利用生物信息學(xué)方法對(duì)向日葵基因組的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,共獲得255個(gè)富含亮氨酸的重復(fù)序列和核苷酸結(jié)合位點(diǎn)（nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR）類抗病基因的蛋白質(zhì)序列,并根據(jù)結(jié)構(gòu)域類型,將其分為TIR和Non-TIR兩類。進(jìn)一步對(duì)其中42個(gè)同時(shí)含有LRR和NBS結(jié)構(gòu)域的LRR-NBS型基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、氨基酸序列及基因在染色體上的物理分布進(jìn)行分析,結(jié)果表明,基因多分布于4號(hào)、8號(hào)和13號(hào)染色體,而且52.4%以基因簇存在;結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該類蛋白都具有特征結(jié)構(gòu)域NBS結(jié)構(gòu)域,氨基酸序列同源性為29.26%。對(duì)6個(gè)NBS類基因經(jīng)向日葵銹菌誘導(dǎo)后的表達(dá)分析表明,6個(gè)基因均可被向日葵銹菌誘導(dǎo)表達(dá),說(shuō)明其可能參與了向日葵響應(yīng)銹菌脅迫的抗病反應(yīng)過(guò)程。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2020,42(03)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：12 頁(yè)

【部分圖文】：

TNL和CNL亞家族基因在向日葵及部分植物中的分布

圖1 TNL和CNL亞家族基因在向日葵及部分植物中的分布對(duì)含有NBS和LRR結(jié)構(gòu)域的抗病基因（NL、CNL、TNL）構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明，42個(gè)NBS-LRR型基因被主要分為2個(gè)亞群（圖3）。含有CNL、NL結(jié)構(gòu)域基因沒(méi)有產(chǎn)生特定分支，也就是說(shuō)，CC結(jié)構(gòu)域的存在并沒(méi)有對(duì)基因的分化有特別明顯的區(qū)分作用，進(jìn)一步證明，CNL和NL兩種類型的基因有著相同的進(jìn)化路徑，與TNL類基因進(jìn)化路徑不同。

對(duì)含有NBS和LRR結(jié)構(gòu)域的抗病基因（NL、CNL、TNL）構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明，42個(gè)NBS-LRR型基因被主要分為2個(gè)亞群（圖3）。含有CNL、NL結(jié)構(gòu)域基因沒(méi)有產(chǎn)生特定分支，也就是說(shuō)，CC結(jié)構(gòu)域的存在并沒(méi)有對(duì)基因的分化有特別明顯的區(qū)分作用，進(jìn)一步證明，CNL和NL兩種類型的基因有著相同的進(jìn)化路徑，與TNL類基因進(jìn)化路徑不同。2.3 向日葵NBS-LRR型抗病基因的基本性質(zhì)分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]花生NBS-LRR類基因的克隆及表達(dá)特性分析[J]. 馮艷芳,耿麗麗,韓榕,張杰.  生物技術(shù)通報(bào). 2016(08)
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[4]番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因組分析[J]. 劉云飛,萬(wàn)紅建,韋艷萍,李志邈,葉青靜,王榮青,阮美穎,姚祝平,周國(guó)治,楊悅儉.  核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(05)
[5]擬南芥基因組NBS-LRR類基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 王巖,李兆陽(yáng),唐心龍,盧姍,許鵬,張靜,方奎,席景會(huì).  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2009(15)



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