發(fā)布時(shí)間：2021-10-14 11:21

　　為了探究小麥MYB轉(zhuǎn)錄因子基因TaMYB70的功能,采用同源克隆方法分離TaMYB70（MK024291）基因cDNA序列,運(yùn)用生物信息學(xué)手段分析該基因序列特征,采用實(shí)時(shí)熒光定量反轉(zhuǎn)錄PCR（qRT-PCR）檢測(cè)其在不同逆境脅迫下的表達(dá)模式。結(jié)果表明,分離得到的TaMYB70部分序列長(zhǎng)度為1 272bp,包含一個(gè)長(zhǎng)度為1 008bp的開放閱讀框,編碼335個(gè)氨基酸殘基。TaMYB70蛋白含有2個(gè)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)的Mybtype HTH DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域。TaMYB70氨基酸序列與粗山羊草、二穗短柄草等植物MYB44同源性較高,與擬南芥R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子第22亞族成員屬于同一分支。qRT-PCR分析表明,TaMYB70在脫落酸脅迫下表達(dá)量升高,在PEG和NaCl脅迫下表達(dá)量下降,該轉(zhuǎn)錄因子可能參與小麥逆境脅迫應(yīng)答。 

【文章來(lái)源】：作物雜志. 2020,(04)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

小麥TaMYB70基因擴(kuò)增結(jié)果

用Protparam分析氨基酸序列的理化性質(zhì)結(jié)果表明，小麥Ta MYB70蛋白分子質(zhì)量為35 799.56Da，等電點(diǎn)9.27，負(fù)電荷氨基酸殘基數(shù)（Asp+Glu）為29，正電荷氨基酸殘基數(shù)（Arg+Lys）為35，不穩(wěn)定指數(shù)為90.43，為不穩(wěn)定蛋白，親水性平均系數(shù)為-0.638，為親水蛋白。Prosite預(yù)測(cè)該蛋白的結(jié)構(gòu)域，發(fā)現(xiàn)在氨基酸殘基位點(diǎn)14～67和69～118處各有1個(gè)Myb-type HTH DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域（圖2）。用SWISS-MODEL預(yù)測(cè)其三級(jí)結(jié)構(gòu)模型，發(fā)現(xiàn)該蛋白含有2個(gè)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)（圖3），與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)相符，Ta MYB70蛋白具有R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子典型的結(jié)構(gòu)特征，預(yù)測(cè)該蛋白為R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子。圖3 小麥TaMYB70蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)模型

小麥TaMYB70蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)模型

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]AtMYB73基因正調(diào)控?cái)M南芥對(duì)鹽脅迫的響應(yīng)[J]. 龐茜,趙亞婷,樊錦濤,邢紅俠,張靖,邢繼紅,董金皋.  河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(05)
[2]AtMYB44與ABI1競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合ABA受體RCAR1的研究[J]. 趙哲,李德款,袁德志,王曉玉,李旭鋒.  四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(03)
[3]擬南芥R2R3-MYB家族第22亞族的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 樊錦濤,蔣琛茜,邢繼紅,董金皋.  遺傳. 2014(10)
[4]植物MYB類轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 陳俊,王宗陽(yáng).  植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào). 2002(02)

碩士論文
[1]擬南芥AtMYB73響應(yīng)干旱機(jī)制初探[D]. 樊錦濤.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號(hào)：3436061