小黑楊轉(zhuǎn)錄因子PsnMYB108基因耐鹽脅迫功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-27 10:47
MYB轉(zhuǎn)錄因子家族作為植物最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,參與植物的整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程,在植物應(yīng)答外界逆境脅迫中非常重要。本研究以小黑楊(Populus simsonii×Pnigra)為材料,從本實(shí)驗(yàn)室前期篩選出的耐鹽基因中,選擇PsnMYB108基因作為研究對(duì)象進(jìn)行基因功能分析。結(jié)果如下:從小黑楊葉片中克隆出954bp的PsnMYB108基因的cDNA片段,其編碼的蛋白含有317個(gè)氨基酸,屬于不穩(wěn)定的親水蛋白,不存在信號(hào)肽,不具跨膜能力,含兩個(gè)MYB家族保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化樹表明,小黑楊PsnMYB108蛋白與毛果楊MYB108蛋白及胡楊、榴蓮、茶花、銀白楊、向日葵的MYB108-like蛋白具有較近的遺傳距離。PsnMYB108啟動(dòng)子中含有與植物抗逆相關(guān)的順式作用元件。亞細(xì)胞定位結(jié)果表明,PsnMYB108蛋白定位于細(xì)胞核中。PsnMYB108基因表達(dá)具有組織特異性,并受脅迫誘導(dǎo)表達(dá)。PsnMYB108基因在根中的相對(duì)表達(dá)水平明顯比在莖和葉中表達(dá)水平高。在鹽脅迫下,PsnMYB108基因表現(xiàn)上調(diào)表達(dá)。表明PsnMYB108基因可能與植物應(yīng)答高鹽脅迫相關(guān)。將PsnMYB108基因 ORF 分...
【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2小黑楊PwMZWfW基因的全長(zhǎng)??Fig.2-2?Full?length?oiPsnMYB108?gene??
2小黑楊PsnMVTWJOS基因的克隆及表達(dá)分析??謂??圖2-1小黑楊葉片總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)??Fig.2-1?Total?RNA?agarose?electrophoresis?detection?of?Populus?simonii^RnigJ-a?leave??2.?3.?2小黑楊Psa?/WKS:ZOS基因的克隆??將小黑楊RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA稀釋10倍后作為模板,以PotMFB/似-F、??乃《從757仰-R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增出一條長(zhǎng)度為954bp的DNA片段(圖??2-2)。??tvterker?PsnMYB108??1000bp???750bp?——?^4bP??5〇〇bp?—??250bp?????bp?1??H??圖2-2小黑楊PwMZWfW基因的全長(zhǎng)??Fig.2-2?Full?length?oiPsnMYB108?gene??將小黑楊徹基因與pMD19-T載體相連接,并導(dǎo)入大腸桿菌,挑取??5個(gè)白色斑點(diǎn),搖菌后進(jìn)行PCR反應(yīng),電泳檢測(cè)后仍能在凝膠成像儀下觀察到??954bp長(zhǎng)度片段,選擇目的條帶正確菌液送至生工測(cè)序,結(jié)果比對(duì)正確,表明??尸MM7570S基因與pMD19-T載體連接成功(圖2-3)。保留測(cè)序成功菌液備用。??20??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鹽脅迫下根瘤共生豌豆植株對(duì)外源鈣的生理響應(yīng)[J]. 馬紹英,馬蕾,徐勃,楊寧,張旭輝,柴強(qiáng),李勝. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]鹽堿地土壤利用與改良研究進(jìn)展[J]. 楊玉坤,耿計(jì)彪,于起慶,王嘉,于文勇,趙薇. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2019(24)
[3]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在林草植物抗逆性研究中的應(yīng)用[J]. 高慧娟,呂昕培,王潤(rùn)娟,任偉,程濟(jì)南,汪永平,邵坤仲,張金林. 草業(yè)學(xué)報(bào). 2019(12)
[4]鹽堿脅迫對(duì)植物形態(tài)和生理生化影響及植物響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 焦德志,趙澤龍. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(20)
[5]中國(guó)水稻遺傳學(xué)研究進(jìn)展與分子設(shè)計(jì)育種[J]. 郭韜,余泓,邱杰,李家洋,韓斌,林鴻宣. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2019(10)
[6]植物對(duì)鹽脅迫的響應(yīng)及耐鹽調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 王康君,樊繼偉,陳鳳,李強(qiáng),孫中偉,郭明明,張廣旭,鄭國(guó)良. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(12)
