種子萌發(fā)是出苗的前提,在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)栽培實(shí)踐中,快速和整齊的種子萌發(fā)是作物單產(chǎn)最大化的關(guān)鍵,因此挖掘與種子萌發(fā)相關(guān)的基因位點(diǎn)或基因具有重要意義。隨著基因組測序技術(shù)的進(jìn)步及測序成本的降低,使得在棉花中利用全基因組關(guān)聯(lián)分析技術(shù)（Genome-wide association study,GWAS）進(jìn)行基因發(fā)掘成為可能。本研究對479份陸地棉材料浸種后24 h和48 h的種子萌發(fā)相關(guān)的3個(gè)性狀種皮突破率、胚乳突破率和胚根伸長率共6個(gè)表型數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)查,結(jié)合3 338 736個(gè)SNP標(biāo)記,進(jìn)行全基因關(guān)聯(lián)分析,并對候選基因進(jìn)行了基因克隆及功能分析,結(jié)果如下:1.我們鑒定出了294個(gè)與種子萌發(fā)顯著相關(guān)的基因位點(diǎn),根據(jù)單倍型分析,預(yù)測出27個(gè)與種子萌發(fā)相關(guān)的候選基因。我們根據(jù)候選基因在棉花不同組織的表達(dá)水平、擬南芥中同源基因注釋和SNP顯著性分析及其造成的氨基酸變化,從27個(gè)候選基因中篩選出了3個(gè)基因GhMIEL1,GhDRM1和GhGlcD1,經(jīng)過基因克隆及功能分析,驗(yàn)證確實(shí)與種子萌發(fā)相關(guān)。所鑒定的基因位點(diǎn)或基因可以為棉花種子迅速而整齊的發(fā)芽提供依據(jù),從而推動(dòng)棉花的產(chǎn)業(yè)發(fā)展。2.對GhMIEL1進(jìn)行時(shí)空... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：87 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

種子萌發(fā)性狀的頻率分布圖

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文3結(jié)果與分析21A02、A03、A04、A05、A06、A07、A08、A10、A11和D10染色體上，其中D10染色體上多次重復(fù)檢測到關(guān)聯(lián)位點(diǎn)，有45個(gè)。圖3.2種子萌發(fā)性狀的QQ圖。A：24h種皮突破率；B：24h胚乳突破率；C：24h胚根伸長率；D：48h種皮突破率；E：48h胚乳突破率；F：48h胚根伸長率。Figure3.2Quantile-quantileplots(QQplots)ofseedgerminationtraits.A:24htestabreakthrough

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文3結(jié)果與分析31圖3.5候選基因在棉花中35個(gè)組織的表達(dá)熱圖。Figure3.5Heatmapforexpressionlevelofthecandidategenesin35tissues表3.6GhMIEL1和GhDRM1基因SNP分類Table3.6SNPclassificationofGhMIEL1和GhDRM1基因品種數(shù)量SNP基因型GeneNumberofvarietiesSNPGenotypeGhMIEL1430AATypeA14TTTypeBGhDRM1348GGTypeA42AATypeB


本文編號：3456936