青枯菌誘導(dǎo)的馬鈴薯StSl-1基因的表達(dá)特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-04 16:28
馬鈴薯(Solanum tuberosum)在許多國家都是一種重要的主糧和經(jīng)濟(jì)作物。馬鈴薯也是病原體青枯菌(茄科雷爾氏菌Ralstonia solanacearum)的寄主,除此以外,冷、熱、旱、鹽等非生物脅迫因子對(duì)馬鈴薯生長栽培等有顯著影響。研究馬鈴薯抗病的分子機(jī)制,是保持和提高馬鈴薯產(chǎn)量的重點(diǎn)。在高等植物中,Scarecrow-like蛋白(SCL)是一個(gè)屬于GRAS家族的轉(zhuǎn)錄因子。SCL可以調(diào)節(jié)根系生長和細(xì)胞周期,也可以抵抗環(huán)境脅迫。SCL作為轉(zhuǎn)錄因子可以編碼參與植物的信息傳遞和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。植物特異的SCL轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)植物發(fā)育過程,參與抗脅迫反應(yīng)。然而到目前為止,馬鈴薯中的SCL基因研究較少。本研究從馬鈴薯抗病基因型ED13中獲得了Scarecrow-like 21(SCL21)基因的全長cDNA序列,命名為StSl-1。利用qRT-PCR技術(shù)分析了該基因受青枯菌誘導(dǎo)和受三種植物激素水楊酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)和脫落酸(ABA)激發(fā)的基因表達(dá)譜,并利用原位雜交技術(shù)分析了該基因表達(dá)的組織和細(xì)胞學(xué)定位。主要結(jié)果如下:序列分析表明該基因序列長2,139bp。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)St...
【文章來源】:山西師范大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ABA和NO3ˉ對(duì)擬南芥根尖中SCR基因的表達(dá)有調(diào)節(jié)作用(Harrisetal,2017)
山西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文18圖3-1StSl-1基因的DNA序列和預(yù)測(cè)的氨基酸序列馬鈴薯StSl-1序列的全長。該圖顯示了StSl-1基因的核苷酸和氨基酸序列,共2139bp和537個(gè)氨基酸。其中CDS區(qū)為313bp-1926bp。Figure3-1DNAsequenceandthepredictedaminoacidsequenceThefullDNAsequenceofthepotatoStSl-1genewereshowed.ThisfigureshowsthenucleotideandaminoacidsequencesoftheStSl-1gene,whichis2139bpand537aminoacidsintotal.TheCDSregionis313bp-1926bp.
山西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文20圖3-2StSl-1基因編碼SCL蛋白的保守結(jié)構(gòu)域及其三級(jí)結(jié)構(gòu)StSl-1基因堿基順序和蛋白質(zhì)氨基酸殘基起止號(hào)顯示在示意框上方,氨基酸殘基及序號(hào)顯示在下方。AStSl-1的GRAS超家族結(jié)構(gòu)域,pfam03514,氨基酸殘基169-537。BStSl-1羧基末端GRAS超家族結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu),C:羧基末端,N:氨基末端。CStSl-1基因DNA序列上游啟動(dòng)子區(qū)的順式元件:cis-1:TCAbox,涉及水楊酸反應(yīng)的順式元件;cis-2:TC-richbox,參與防御和脅迫反應(yīng)的順式元件;cis-3:TATAbox,在-30附近開始轉(zhuǎn)錄的核心啟動(dòng)子元件;cis-*,其他順式元件(具體見附錄)。Figure3-2ConservedDomainandTertiarystructureofSCLproteinencodedbyStSl-1GeneThebasesequenceofStSl-1geneandthestartandstopnumberofproteinaminoacidresidueswereshownabovetheschematicbox,andtheaminoacidresiduesandsequencenumberswereshownbelow.ATheGRASsuperfamilydomainofStSl-1,pfam03514,aminoacidresidues169-537.BThetertiarystructureoftheStSl-1carboxy-terminalGRASsuperfamilydomain,C:carboxyterminus,N:aminoterminus.CThecis-elementofthepromoterregionupstreamoftheStSl-1geneDNAsequence:cis-1:TCAbox,aciselementinvolvedinsalicylicacidreaction;cis-2:TC-richbox,aciselementinvolvedindefenseandstressresponse;cis-3:TATAbox,acorepromoterelementthatstartstranscriptionnear-30;cis-*,otherciselements(DetailsaregiveninAppendix1andAppendix2).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物GRAS家族蛋白結(jié)構(gòu)和功能的研究進(jìn)展[J]. 殷龍飛,張中保,于榮,吳忠義. 分子植物育種. 2019(19)
[2]番茄青枯病生物防治策略研究[J]. 陳勝華. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2018(06)
[3]馬鈴薯主要病害抗性育種研究進(jìn)展[J]. 鄧仁菊,鄧寬平,何天久,雷尊國,陳恩發(fā). 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(03)
[4]GRAS家族基因在植物生長、代謝及逆境脅迫中的功能研究進(jìn)展[J]. 周蓮潔,張富春,王艷. 植物生理學(xué)報(bào). 2013(09)
