鹽脅迫下甜高粱WRKY50基因的功能分析
發(fā)布時間:2021-10-24 05:15
WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族參與植物對逆境的響應(yīng),該家族成員均含有一個保守的WRKY結(jié)構(gòu)域,可通過結(jié)合下游靶基因啟動子區(qū)的W-box來調(diào)節(jié)植物的生理生化反應(yīng)。本試驗中,我們從轉(zhuǎn)錄組中篩選出一個甜高粱SbWRKY50(Sb09G005700)基因,并將該基因在野生型擬南芥中過量表達(dá)獲得過表達(dá)株系W50-12,W50-13。利用在線網(wǎng)站對該基因的生物信息學(xué)進(jìn)行了分析,構(gòu)建了帶有GFP標(biāo)簽的載體對SbWRKY50的定位進(jìn)行分析,構(gòu)建了pGBKT7-SbWRKY50載體對其進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄活性分析。測定和分析了鹽處理下野生型和過表達(dá)植株在萌發(fā)期和苗期的各項生理指標(biāo),并篩選到該基因調(diào)控的下游靶基因,并通過熒光定量PCR、酵母單雜交和熒光素酶互補(bǔ)實驗進(jìn)行驗證,闡明該基因調(diào)控植物抗鹽的作用機(jī)制。本研究的主要結(jié)論是:1、SbWRKY50的CDS序列全長621bp,共編碼207個氨基酸,其N端具有一個保守的WRKY結(jié)構(gòu)域,C端具有一個C2H2的鋅指結(jié)構(gòu),屬于典型的II類WRKY家族蛋白。該蛋白的分子式為C969H1453N
【文章來源】:山東師范大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SbWRKY50的氨基酸序列(A)和結(jié)構(gòu)域(B)
山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文72.2SbWRKY50蛋白序列的親疏水性分析圖2-2.SbWRKY50蛋白的親疏水性分析Fig.2-2.HydrophilicanalysisofSbWRKY50protein通過ExPASy在線網(wǎng)站對SbWRKY50蛋白序列進(jìn)行親疏水性分析,在該分析中,分值越大表示蛋白的疏水性越強(qiáng)。從圖2-2可看出,SbWRKY50蛋白的分值大部分都是大于0的,所以SbWRKY50為疏水蛋白。2.3SbWRKY50信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測及分析通過TMHMM、Signal-5.0在線網(wǎng)站來分析SbWRKY50蛋白,從圖2-3中可看出,SbWRKY50蛋白既無信號肽也無跨膜結(jié)構(gòu)域。
山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文8圖2-3.SbWRKY50蛋白的信號肽(A)及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(B)Fig.2-3.Signalpeptide(A)andtransmembranestructureprediction(B)ofSbWRKY502.4SbWRKY50蛋白與其他同源蛋白的關(guān)系通過DNAMAN軟件對甜高粱SbWRKY50蛋白序列和其他物種中的同源蛋白序列進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)他們都有WRKYGQK核心序列和C2H2型鋅指結(jié)構(gòu),同源性比較高,因此SbWRKY50蛋白屬于WRKY家族分類的第II類(圖2-4A)。通過MEGA6軟件對這些同源基因建立系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),SbWRKY50蛋白與PhWRKY51蛋白親緣關(guān)系最近(圖2-4B)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鹽堿脅迫對植物形態(tài)和生理生化影響及植物響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 焦德志,趙澤龍. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(20)
[2]甜高粱角蛋白基因的分離及功能分析[J]. 宋玉雙,隋娜. 聊城大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2019(04)
[3]鹽脅迫對不同品種玉米苗期生長與葉片光合特性的影響[J]. 李文陽,胡秀娟,王長進(jìn),韓坤龍. 生態(tài)科學(xué). 2019(02)
[4]鹽脅迫對紫花苜蓿根系形態(tài)特征和水分利用效率的影響[J]. 黃依婷,郭鵬,許涵杰. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(04)
[5]植物耐鹽相關(guān)的生理生化機(jī)制[J]. 屈芳芳. 河南科技. 2015(23)
[6]鹽脅迫對石斛蘭根系特性的影響[J]. 張吉起,孟長軍. 吉林農(nóng)業(yè). 2015(01)
[7]NaCl脅迫對不同耐鹽性玉米自交系萌動種子和幼苗離子穩(wěn)態(tài)的影響[J]. 彭云玲,保杰,葉龍山,王永健,燕利斌. 生態(tài)學(xué)報. 2014(24)
[8]鹽脅迫對棉花光合作用和生理指標(biāo)的影響[J]. 吳曉東,王巍,金路路,徐敏,李書濤,王子勝. 中國棉花. 2013(06)
