日本沼蝦雌性性早熟相關(guān)基因的篩
發(fā)布時(shí)間:2021-11-02 02:41
日本沼蝦是一種具有很高經(jīng)濟(jì)價(jià)值的十足目甲殼動(dòng)物,是我國(guó)淡水養(yǎng)殖的主要種類之一。近年來(lái),由于日本沼蝦自然資源的銳減,其養(yǎng)殖規(guī)模不斷擴(kuò)大,但養(yǎng)殖的日本沼蝦卻出現(xiàn)了生產(chǎn)性能下降、種質(zhì)資源不斷退化的情況,最為嚴(yán)重的是出現(xiàn)性早熟現(xiàn)象。性早熟是指日本沼蝦提前進(jìn)入繁殖期,當(dāng)其尚未達(dá)到商品規(guī)格大小時(shí),性腺就已經(jīng)發(fā)育成熟,同時(shí)個(gè)體生長(zhǎng)停止,使蝦的商品率降低、產(chǎn)品貶值。性早熟的雌性個(gè)體還會(huì)產(chǎn)生低質(zhì)量的后代,這樣年復(fù)一年的繁育,加重了日本沼蝦種質(zhì)資源退化現(xiàn)象,制約了日本沼蝦養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。因此對(duì)雌性日本沼蝦的性早熟現(xiàn)象進(jìn)行研究,對(duì)性早熟相關(guān)基因進(jìn)行篩選和功能分析,對(duì)闡明日本沼蝦性早熟的分子機(jī)制,解決日本沼蝦種質(zhì)資源退化問(wèn)題具有重要的意義。本研究采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法,通過(guò)差異表達(dá)分析鑒別出了性早熟的和正常性成熟的日本沼蝦卵巢中的差異基因(DEGs),通過(guò)對(duì)這些DEGs的注釋、表達(dá)模式聚類分析,以及顯著富集性分析篩選出可能與日本沼蝦性早熟相關(guān)的基因;利用基因克隆和cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)PCR技術(shù)獲得了其中5個(gè)可能與日本沼蝦性早熟相關(guān)的基因的全長(zhǎng)cDNA序列,并對(duì)其序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析;利用實(shí)時(shí)熒...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:205 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)控制十足目甲殼動(dòng)物卵黃形成的模型
養(yǎng)殖環(huán)境及飼養(yǎng)管理一致,性早熟的蝦在同年 8 月份卵巢發(fā)育成熟,平均體長(zhǎng) 2.8 ± 0.8 cm,平均體重 1.0 ± 0.5 g。正常性成熟的蝦在第二年的 4 ~ 5 月份卵巢發(fā)育成熟,平均體長(zhǎng) 4.5 ± 0.5 cm,平均體重 3.5 ± 1.0 g(見(jiàn)圖 2-1)。卵巢發(fā)育成熟的判斷標(biāo)準(zhǔn)為:卵巢呈深綠色或墨綠色,卵膜表面分布有褐色斑點(diǎn),卵巢充滿了整個(gè)頭胸甲。A B
性早熟的(B)日本沼蝦卵巢組織總 RNl electrophoresis of total RNA in ovaries ofense (A) and sexually precocious M. nippon組裝2500 測(cè)序平臺(tái)對(duì)構(gòu)建的正常性成熟性早熟和正常性成熟蝦的卵巢中這些原始 reads 經(jīng)去除引物、接頭熟蝦的卵巢中獲得 42,115,012 和 5。測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)提交至 Genb為:SRP063589。原始數(shù)據(jù)經(jīng)從頭組36 個(gè) unigenes,unigene 為最長(zhǎng)的轉(zhuǎn)中,31,441 個(gè)(49.64%)為 1–4002%)為 601–800 bp、3,021 個(gè)(4.77 bp(圖 2-3A)。Unigenes 的最長(zhǎng)長(zhǎng)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]脊尾白蝦VgR基因克隆及其在卵巢發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)分析[J]. 梁俊平,李健,李吉濤,劉萍,劉德月. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(04)
[2]日本沼蝦卵巢發(fā)育的組織學(xué)與組織化學(xué)觀察[J]. 杜玉昕,邱高峰. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(13)
[3]脊尾白蝦(Exopalaemon carinicauda)vasa基因cDNA克隆及其在卵巢發(fā)育中的表達(dá)分析[J]. 徐文斐,劉萍,李吉濤,李健,陳萍. 海洋與湖沼. 2014(03)
[4]中國(guó)青蝦產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究( 六) 青蝦養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)進(jìn)一步發(fā)展的問(wèn)題與對(duì)策[J]. 李家樂(lè),陳藍(lán)蓀,劉其根. 水產(chǎn)科技情報(bào). 2011(06)
[5]擬穴青蟹vasa基因cDNA的特征分析與性腺特異表達(dá)[J]. 張鳳英,馬凌波,蔣科技,張丹,陳立僑. 海洋漁業(yè). 2010(04)
[6]日本沼蝦DEAD-box家族基因vasa和PL10的克隆及其在卵巢發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)[J]. 朱小玲. 海洋漁業(yè). 2010(02)
[7]前列腺素對(duì)禽類等級(jí)卵泡發(fā)育的影響[J]. 金艷梅. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2010(04)
[8]Cloning,characterization,and expression analysis of the DEAD-box family genes,Fc-vasa and Fc-PL10a,in Chinese shrimp (Fenneropenaeus chinensis)[J]. 周倩如,邵明瑜,秦貞奎,康慶浩,張志峰. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2010(01)
