疫苗免疫前后草魚(yú)腸組織的差異轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及關(guān)鍵基因的表達(dá)載體構(gòu)建與表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2021-11-04 11:24
擬態(tài)弧菌(Vibrio mimicus)是一種常見(jiàn)的病原弧菌,可引起養(yǎng)殖魚(yú)類嚴(yán)重的腹水病,給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)造成較大經(jīng)濟(jì)損失。為了有效防控魚(yú)類腹水病,本實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建了擬態(tài)弧菌雙靶向核酸疫苗,并經(jīng)動(dòng)物免疫試驗(yàn)證實(shí)該疫苗具有良好的腸黏膜免疫增強(qiáng)作用,但其確切分子調(diào)控機(jī)制尚不清楚,需要深入研究。高通量RNA測(cè)序技術(shù)是(RNA-seq)目前發(fā)展最成熟、應(yīng)用最廣的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法。該技術(shù)具有高通量、精確,無(wú)論有無(wú)物種基因組或基因信息,均能直接對(duì)物種進(jìn)行全面轉(zhuǎn)錄組分析,且可檢測(cè)到低豐度的稀有轉(zhuǎn)錄本等優(yōu)勢(shì),也為魚(yú)類黏膜免疫調(diào)控機(jī)制的研究提供了有效方法。對(duì)此,本課題在制備擬態(tài)弧菌雙靶向核酸疫苗的基礎(chǔ)上,以口灌方式免疫草魚(yú),利用RNA-seq技術(shù)對(duì)免疫前后草魚(yú)腸組織進(jìn)行差異轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,探明關(guān)鍵免疫相關(guān)的差異表達(dá)基因及其涉及通路,并構(gòu)建其表達(dá)載體。主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果總結(jié)如下:1)擬態(tài)弧菌雙靶向核酸疫苗制備、免疫及樣品采集。論文按照本實(shí)驗(yàn)室曹際建立的方法制備擬態(tài)弧菌雙靶向核酸疫苗。首先大量抽提擬態(tài)弧菌內(nèi)靶向核酸疫苗(pcDNA3.1-Iclp-Ovepis),然后制備大腸桿菌凍干菌蛻(DH5α-BG),最后將...
【文章來(lái)源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1免疫組與對(duì)照組草魚(yú)腸組織總RNA的提取??M:?DNA標(biāo)準(zhǔn)分子量:1-6:分別代表6份樣品(Ial、Ia2、丨a3、Ibl、Ib2、Ib3)中的總RNA
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于Iclp的擬態(tài)弧菌OmpUAP真核表達(dá)重組質(zhì)粒的構(gòu)建及其免疫效果初步評(píng)價(jià)[J]. 劉艷,丁淑荃,陶會(huì)竹,曹際,周昊,李槿年. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]擬態(tài)弧菌的綠色熒光蛋白標(biāo)記及其在感染草魚(yú)體內(nèi)的動(dòng)態(tài)分布[J]. 高會(huì)會(huì),侯立婷,李槿年,黃安寧. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[3]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物研究中的運(yùn)用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]應(yīng)用Pull-down方法檢測(cè)草魚(yú)恒定鏈(Ii)與主要組織相容性復(fù)合體(MHC)分子的結(jié)合[J]. 林海斌,張婭菲,楊聰鶯,羅蘭芳,楊磊,余為一,劉洪明,陳芳芳. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(06)
[5]新一代高通量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的處理與分析[J]. 王曦,汪小我,王立坤,馮智星,張學(xué)工. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2010(08)
[6]NLR:固有免疫模式識(shí)別受體中的一個(gè)重要家族[J]. 金伯泉. 現(xiàn)代免疫學(xué). 2006(03)
[7]黑鯛幼魚(yú)腹水病病原菌[J]. 王國(guó)良,鄭天倫,金珊,陸彤霞. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2003(01)
[8]弧菌屬細(xì)菌及其所致海水養(yǎng)殖動(dòng)物疾病[J]. 吳后波,潘金培. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2001(01)
博士論文
[1]草魚(yú)NF-κB信號(hào)通路激活及其調(diào)控的分子機(jī)制[D]. 王海舟.南昌大學(xué) 2017
[2]草魚(yú)核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域基因和γ-干擾素相關(guān)基因的克隆及其表達(dá)[D]. 陳文欽.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]擬態(tài)弧菌靶向DNA疫苗對(duì)腸巨噬細(xì)胞活性及抗原遞呈相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄的影響[D]. 陶會(huì)竹.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]草魚(yú)甘露糖受體基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 王莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]松江鱸(Trachidermus fasciatus)組織蛋白酶B和L的基因克隆、蛋白表達(dá)與表達(dá)模式分析[D]. 崔孟暄.山東大學(xué) 2012
