鑒別腎透明細(xì)胞癌中與腫瘤微環(huán)境密切相關(guān)并具有預(yù)后價(jià)值的基因
發(fā)布時(shí)間:2021-10-31 23:32
背景:腎透明細(xì)胞癌(ccRCC)是腎腫瘤中最常見且預(yù)后相對較差的一種類型。隨著時(shí)代發(fā)展和當(dāng)代高通量測序技術(shù)的進(jìn)步,人們在分子層面上對腎透明細(xì)胞癌有了更深入的理解,然而目前其發(fā)生、進(jìn)展及轉(zhuǎn)移機(jī)制仍不清楚,并且缺乏有效的生物標(biāo)志物。近幾十年來,越來越多的研究表明,腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境之間的相互作用對預(yù)后有重要影響。免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞是腫瘤微環(huán)境的兩個(gè)重要組成部分。通過結(jié)合這兩種主要成分對腫瘤微環(huán)境進(jìn)行分析,尋找新的靶基因位點(diǎn),篩選出能夠判斷預(yù)后的新型分子標(biāo)志物,有助于為探究疾病發(fā)生發(fā)展提供新的研究思路,并為新型靶向藥物的研制提供基礎(chǔ)。研究目的:我們的研究旨在更好地理解和探索與腫瘤微環(huán)境密切相關(guān)并具有預(yù)后價(jià)值的基因,并對它們涉及的相關(guān)蛋白或通路進(jìn)行討論。研究方法:腎透明細(xì)胞癌患者的mRNA表達(dá)信息及臨床信息從TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)庫中獲得,每個(gè)患者的免疫/基質(zhì)評分通過ESTIMATE算法獲得。根據(jù)評分中位數(shù),將患者分為高分組和低分組。首先我們分別探討了免疫/基質(zhì)評分與WHO/ISUP分級和總生存率之間的關(guān)系。然后通過高低分組之間差異基因分析和生存分析獲得了...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.分析免疫/基質(zhì)評分下的DEGs
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本文編號:3469075
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
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