野茼蒿黃脈病毒的田間寄主范圍及其基因多樣性特征
發(fā)布時(shí)間:2021-11-01 00:09
為明確野茼蒿黃脈病毒(Crassocephalum yellow vein virus,CraYVV)的田間寄主范圍及其群體基因結(jié)構(gòu)特征,分別采用克隆和測序技術(shù)對(duì)采自云南省西雙版納傣族州、紅河哈尼族彝族自治州的7種雜草和2種作物進(jìn)行CraYVV的分離和鑒定,并通過生物信息學(xué)軟件對(duì)分離到的CraYVV進(jìn)行基因組結(jié)構(gòu)、重組及基因遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果顯示,在賽葵、龍葵、臭牡丹、水茄、豨薟、野茼蒿和一點(diǎn)紅7種雜草以及茄子和草莓2種作物中均分離到CraYVV,共獲得20條CraYVV全長序列;CraYVV所有分離物分屬2個(gè)株系,將其命名為YJ株系和JH株系;JH株系具有地理隔離特征,與YJ株系存在一定的遺傳距離;重組分析顯示,CraYVV是由煙草曲莖病毒(tobacco curly shoot virus,TbCSV)和云南煙草曲葉病毒(tobacco leaf curl Yunnan virus,TbLCYnV)重組產(chǎn)生;遺傳結(jié)構(gòu)分析顯示,CraYVV中C1基因變異最顯著,其次是C4基因和基因間隔區(qū)。表明CraYVV能侵染5科9種雜草和作物,具有較廣的寄主范圍,且菜豆金色花葉病毒屬病毒能夠侵染草...
【文章來源】:植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2020,47(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
云南省西雙版納州及紅河州田間感染野茼蒿黃脈病毒的植株癥狀
RDP重組分析顯示,本研究中CraYVV分離物YN5946-4、YN5947-10、YN5949-9、YN5951-3、YN5952-3、YN5953-6、YN5955-14、YN5958-18、YN5959-30、YN5960-35、YN6130-2、YN6136-43、YN6166-8以及GenBank下載的CraYVV分離物Jinghong(EF165536)和YYJi3(FN401520)的DNA序列中均檢測到1次明顯的重組事件。該重組事件顯示,以上CraYVV分離物是由TbCSV-282(AJ971266)和TbLCYnV-Y283(AJ971267)重組而來,TbCSV-282(AJ971266)是主要的母本,而TbLCYnV-Y283(AJ971267)則是次要的母本,重組區(qū)段位于以上分離物444~1 072 nt之間(V2和部分V1區(qū)),該區(qū)段來自TbLCYnV-Y283(表2)。表明上述重組事件普遍存在于CraYVV中,CraYVV可能是由TbCSV和TbLCYnV重組形成的病毒新種。2.6 CraYVV的遺傳結(jié)構(gòu)及進(jìn)化機(jī)制分析
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]云南賽葵上雙生病毒的分子鑒定[D]. 劉培.浙江大學(xué) 2008
本文編號(hào):3469134
【文章來源】:植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2020,47(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【部分圖文】:
云南省西雙版納州及紅河州田間感染野茼蒿黃脈病毒的植株癥狀
RDP重組分析顯示,本研究中CraYVV分離物YN5946-4、YN5947-10、YN5949-9、YN5951-3、YN5952-3、YN5953-6、YN5955-14、YN5958-18、YN5959-30、YN5960-35、YN6130-2、YN6136-43、YN6166-8以及GenBank下載的CraYVV分離物Jinghong(EF165536)和YYJi3(FN401520)的DNA序列中均檢測到1次明顯的重組事件。該重組事件顯示,以上CraYVV分離物是由TbCSV-282(AJ971266)和TbLCYnV-Y283(AJ971267)重組而來,TbCSV-282(AJ971266)是主要的母本,而TbLCYnV-Y283(AJ971267)則是次要的母本,重組區(qū)段位于以上分離物444~1 072 nt之間(V2和部分V1區(qū)),該區(qū)段來自TbLCYnV-Y283(表2)。表明上述重組事件普遍存在于CraYVV中,CraYVV可能是由TbCSV和TbLCYnV重組形成的病毒新種。2.6 CraYVV的遺傳結(jié)構(gòu)及進(jìn)化機(jī)制分析
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]云南賽葵上雙生病毒的分子鑒定[D]. 劉培.浙江大學(xué) 2008
本文編號(hào):3469134
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