[7]中間錦雞兒CiMYB15基因正調(diào)控?cái)M南芥黃酮代謝[J]. 柴文娟,楊杞,李國(guó)婧,王瑞剛. 中國(guó)生物工程雜志. 2018(10)
[8]我國(guó)鹽堿地綠化研究進(jìn)展與展望[J]. 朱建峰,崔振榮,吳春紅,鄧丞,陳軍華,張華新. 世界林業(yè)研究. 2018(04)
[9]中國(guó)科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所在植物抗逆分子育種候選基因研究方面獲進(jìn)展[J]. 干旱區(qū)地理. 2017(02)
[10]荷花R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子NnMYB4對(duì)擬南芥木質(zhì)素合成的影響[J]. 李針針,劉兆磊,陳發(fā)棣,蔣甲福,陳素梅. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(06)
博士論文
[1]棉花R2R3-MYB基因家族海陸種間序列變異及與纖維性狀的相關(guān)性分析[D]. 王諾菡.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]玫瑰MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控類黃酮介導(dǎo)的逆境響應(yīng)機(jī)制研究[D]. 申玉曉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]棉花基因GhWRKY6-like和GhMYB108-like在非生物逆境方面的功能解析[D]. ABID ULLAH.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]毛竹生殖器官發(fā)育相關(guān)miRNA挖掘與miR159-GAMYB途徑對(duì)花藥發(fā)育調(diào)控研究[D]. 侯丹.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2018
[5]植物激素脫落酸的受體蛋白PYL8和PYL9通過(guò)結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子MYB家族成員調(diào)控?cái)M南芥的側(cè)根生長(zhǎng)[D]. 邢璐.中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2016
[6]楊樹轉(zhuǎn)錄因子ERF76基因耐鹽功能研究[D]. 姚文靜.東北林業(yè)大學(xué) 2016
[7]白樺BplMYB46基因調(diào)控抗旱耐鹽和次生壁形成的分子機(jī)理[D]. 國(guó)會(huì)艷.東北林業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]擬南芥MYB6調(diào)控莖頂端生長(zhǎng)點(diǎn)大小的機(jī)制研究[D]. 劉祥政.山東大學(xué) 2019
[2]丹參SmMYB36基因?qū)祁惡捅奖榇x途徑調(diào)控的研究[D]. 趙英.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]小麥轉(zhuǎn)錄因子TaMYB108基因的克隆、表達(dá)分析及耐鹽功能的研究[D]. 王睿斌.華中科技大學(xué) 2017
[4]84K楊轉(zhuǎn)錄因子NAC57基因耐鹽脅迫功能分析[D]. 李晰妍.東北林業(yè)大學(xué) 2017
[5]桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)及黃酮合成相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 陳泓宇.西南大學(xué) 2015
本文編號(hào):3461447
【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2小黑楊PwMZWfW基因的全長(zhǎng)??Fig.2-2?Full?length?oiPsnMYB108?gene??
2小黑楊PsnMVTWJOS基因的克隆及表達(dá)分析??謂??圖2-1小黑楊葉片總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)??Fig.2-1?Total?RNA?agarose?electrophoresis?detection?of?Populus?simonii^RnigJ-a?leave??2.?3.?2小黑楊Psa?/WKS:ZOS基因的克隆??將小黑楊RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA稀釋10倍后作為模板,以PotMFB/似-F、??乃《從757仰-R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增出一條長(zhǎng)度為954bp的DNA片段(圖??2-2)。??tvterker?PsnMYB108??1000bp???750bp?——?^4bP??5〇〇bp?—??250bp?????bp?1??H??圖2-2小黑楊PwMZWfW基因的全長(zhǎng)??Fig.2-2?Full?length?oiPsnMYB108?gene??將小黑楊徹基因與pMD19-T載體相連接,并導(dǎo)入大腸桿菌,挑取??5個(gè)白色斑點(diǎn),搖菌后進(jìn)行PCR反應(yīng),電泳檢測(cè)后仍能在凝膠成像儀下觀察到??954bp長(zhǎng)度片段,選擇目的條帶正確菌液送至生工測(cè)序,結(jié)果比對(duì)正確,表明??尸MM7570S基因與pMD19-T載體連接成功(圖2-3)。保留測(cè)序成功菌液備用。??20??
