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miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-10-25 06:08
  目的應(yīng)用生物信息學(xué)分析方法預(yù)測(cè)miR-4472的靶基因及信號(hào)通路。方法利用miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)分析miR-4472的物種保守性;利用Targetscan、miRDB數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),再用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)將miR-4472的預(yù)測(cè)靶基因集合進(jìn)行基因本體(GO)功能富集分析及京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)生物通路富集分析。結(jié)果 miR-4472預(yù)測(cè)的交集靶基因共378個(gè)。GO分析結(jié)果顯示,miR-4472的靶基因主要參與轉(zhuǎn)錄的正負(fù)調(diào)節(jié)、細(xì)胞凋亡、蛋白質(zhì)磷酸化等生物過(guò)程(均P<0.01)。KEGG信號(hào)通路分析結(jié)果顯示,miR-4472的靶基因顯著富集于PI3K-Akt信號(hào)通路、胰高血糖素相關(guān)信號(hào)通路、心肌細(xì)胞中的腎上腺素能信號(hào)傳導(dǎo)通路、醛固酮的合成和分泌相關(guān)信號(hào)通路(均P<0.05)。結(jié)論 miR-4472靶基因富集的信號(hào)通路均與新生兒缺氧缺血性腦病密切相關(guān),尤其是P13K/AKt信號(hào)通路。 

【文章來(lái)源】:浙江醫(yī)學(xué). 2020,42(13)

【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 miR-4472的物種保守性分析
    1.2 miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)
    1.3 miR-4472預(yù)測(cè)靶基因的生物功能及信號(hào)通路富集分析
2 結(jié)果
    2.1 miR-4472的物種保守性分析
    2.2 miR-4472的靶基因預(yù)測(cè)
    2.3 miR-4472預(yù)測(cè)靶基因的生物功能及信號(hào)通路分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[5]miRNA調(diào)控腦膠質(zhì)瘤癌基因表達(dá)研究進(jìn)展[J]. 郝棟,胡世頡,董琛.  中華神經(jīng)外科疾病研究雜志. 2013(05)



本文編號(hào):3456805

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