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基于線粒體COⅠ基因序列的2種仿對蝦遺傳差異

發(fā)布時間:2021-10-13 21:37
  哈氏仿對蝦和細(xì)巧仿對蝦是東海經(jīng)濟蝦類資源中主要的仿對蝦屬種類,為調(diào)查研究浙江省舟山市近海這2種蝦類種質(zhì)資源現(xiàn)狀及親緣關(guān)系,通過PCR擴增獲得2種仿對蝦線粒體DNA細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ,基因長度為632 bp的序列片段,共檢測到101個變異位點,其中簡約信息位點99個,哈氏仿對蝦有4種單倍型,細(xì)巧仿對蝦有3種單倍型。統(tǒng)計堿基組成發(fā)現(xiàn),二者在目的片段上的A+T含量分別為62.0%、62.9%,均顯著高于C+G含量。細(xì)巧仿對蝦的單倍型多樣性與核苷酸多樣性均高于哈氏仿對蝦,采用鄰接法構(gòu)建分子系統(tǒng)樹,并基于木村雙參數(shù)遺傳距離計算2種仿對蝦的分化時間約在5.93百萬年前。初步摸清了哈氏仿對蝦和細(xì)巧仿對蝦遺傳多樣性現(xiàn)狀并比較了兩者間的遺傳差異,研究結(jié)果以期為仿對蝦屬經(jīng)濟物種的遺傳信息和系統(tǒng)發(fā)育提供分子生物學(xué)參考依據(jù)。 

【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(16)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料采集和DNA提取
    1.2 PCR擴增
    1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 COⅠ基因序列分析
    2.2 遺傳多樣性分析
    2.3 遺傳距離和聚類分析
3 結(jié)論與討論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于線粒體Cyt b和COⅠ基因序列的華南鯉群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王楨璐,姚東林,謝少林,范蘭芬,鄒記興,周愛國.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(18)
[2]基于線粒體COⅠ的DNA條形碼在對蝦科種類鑒定中的研究[J]. 易嘯,王攀攀,王軍,蘇永全,毛勇.  水產(chǎn)學(xué)報. 2018(01)
[3]哈氏仿對蝦線粒體16S rRNA和COⅠ基因的序列比較及其與仿對蝦屬之間的系統(tǒng)進化分析[J]. 毛智超,段亞飛,劉萍,李健,陳萍.  水產(chǎn)學(xué)報. 2016(07)
[4]哈氏仿對蝦人工育苗技術(shù)研究[J]. 張曹進,姚國興,吳國鈞,任忠宏,陳愛華.  水產(chǎn)科技情報. 2011(06)
[5]基于線粒體Cytb基因探討我國日本囊對蝦4個地理群體的遺傳結(jié)構(gòu)及種群分化[J]. 曾凡榮,王軍,周孔霖,游欣欣,毛勇.  廈門大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2010(05)
[6]東海北部哈氏仿對蝦資源量評估[J]. 徐開達,薛利建,賀舟挺,宋海棠.  福建水產(chǎn). 2010(01)
[7]東海哈氏仿對蝦的數(shù)量分布和生長特性研究[J]. 宋海棠,俞存根,薛利建.  水生生物學(xué)報. 2009(01)
[8]3種中華絨螯蟹群體線粒體CO Ⅱ基因序列測定與進化分析[J]. 王成輝,李思發(fā),劉至治,龔小玲,黃雷,宋曉,趙巖.  水產(chǎn)學(xué)報. 2008(01)
[9]遺傳多樣性及其保存[J]. 施立明.  生物科學(xué)信息. 1990(04)
[10]中國近海仿對蝦屬的研究[J]. 劉瑞玉,王永良.  海洋與湖沼. 1987(06)

博士論文
[1]密碼子及密碼子對使用偏好性的研究[D]. 譚生軍.南京大學(xué) 2012

碩士論文
[1]中國近海仿對蝦屬分子系統(tǒng)演化和近似種問題的研究[D]. 徐琰.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2005



本文編號:3435445

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