miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-25 06:08
目的應(yīng)用生物信息學(xué)分析方法預(yù)測(cè)miR-4472的靶基因及信號(hào)通路。方法利用miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)分析miR-4472的物種保守性;利用Targetscan、miRDB數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),再用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)將miR-4472的預(yù)測(cè)靶基因集合進(jìn)行基因本體(GO)功能富集分析及京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)生物通路富集分析。結(jié)果 miR-4472預(yù)測(cè)的交集靶基因共378個(gè)。GO分析結(jié)果顯示,miR-4472的靶基因主要參與轉(zhuǎn)錄的正負(fù)調(diào)節(jié)、細(xì)胞凋亡、蛋白質(zhì)磷酸化等生物過(guò)程(均P<0.01)。KEGG信號(hào)通路分析結(jié)果顯示,miR-4472的靶基因顯著富集于PI3K-Akt信號(hào)通路、胰高血糖素相關(guān)信號(hào)通路、心肌細(xì)胞中的腎上腺素能信號(hào)傳導(dǎo)通路、醛固酮的合成和分泌相關(guān)信號(hào)通路(均P<0.05)。結(jié)論 miR-4472靶基因富集的信號(hào)通路均與新生兒缺氧缺血性腦病密切相關(guān),尤其是P13K/AKt信號(hào)通路。
【文章來(lái)源】:浙江醫(yī)學(xué). 2020,42(13)
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 miR-4472的物種保守性分析
1.2 miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)
1.3 miR-4472預(yù)測(cè)靶基因的生物功能及信號(hào)通路富集分析
2 結(jié)果
2.1 miR-4472的物種保守性分析
2.2 miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)
2.3 miR-4472預(yù)測(cè)靶基因的生物功能及信號(hào)通路分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]窒息新生兒發(fā)生多器官損害的影響因素及臨床結(jié)局研究[J]. 魏洪偉. 中國(guó)衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)管理. 2017(27)
[2]血清miRNA-181a在帕金森病中神經(jīng)保護(hù)作用及機(jī)制分析[J]. 孔程程,楊文平,華建,劉妍,丁海霞. 南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(09)
[3]miRNA表達(dá)譜在缺氧缺血性腦病新生兒血漿中的變化及意義[J]. 張旭,朱雯,何夢(mèng)藻,侯秋英,沈方方,張佩華,滕懿群. 浙江醫(yī)學(xué). 2017(16)
[4]PI3K/Akt和MAPK信號(hào)通路在缺血性腦損傷中的保護(hù)作用[J]. 郁迪,莫緒明. 醫(yī)學(xué)綜述. 2015(02)
[5]miRNA調(diào)控腦膠質(zhì)瘤癌基因表達(dá)研究進(jìn)展[J]. 郝棟,胡世頡,董琛. 中華神經(jīng)外科疾病研究雜志. 2013(05)
本文編號(hào):3456805
【文章來(lái)源】:浙江醫(yī)學(xué). 2020,42(13)
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 miR-4472的物種保守性分析
1.2 miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)
1.3 miR-4472預(yù)測(cè)靶基因的生物功能及信號(hào)通路富集分析
2 結(jié)果
2.1 miR-4472的物種保守性分析
2.2 miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)
2.3 miR-4472預(yù)測(cè)靶基因的生物功能及信號(hào)通路分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]窒息新生兒發(fā)生多器官損害的影響因素及臨床結(jié)局研究[J]. 魏洪偉. 中國(guó)衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)管理. 2017(27)
[2]血清miRNA-181a在帕金森病中神經(jīng)保護(hù)作用及機(jī)制分析[J]. 孔程程,楊文平,華建,劉妍,丁海霞. 南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(09)
[3]miRNA表達(dá)譜在缺氧缺血性腦病新生兒血漿中的變化及意義[J]. 張旭,朱雯,何夢(mèng)藻,侯秋英,沈方方,張佩華,滕懿群. 浙江醫(yī)學(xué). 2017(16)
[4]PI3K/Akt和MAPK信號(hào)通路在缺血性腦損傷中的保護(hù)作用[J]. 郁迪,莫緒明. 醫(yī)學(xué)綜述. 2015(02)
[5]miRNA調(diào)控腦膠質(zhì)瘤癌基因表達(dá)研究進(jìn)展[J]. 郝棟,胡世頡,董琛. 中華神經(jīng)外科疾病研究雜志. 2013(05)
本文編號(hào):3456805
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