生長素響應因子（Auxin response factor,ARF）是生長素信號轉(zhuǎn)導途徑中的一類重要轉(zhuǎn)錄因子,在種子萌發(fā)、器官形成、果實成熟、胚胎發(fā)生等多個生長發(fā)育過程發(fā)揮作用。為了揭示花生基因組中AhARF基因家族的特征,本研究利用生物信息學方法從花生基因組中鑒定了62個花生AhARF家族基因,它們不均勻分布于除1號和11號之外的其他18條染色體上,在A和B亞基因組對應關系的染色體上數(shù)目大體相同。依據(jù)系統(tǒng)發(fā)生關系,62個花生AhARFs與擬南芥AtARFs家族基因共同聚在除ClassIII（僅包含擬南芥AtARFs）外的其余4個分支。共線性分析共檢測到33對片段重復基因,其Ka/Ks比值均小于1,受到環(huán)境壓力的純化選擇。本研究還分析了它們的理化性質(zhì)、蛋白保守結構域等特征。此外,基于22個組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),繪制了62個花生AhARF家族基因的表達模式熱圖。進一步應用qRT-PCR方法,分析了可能與萌發(fā)相關的4個AhARF基因（AhARF10、AhARF20、AhARF23和AhARF46）的時空表達模式。本研究可為種子萌發(fā)相關AhARF基因的挖掘與功能鑒定提供基礎。 

【文章來源】：中國油料作物學報. 2020,42(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

花生Ah ARF家族基因在染色體上的定位

花生與擬南芥ARF基因的系統(tǒng)進化樹

花生Ah ARF家族重復基因分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]花生種子萌發(fā)過程中內(nèi)源激素含量的變化[J]. 崔維佩,唐桂英,徐平麗,李鵬祥,朱潔瓊,單雷.  中國油料作物學報. 2020(05)
[2]大麥ARF基因家族的全基因組分析[J]. 郭寶健,李贏,袁澤宸,呂超,張新忠,許如根.  麥類作物學報. 2016(11)
[3]普通煙草ARF基因家族序列的鑒定與表達分析[J]. 孫亭亭,張磊,陳樂,龔達平,王大偉,陳雅瓊,陳蕾,孫玉合.  植物遺傳資源學報. 2016(01)



本文編號：3435861