東北林業(yè)大學(xué)碩士論文??M?1?2?3?4?5??2000hp???10OObp???7s〇bp??????250bp?一??1〇〇bp?-??圖2-3小黑楊/^?Mra7似基因與pMD19-T載體連接菌液PCR??Fig.2-3?PCR?of?PsnMYB108?gene?linked?to?T?vector??2.?3.?3小黑楊PS/7/WY8彳OS基因生物信息學(xué)分析??2.?3.?3.?1小黑楊PsnMYB108蛋白基本理化性質(zhì)分析及二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)??從小黑楊cDNA模板中克隆獲得954bp的基因cDNA片段,編??碼317個(gè)氨基酸,含20種氨基酸(圖2-4),具完整的開放閱讀框。PsnMYB108??蛋白的化學(xué)式SC1569H24mN4550?496S16,等電點(diǎn)(PI)為5.93,不穩(wěn)定系數(shù)為49.31,??屬于不穩(wěn)定蛋白。??121?10.1??藝?1〇-?6.2??W?3-5.6?6.3?s?5'9?5.3??4fl?,?_?57?5?5??菡?I?I?a?■?^4-1?3?24'1?44??3.S44??5?llllldllmH.illiii??嘗11^550!蘭3昱111沒(méi)f蘭蘭5??圖2-4?PsnMYB108蛋白編碼氨基酸含量??Fig.2-4?Secondary?structure?of?PsnMYB108?protein??利用在線軟件SOPMA對(duì)小黑楊PsnMYB108蛋白的氨基酸序列進(jìn)行二級(jí)結(jié)??構(gòu)預(yù)測(cè),結(jié)果表明該蛋白主要由無(wú)規(guī)則卷曲(53.77%)、a-螺旋(39.62%)、??延伸鏈(4.40%)、B-折疊(2.20%)組成(圖?2-5,表?2-
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鹽脅迫下根瘤共生豌豆植株對(duì)外源鈣的生理響應(yīng)[J]. 馬紹英,馬蕾,徐勃,楊寧,張旭輝,柴強(qiáng),李勝. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]鹽堿地土壤利用與改良研究進(jìn)展[J]. 楊玉坤,耿計(jì)彪,于起慶,王嘉,于文勇,趙薇. 農(nóng)業(yè)與技術(shù). 2019(24)
[3]轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在林草植物抗逆性研究中的應(yīng)用[J]. 高慧娟,呂昕培,王潤(rùn)娟,任偉,程濟(jì)南,汪永平,邵坤仲,張金林. 草業(yè)學(xué)報(bào). 2019(12)
[4]鹽堿脅迫對(duì)植物形態(tài)和生理生化影響及植物響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 焦德志,趙澤龍. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(20)
[5]中國(guó)水稻遺傳學(xué)研究進(jìn)展與分子設(shè)計(jì)育種[J]. 郭韜,余泓,邱杰,李家洋,韓斌,林鴻宣. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2019(10)
[6]植物對(duì)鹽脅迫的響應(yīng)及耐鹽調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 王康君,樊繼偉,陳鳳,李強(qiáng),孫中偉,郭明明,張廣旭,鄭國(guó)良. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(12)
[7]中間錦雞兒CiMYB15基因正調(diào)控?cái)M南芥黃酮代謝[J]. 柴文娟,楊杞,李國(guó)婧,王瑞剛. 中國(guó)生物工程雜志. 2018(10)
[8]我國(guó)鹽堿地綠化研究進(jìn)展與展望[J]. 朱建峰,崔振榮,吳春紅,鄧丞,陳軍華,張華新. 世界林業(yè)研究. 2018(04)
[9]中國(guó)科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所在植物抗逆分子育種候選基因研究方面獲進(jìn)展[J]. 干旱區(qū)地理. 2017(02)
[10]荷花R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子NnMYB4對(duì)擬南芥木質(zhì)素合成的影響[J]. 李針針,劉兆磊,陳發(fā)棣,蔣甲福,陳素梅. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(06)
博士論文
[1]棉花R2R3-MYB基因家族海陸種間序列變異及與纖維性狀的相關(guān)性分析[D]. 王諾菡.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[2]玫瑰MYB轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控類黃酮介導(dǎo)的逆境響應(yīng)機(jī)制研究[D]. 申玉曉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[3]棉花基因GhWRKY6-like和GhMYB108-like在非生物逆境方面的功能解析[D]. ABID ULLAH.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]毛竹生殖器官發(fā)育相關(guān)miRNA挖掘與miR159-GAMYB途徑對(duì)花藥發(fā)育調(diào)控研究[D]. 侯丹.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2018
[5]植物激素脫落酸的受體蛋白PYL8和PYL9通過(guò)結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子MYB家族成員調(diào)控?cái)M南芥的側(cè)根生長(zhǎng)[D]. 邢璐.中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2016
[6]楊樹轉(zhuǎn)錄因子ERF76基因耐鹽功能研究[D]. 姚文靜.東北林業(yè)大學(xué) 2016
[7]白樺BplMYB46基因調(diào)控抗旱耐鹽和次生壁形成的分子機(jī)理[D]. 國(guó)會(huì)艷.東北林業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]擬南芥MYB6調(diào)控莖頂端生長(zhǎng)點(diǎn)大小的機(jī)制研究[D]. 劉祥政.山東大學(xué) 2019
[2]丹參SmMYB36基因?qū)祁惡捅奖榇x途徑調(diào)控的研究[D]. 趙英.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2019
[3]小麥轉(zhuǎn)錄因子TaMYB108基因的克隆、表達(dá)分析及耐鹽功能的研究[D]. 王睿斌.華中科技大學(xué) 2017
[4]84K楊轉(zhuǎn)錄因子NAC57基因耐鹽脅迫功能分析[D]. 李晰妍.東北林業(yè)大學(xué) 2017
[5]桑樹MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)及黃酮合成相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 陳泓宇.西南大學(xué) 2015
本文編號(hào):3461447
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