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鹽脅迫下甜高粱WRKY50基因的功能分析

發(fā)布時間:2021-10-24 05:15
  WRKY轉錄因子家族參與植物對逆境的響應,該家族成員均含有一個保守的WRKY結構域,可通過結合下游靶基因啟動子區(qū)的W-box來調(diào)節(jié)植物的生理生化反應。本試驗中,我們從轉錄組中篩選出一個甜高粱SbWRKY50(Sb09G005700)基因,并將該基因在野生型擬南芥中過量表達獲得過表達株系W50-12,W50-13。利用在線網(wǎng)站對該基因的生物信息學進行了分析,構建了帶有GFP標簽的載體對SbWRKY50的定位進行分析,構建了pGBKT7-SbWRKY50載體對其進行了轉錄活性分析。測定和分析了鹽處理下野生型和過表達植株在萌發(fā)期和苗期的各項生理指標,并篩選到該基因調(diào)控的下游靶基因,并通過熒光定量PCR、酵母單雜交和熒光素酶互補實驗進行驗證,闡明該基因調(diào)控植物抗鹽的作用機制。本研究的主要結論是:1、SbWRKY50的CDS序列全長621bp,共編碼207個氨基酸,其N端具有一個保守的WRKY結構域,C端具有一個C2H2的鋅指結構,屬于典型的II類WRKY家族蛋白。該蛋白的分子式為C969H1453N

【文章來源】:山東師范大學山東省

【文章頁數(shù)】:58 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

鹽脅迫下甜高粱WRKY50基因的功能分析


SbWRKY50的氨基酸序列(A)和結構域(B)

親疏,水性,蛋白


山東師范大學碩士學位論文72.2SbWRKY50蛋白序列的親疏水性分析圖2-2.SbWRKY50蛋白的親疏水性分析Fig.2-2.HydrophilicanalysisofSbWRKY50protein通過ExPASy在線網(wǎng)站對SbWRKY50蛋白序列進行親疏水性分析,在該分析中,分值越大表示蛋白的疏水性越強。從圖2-2可看出,SbWRKY50蛋白的分值大部分都是大于0的,所以SbWRKY50為疏水蛋白。2.3SbWRKY50信號肽及跨膜結構預測及分析通過TMHMM、Signal-5.0在線網(wǎng)站來分析SbWRKY50蛋白,從圖2-3中可看出,SbWRKY50蛋白既無信號肽也無跨膜結構域。

序列,蛋白,信號肽,膜結構


山東師范大學碩士學位論文8圖2-3.SbWRKY50蛋白的信號肽(A)及跨膜結構預測(B)Fig.2-3.Signalpeptide(A)andtransmembranestructureprediction(B)ofSbWRKY502.4SbWRKY50蛋白與其他同源蛋白的關系通過DNAMAN軟件對甜高粱SbWRKY50蛋白序列和其他物種中的同源蛋白序列進行比對,發(fā)現(xiàn)他們都有WRKYGQK核心序列和C2H2型鋅指結構,同源性比較高,因此SbWRKY50蛋白屬于WRKY家族分類的第II類(圖2-4A)。通過MEGA6軟件對這些同源基因建立系統(tǒng)進化樹發(fā)現(xiàn),SbWRKY50蛋白與PhWRKY51蛋白親緣關系最近(圖2-4B)。

【參考文獻】:
期刊論文
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碩士論文
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[5]鹽脅迫下鹽地堿蓬甘油-3-磷酸;D移酶基因的功能分析[D]. 王明杰.山東師范大學 2016
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本文編號:3454649

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