[9]鹽脅迫對甜高粱種子吸水和萌發(fā)的影響[J]. 周桂生,安琳琳,童晨,劉貴娟,夏玉榮,陸建飛,封超年. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[10]鹽脅迫對擬南芥葉片和下表皮細(xì)胞大小的影響[J]. 侯蕾,陳龍俊. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(13)
碩士論文
[1]利用酵母雙雜交技術(shù)篩選與馬鈴薯StSOD1互作的調(diào)控蛋白[D]. 車育章.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]不同生境鹽地堿蓬根系拒鹽機(jī)制研究[D]. 劉晴晴.山東師范大學(xué) 2018
[3]水稻轉(zhuǎn)錄因子OsWRKY63在低溫脅迫中的功能研究[D]. 張明星.吉林大學(xué) 2018
[4]鹽脅迫下甜高粱NADP-ME基因的功能分析[D]. 郭元元.山東師范大學(xué) 2017
[5]鹽脅迫下鹽地堿蓬甘油-3-磷酸;D(zhuǎn)移酶基因的功能分析[D]. 王明杰.山東師范大學(xué) 2016
[6]NaCl脅迫對同德小花堿茅和朝鮮堿茅幼苗生理特性及葉片顯微結(jié)構(gòu)的影響[D]. 周學(xué)麗.青海大學(xué) 2009
本文編號:3454649
【文章來源】:山東師范大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SbWRKY50的氨基酸序列(A)和結(jié)構(gòu)域(B)
山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文72.2SbWRKY50蛋白序列的親疏水性分析圖2-2.SbWRKY50蛋白的親疏水性分析Fig.2-2.HydrophilicanalysisofSbWRKY50protein通過ExPASy在線網(wǎng)站對SbWRKY50蛋白序列進(jìn)行親疏水性分析,在該分析中,分值越大表示蛋白的疏水性越強(qiáng)。從圖2-2可看出,SbWRKY50蛋白的分值大部分都是大于0的,所以SbWRKY50為疏水蛋白。2.3SbWRKY50信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測及分析通過TMHMM、Signal-5.0在線網(wǎng)站來分析SbWRKY50蛋白,從圖2-3中可看出,SbWRKY50蛋白既無信號肽也無跨膜結(jié)構(gòu)域。
山東師范大學(xué)碩士學(xué)位論文8圖2-3.SbWRKY50蛋白的信號肽(A)及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(B)Fig.2-3.Signalpeptide(A)andtransmembranestructureprediction(B)ofSbWRKY502.4SbWRKY50蛋白與其他同源蛋白的關(guān)系通過DNAMAN軟件對甜高粱SbWRKY50蛋白序列和其他物種中的同源蛋白序列進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)他們都有WRKYGQK核心序列和C2H2型鋅指結(jié)構(gòu),同源性比較高,因此SbWRKY50蛋白屬于WRKY家族分類的第II類(圖2-4A)。通過MEGA6軟件對這些同源基因建立系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),SbWRKY50蛋白與PhWRKY51蛋白親緣關(guān)系最近(圖2-4B)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鹽堿脅迫對植物形態(tài)和生理生化影響及植物響應(yīng)的研究進(jìn)展[J]. 焦德志,趙澤龍. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(20)
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[3]鹽脅迫對不同品種玉米苗期生長與葉片光合特性的影響[J]. 李文陽,胡秀娟,王長進(jìn),韓坤龍. 生態(tài)科學(xué). 2019(02)
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[8]鹽脅迫對棉花光合作用和生理指標(biāo)的影響[J]. 吳曉東,王巍,金路路,徐敏,李書濤,王子勝. 中國棉花. 2013(06)
[9]鹽脅迫對甜高粱種子吸水和萌發(fā)的影響[J]. 周桂生,安琳琳,童晨,劉貴娟,夏玉榮,陸建飛,封超年. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
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碩士論文
[1]利用酵母雙雜交技術(shù)篩選與馬鈴薯StSOD1互作的調(diào)控蛋白[D]. 車育章.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]不同生境鹽地堿蓬根系拒鹽機(jī)制研究[D]. 劉晴晴.山東師范大學(xué) 2018
[3]水稻轉(zhuǎn)錄因子OsWRKY63在低溫脅迫中的功能研究[D]. 張明星.吉林大學(xué) 2018
[4]鹽脅迫下甜高粱NADP-ME基因的功能分析[D]. 郭元元.山東師范大學(xué) 2017
[5]鹽脅迫下鹽地堿蓬甘油-3-磷酸;D(zhuǎn)移酶基因的功能分析[D]. 王明杰.山東師范大學(xué) 2016
[6]NaCl脅迫對同德小花堿茅和朝鮮堿茅幼苗生理特性及葉片顯微結(jié)構(gòu)的影響[D]. 周學(xué)麗.青海大學(xué) 2009
本文編號:3454649
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