利用生物信息學方法對向日葵基因組的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行搜索,共獲得255個富含亮氨酸的重復序列和核苷酸結(jié)合位點（nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR）類抗病基因的蛋白質(zhì)序列,并根據(jù)結(jié)構(gòu)域類型,將其分為TIR和Non-TIR兩類。進一步對其中42個同時含有LRR和NBS結(jié)構(gòu)域的LRR-NBS型基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、氨基酸序列及基因在染色體上的物理分布進行分析,結(jié)果表明,基因多分布于4號、8號和13號染色體,而且52.4%以基因簇存在;結(jié)構(gòu)域預測結(jié)果顯示,該類蛋白都具有特征結(jié)構(gòu)域NBS結(jié)構(gòu)域,氨基酸序列同源性為29.26%。對6個NBS類基因經(jīng)向日葵銹菌誘導后的表達分析表明,6個基因均可被向日葵銹菌誘導表達,說明其可能參與了向日葵響應銹菌脅迫的抗病反應過程。 

【文章來源】：中國油料作物學報. 2020,42(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

TNL和CNL亞家族基因在向日葵及部分植物中的分布

圖1 TNL和CNL亞家族基因在向日葵及部分植物中的分布對含有NBS和LRR結(jié)構(gòu)域的抗病基因（NL、CNL、TNL）構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果表明，42個NBS-LRR型基因被主要分為2個亞群（圖3）。含有CNL、NL結(jié)構(gòu)域基因沒有產(chǎn)生特定分支，也就是說，CC結(jié)構(gòu)域的存在并沒有對基因的分化有特別明顯的區(qū)分作用，進一步證明，CNL和NL兩種類型的基因有著相同的進化路徑，與TNL類基因進化路徑不同。

對含有NBS和LRR結(jié)構(gòu)域的抗病基因（NL、CNL、TNL）構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果表明，42個NBS-LRR型基因被主要分為2個亞群（圖3）。含有CNL、NL結(jié)構(gòu)域基因沒有產(chǎn)生特定分支，也就是說，CC結(jié)構(gòu)域的存在并沒有對基因的分化有特別明顯的區(qū)分作用，進一步證明，CNL和NL兩種類型的基因有著相同的進化路徑，與TNL類基因進化路徑不同。2.3 向日葵NBS-LRR型抗病基因的基本性質(zhì)分析

【參考文獻】：
期刊論文
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