[5]葡萄SCARECROW基因家族的分析與表達(dá)[J]. 陳麗華,葛暉,柴麗娟,陳尚武,馬會(huì)勤. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)
[6]馬鈴薯青枯病抗性的分子標(biāo)記[J]. 郜剛,屈冬玉,連勇,金黎平,馮蘭香. 園藝學(xué)報(bào). 2000(01)
博士論文
[1]青枯菌誘導(dǎo)的馬鈴薯防衛(wèi)相關(guān)基因克隆與表達(dá)[D]. 郜剛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
碩士論文
[1]水稻GRAS轉(zhuǎn)錄因子家族的系統(tǒng)分析與功能研究[D]. 劉子瑋.南京大學(xué) 2018
[2]馬尾松GRAS家族SHR和SCR同源基因的克隆與功能初步分析[D]. 朱沛煌.南京林業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3476087
【文章來源】:山西師范大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ABA和NO3ˉ對(duì)擬南芥根尖中SCR基因的表達(dá)有調(diào)節(jié)作用(Harrisetal,2017)
山西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文18圖3-1StSl-1基因的DNA序列和預(yù)測(cè)的氨基酸序列馬鈴薯StSl-1序列的全長。該圖顯示了StSl-1基因的核苷酸和氨基酸序列,共2139bp和537個(gè)氨基酸。其中CDS區(qū)為313bp-1926bp。Figure3-1DNAsequenceandthepredictedaminoacidsequenceThefullDNAsequenceofthepotatoStSl-1genewereshowed.ThisfigureshowsthenucleotideandaminoacidsequencesoftheStSl-1gene,whichis2139bpand537aminoacidsintotal.TheCDSregionis313bp-1926bp.
山西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文20圖3-2StSl-1基因編碼SCL蛋白的保守結(jié)構(gòu)域及其三級(jí)結(jié)構(gòu)StSl-1基因堿基順序和蛋白質(zhì)氨基酸殘基起止號(hào)顯示在示意框上方,氨基酸殘基及序號(hào)顯示在下方。AStSl-1的GRAS超家族結(jié)構(gòu)域,pfam03514,氨基酸殘基169-537。BStSl-1羧基末端GRAS超家族結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu),C:羧基末端,N:氨基末端。CStSl-1基因DNA序列上游啟動(dòng)子區(qū)的順式元件:cis-1:TCAbox,涉及水楊酸反應(yīng)的順式元件;cis-2:TC-richbox,參與防御和脅迫反應(yīng)的順式元件;cis-3:TATAbox,在-30附近開始轉(zhuǎn)錄的核心啟動(dòng)子元件;cis-*,其他順式元件(具體見附錄)。Figure3-2ConservedDomainandTertiarystructureofSCLproteinencodedbyStSl-1GeneThebasesequenceofStSl-1geneandthestartandstopnumberofproteinaminoacidresidueswereshownabovetheschematicbox,andtheaminoacidresiduesandsequencenumberswereshownbelow.ATheGRASsuperfamilydomainofStSl-1,pfam03514,aminoacidresidues169-537.BThetertiarystructureoftheStSl-1carboxy-terminalGRASsuperfamilydomain,C:carboxyterminus,N:aminoterminus.CThecis-elementofthepromoterregionupstreamoftheStSl-1geneDNAsequence:cis-1:TCAbox,aciselementinvolvedinsalicylicacidreaction;cis-2:TC-richbox,aciselementinvolvedindefenseandstressresponse;cis-3:TATAbox,acorepromoterelementthatstartstranscriptionnear-30;cis-*,otherciselements(DetailsaregiveninAppendix1andAppendix2).
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物GRAS家族蛋白結(jié)構(gòu)和功能的研究進(jìn)展[J]. 殷龍飛,張中保,于榮,吳忠義. 分子植物育種. 2019(19)
[2]番茄青枯病生物防治策略研究[J]. 陳勝華. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2018(06)
[3]馬鈴薯主要病害抗性育種研究進(jìn)展[J]. 鄧仁菊,鄧寬平,何天久,雷尊國,陳恩發(fā). 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(03)
[4]GRAS家族基因在植物生長、代謝及逆境脅迫中的功能研究進(jìn)展[J]. 周蓮潔,張富春,王艷. 植物生理學(xué)報(bào). 2013(09)
[5]葡萄SCARECROW基因家族的分析與表達(dá)[J]. 陳麗華,葛暉,柴麗娟,陳尚武,馬會(huì)勤. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)
[6]馬鈴薯青枯病抗性的分子標(biāo)記[J]. 郜剛,屈冬玉,連勇,金黎平,馮蘭香. 園藝學(xué)報(bào). 2000(01)
博士論文
[1]青枯菌誘導(dǎo)的馬鈴薯防衛(wèi)相關(guān)基因克隆與表達(dá)[D]. 郜剛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
碩士論文
[1]水稻GRAS轉(zhuǎn)錄因子家族的系統(tǒng)分析與功能研究[D]. 劉子瑋.南京大學(xué) 2018
[2]馬尾松GRAS家族SHR和SCR同源基因的克隆與功能初步分析[D]. 朱沛煌.南京林業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3476087
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