下方。AStSl-1的GRAS超家族結構域,pfam03514,氨基酸殘基169-537。BStSl-1羧基末端GRAS超家族結構域的三級結構,C:羧基末端,N:氨基末端。CStSl-1基因DNA序列上游啟動子區(qū)的順式元件:cis-1:TCAbox,涉及水楊酸反應的順式元件;cis-2:TC-richbox,參與防御和脅迫反應的順式元件;cis-3:TATAbox,在-30附近開始轉錄的核心啟動子元件;cis-*,其他順式元件(具體見附錄)。Figure3-2ConservedDomainandTertiarystructureofSCLproteinencodedbyStSl-1GeneThebasesequenceofStSl-1geneandthestartandstopnumberofproteinaminoacidresidueswereshownabovetheschematicbox,andtheaminoacidresiduesandsequencenumberswereshownbelow.ATheGRASsuperfamilydomainofStSl-1,pfam03514,aminoacidresidues169-537.BThetertiarystructureoftheStSl-1carboxy-terminalGRASsuperfamilydomain,C:carboxyterminus,N:aminoterminus.CThecis-elementofthepromoterregionupstreamoftheStSl-1geneDNAsequence:cis-1:TCAbox,aciselementinvolvedinsalicylicacidreaction;cis-2:TC-richbox,aciselementinvolvedindefenseandstressresponse;cis-3:TATAbox,acorepromoterelementthatstartstranscriptionnear-30;cis-*,otherciselements(DetailsaregiveninAppendix1andAppendix2).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物GRAS家族蛋白結構和功能的研究進展[J]. 殷龍飛,張中保,于榮,吳忠義. 分子植物育種. 2019(19)
[2]番茄青枯病生物防治策略研究[J]. 陳勝華. 農業(yè)與技術. 2018(06)
[3]馬鈴薯主要病害抗性育種研究進展[J]. 鄧仁菊,鄧寬平,何天久,雷尊國,陳恩發(fā). 西南農業(yè)學報. 2014(03)
[4]GRAS家族基因在植物生長、代謝及逆境脅迫中的功能研究進展[J]. 周蓮潔,張富春,王艷. 植物生理學報. 2013(09)
[5]葡萄SCARECROW基因家族的分析與表達[J]. 陳麗華,葛暉,柴麗娟,陳尚武,馬會勤. 中國農業(yè)大學學報. 2012(01)
[6]馬鈴薯青枯病抗性的分子標記[J]. 郜剛,屈冬玉,連勇,金黎平,馮蘭香. 園藝學報. 2000(01)
博士論文
[1]青枯菌誘導的馬鈴薯防衛(wèi)相關基因克隆與表達[D]. 郜剛.中國農業(yè)科學院 2008
碩士論文
[1]水稻GRAS轉錄因子家族的系統(tǒng)分析與功能研究[D]. 劉子瑋.南京大學 2018
[2]馬尾松GRAS家族SHR和SCR同源基因的克隆與功能初步分析[D]. 朱沛煌.南京林業(yè)大學 2016
本文編號:3476087
【文章來源】:山西師范大學山西省
【文章頁數】:75 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
ABA和NO3ˉ對擬南芥根尖中SCR基因的表達有調節(jié)作用(Harrisetal,2017)
山西師范大學碩士學位論文18圖3-1StSl-1基因的DNA序列和預測的氨基酸序列馬鈴薯StSl-1序列的全長。該圖顯示了StSl-1基因的核苷酸和氨基酸序列,共2139bp和537個氨基酸。其中CDS區(qū)為313bp-1926bp。Figure3-1DNAsequenceandthepredictedaminoacidsequenceThefullDNAsequenceofthepotatoStSl-1genewereshowed.ThisfigureshowsthenucleotideandaminoacidsequencesoftheStSl-1gene,whichis2139bpand537aminoacidsintotal.TheCDSregionis313bp-1926bp.
山西師范大學碩士學位論文20圖3-2StSl-1基因編碼SCL蛋白的保守結構域及其三級結構StSl-1基因堿基順序和蛋白質氨基酸殘基起止號顯示在示意框上方,氨基酸殘基及序號顯示在下方。AStSl-1的GRAS超家族結構域,pfam03514,氨基酸殘基169-537。BStSl-1羧基末端GRAS超家族結構域的三級結構,C:羧基末端,N:氨基末端。CStSl-1基因DNA序列上游啟動子區(qū)的順式元件:cis-1:TCAbox,涉及水楊酸反應的順式元件;cis-2:TC-richbox,參與防御和脅迫反應的順式元件;cis-3:TATAbox,在-30附近開始轉錄的核心啟動子元件;cis-*,其他順式元件(具體見附錄)。Figure3-2ConservedDomainandTertiarystructureofSCLproteinencodedbyStSl-1GeneThebasesequenceofStSl-1geneandthestartandstopnumberofproteinaminoacidresidueswereshownabovetheschematicbox,andtheaminoacidresiduesandsequencenumberswereshownbelow.ATheGRASsuperfamilydomainofStSl-1,pfam03514,aminoacidresidues169-537.BThetertiarystructureoftheStSl-1carboxy-terminalGRASsuperfamilydomain,C:carboxyterminus,N:aminoterminus.CThecis-elementofthepromoterregionupstreamoftheStSl-1geneDNAsequence:cis-1:TCAbox,aciselementinvolvedinsalicylicacidreaction;cis-2:TC-richbox,aciselementinvolvedindefenseandstressresponse;cis-3:TATAbox,acorepromoterelementthatstartstranscriptionnear-30;cis-*,otherciselements(DetailsaregiveninAppendix1andAppendix2).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物GRAS家族蛋白結構和功能的研究進展[J]. 殷龍飛,張中保,于榮,吳忠義. 分子植物育種. 2019(19)
[2]番茄青枯病生物防治策略研究[J]. 陳勝華. 農業(yè)與技術. 2018(06)
[3]馬鈴薯主要病害抗性育種研究進展[J]. 鄧仁菊,鄧寬平,何天久,雷尊國,陳恩發(fā). 西南農業(yè)學報. 2014(03)
[4]GRAS家族基因在植物生長、代謝及逆境脅迫中的功能研究進展[J]. 周蓮潔,張富春,王艷. 植物生理學報. 2013(09)
[5]葡萄SCARECROW基因家族的分析與表達[J]. 陳麗華,葛暉,柴麗娟,陳尚武,馬會勤. 中國農業(yè)大學學報. 2012(01)
[6]馬鈴薯青枯病抗性的分子標記[J]. 郜剛,屈冬玉,連勇,金黎平,馮蘭香. 園藝學報. 2000(01)
博士論文
[1]青枯菌誘導的馬鈴薯防衛(wèi)相關基因克隆與表達[D]. 郜剛.中國農業(yè)科學院 2008
碩士論文
[1]水稻GRAS轉錄因子家族的系統(tǒng)分析與功能研究[D]. 劉子瑋.南京大學 2018
[2]馬尾松GRAS家族SHR和SCR同源基因的克隆與功能初步分析[D]. 朱沛煌.南京林業(yè)大學 2016
本文編號:3476087
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