[9]日本沼蝦不同亞型維甲酸類X受體(RXR)cDNA克隆及序列分析[J]. 王文青,朱小玲. 淡水漁業(yè). 2010(01)
[10]卵母細(xì)胞減數(shù)分裂的調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 周榮,楊秀萍. 國(guó)際生殖健康/計(jì)劃生育雜志. 2008(02)
博士論文
[1]日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)卵黃蛋白原代謝相關(guān)基因的克隆和表達(dá)研究[D]. 趙衛(wèi)紅.華東師范大學(xué) 2011
[2]日本沼蝦卵巢表達(dá)序列標(biāo)簽分析及生殖相關(guān)基因的克隆與表達(dá)[D]. 吳萍.華東師范大學(xué) 2009
碩士論文
[1]中國(guó)明對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis)兩個(gè)DEAD-box家族基因Fc-vasa和Fc-PL10α的克隆和表達(dá)分析[D]. 周倩如.中國(guó)海洋大學(xué) 2007
本文編號(hào):3471176
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:205 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)控制十足目甲殼動(dòng)物卵黃形成的模型
養(yǎng)殖環(huán)境及飼養(yǎng)管理一致,性早熟的蝦在同年 8 月份卵巢發(fā)育成熟,平均體長(zhǎng) 2.8 ± 0.8 cm,平均體重 1.0 ± 0.5 g。正常性成熟的蝦在第二年的 4 ~ 5 月份卵巢發(fā)育成熟,平均體長(zhǎng) 4.5 ± 0.5 cm,平均體重 3.5 ± 1.0 g(見(jiàn)圖 2-1)。卵巢發(fā)育成熟的判斷標(biāo)準(zhǔn)為:卵巢呈深綠色或墨綠色,卵膜表面分布有褐色斑點(diǎn),卵巢充滿了整個(gè)頭胸甲。A B
性早熟的(B)日本沼蝦卵巢組織總 RNl electrophoresis of total RNA in ovaries ofense (A) and sexually precocious M. nippon組裝2500 測(cè)序平臺(tái)對(duì)構(gòu)建的正常性成熟性早熟和正常性成熟蝦的卵巢中這些原始 reads 經(jīng)去除引物、接頭熟蝦的卵巢中獲得 42,115,012 和 5。測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)提交至 Genb為:SRP063589。原始數(shù)據(jù)經(jīng)從頭組36 個(gè) unigenes,unigene 為最長(zhǎng)的轉(zhuǎn)中,31,441 個(gè)(49.64%)為 1–4002%)為 601–800 bp、3,021 個(gè)(4.77 bp(圖 2-3A)。Unigenes 的最長(zhǎng)長(zhǎng)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]脊尾白蝦VgR基因克隆及其在卵巢發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)分析[J]. 梁俊平,李健,李吉濤,劉萍,劉德月. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(04)
[2]日本沼蝦卵巢發(fā)育的組織學(xué)與組織化學(xué)觀察[J]. 杜玉昕,邱高峰. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(13)
[3]脊尾白蝦(Exopalaemon carinicauda)vasa基因cDNA克隆及其在卵巢發(fā)育中的表達(dá)分析[J]. 徐文斐,劉萍,李吉濤,李健,陳萍. 海洋與湖沼. 2014(03)
[4]中國(guó)青蝦產(chǎn)業(yè)發(fā)展研究( 六) 青蝦養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)進(jìn)一步發(fā)展的問(wèn)題與對(duì)策[J]. 李家樂(lè),陳藍(lán)蓀,劉其根. 水產(chǎn)科技情報(bào). 2011(06)
[5]擬穴青蟹vasa基因cDNA的特征分析與性腺特異表達(dá)[J]. 張鳳英,馬凌波,蔣科技,張丹,陳立僑. 海洋漁業(yè). 2010(04)
[6]日本沼蝦DEAD-box家族基因vasa和PL10的克隆及其在卵巢發(fā)育過(guò)程中的表達(dá)[J]. 朱小玲. 海洋漁業(yè). 2010(02)
[7]前列腺素對(duì)禽類等級(jí)卵泡發(fā)育的影響[J]. 金艷梅. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2010(04)
[8]Cloning,characterization,and expression analysis of the DEAD-box family genes,Fc-vasa and Fc-PL10a,in Chinese shrimp (Fenneropenaeus chinensis)[J]. 周倩如,邵明瑜,秦貞奎,康慶浩,張志峰. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2010(01)
[9]日本沼蝦不同亞型維甲酸類X受體(RXR)cDNA克隆及序列分析[J]. 王文青,朱小玲. 淡水漁業(yè). 2010(01)
[10]卵母細(xì)胞減數(shù)分裂的調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 周榮,楊秀萍. 國(guó)際生殖健康/計(jì)劃生育雜志. 2008(02)
博士論文
[1]日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)卵黃蛋白原代謝相關(guān)基因的克隆和表達(dá)研究[D]. 趙衛(wèi)紅.華東師范大學(xué) 2011
[2]日本沼蝦卵巢表達(dá)序列標(biāo)簽分析及生殖相關(guān)基因的克隆與表達(dá)[D]. 吳萍.華東師范大學(xué) 2009
碩士論文
[1]中國(guó)明對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis)兩個(gè)DEAD-box家族基因Fc-vasa和Fc-PL10α的克隆和表達(dá)分析[D]. 周倩如.中國(guó)海洋大學(xué) 2007
本文編號(hào):3471176
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