[4]青島文昌魚(yú)ERK5,p38抗體的制備及體內(nèi)蛋白表達(dá)的初步研究[D]. 劉召民.山東大學(xué) 2012
[5]草魚(yú)(Ctenopharyngodon idella)Hsp90、Wap65基因的克隆、表達(dá)特性及功能分析[D]. 趙風(fēng)云.南昌大學(xué) 2011
本文編號(hào):3475628
【文章來(lái)源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1免疫組與對(duì)照組草魚(yú)腸組織總RNA的提取??M:?DNA標(biāo)準(zhǔn)分子量:1-6:分別代表6份樣品(Ial、Ia2、丨a3、Ibl、Ib2、Ib3)中的總RNA
aler.?34.367?0.?93?EffV?S3i>83???MeltCurVe???!=。?I?I雜:夢(mèng)^??50000?^^?000001????????0?000001?????????????????????????????K0?7〇i)?750?明?0?950?wo?MO?2?t?i?I?10?U?M???II?X?2?M?2?3?JD?B?K?X?丨?《??TwvefahxeCO?一?Cycle??附圖2??2A/基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線、熔解曲線和擴(kuò)增曲線??Appendix?.2?The?standard?curve,?amplification?curve?and?melt?cur\?e?of?a2M?gene??43??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于Iclp的擬態(tài)弧菌OmpUAP真核表達(dá)重組質(zhì)粒的構(gòu)建及其免疫效果初步評(píng)價(jià)[J]. 劉艷,丁淑荃,陶會(huì)竹,曹際,周昊,李槿年. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]擬態(tài)弧菌的綠色熒光蛋白標(biāo)記及其在感染草魚(yú)體內(nèi)的動(dòng)態(tài)分布[J]. 高會(huì)會(huì),侯立婷,李槿年,黃安寧. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[3]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物研究中的運(yùn)用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]應(yīng)用Pull-down方法檢測(cè)草魚(yú)恒定鏈(Ii)與主要組織相容性復(fù)合體(MHC)分子的結(jié)合[J]. 林海斌,張婭菲,楊聰鶯,羅蘭芳,楊磊,余為一,劉洪明,陳芳芳. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(06)
[5]新一代高通量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的處理與分析[J]. 王曦,汪小我,王立坤,馮智星,張學(xué)工. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2010(08)
[6]NLR:固有免疫模式識(shí)別受體中的一個(gè)重要家族[J]. 金伯泉. 現(xiàn)代免疫學(xué). 2006(03)
[7]黑鯛幼魚(yú)腹水病病原菌[J]. 王國(guó)良,鄭天倫,金珊,陸彤霞. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2003(01)
[8]弧菌屬細(xì)菌及其所致海水養(yǎng)殖動(dòng)物疾病[J]. 吳后波,潘金培. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2001(01)
博士論文
[1]草魚(yú)NF-κB信號(hào)通路激活及其調(diào)控的分子機(jī)制[D]. 王海舟.南昌大學(xué) 2017
[2]草魚(yú)核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域基因和γ-干擾素相關(guān)基因的克隆及其表達(dá)[D]. 陳文欽.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]擬態(tài)弧菌靶向DNA疫苗對(duì)腸巨噬細(xì)胞活性及抗原遞呈相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄的影響[D]. 陶會(huì)竹.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]草魚(yú)甘露糖受體基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 王莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]松江鱸(Trachidermus fasciatus)組織蛋白酶B和L的基因克隆、蛋白表達(dá)與表達(dá)模式分析[D]. 崔孟暄.山東大學(xué) 2012
[4]青島文昌魚(yú)ERK5,p38抗體的制備及體內(nèi)蛋白表達(dá)的初步研究[D]. 劉召民.山東大學(xué) 2012
[5]草魚(yú)(Ctenopharyngodon idella)Hsp90、Wap65基因的克隆、表達(dá)特性及功能分析[D]. 趙風(fēng)云.南昌大學(xué) 2011
本文編號(hào):3475628
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