基于線(xiàn)粒體COⅠ基因序列的2種仿對(duì)蝦遺傳差異
發(fā)布時(shí)間:2021-10-13 21:37
哈氏仿對(duì)蝦和細(xì)巧仿對(duì)蝦是東海經(jīng)濟(jì)蝦類(lèi)資源中主要的仿對(duì)蝦屬種類(lèi),為調(diào)查研究浙江省舟山市近海這2種蝦類(lèi)種質(zhì)資源現(xiàn)狀及親緣關(guān)系,通過(guò)PCR擴(kuò)增獲得2種仿對(duì)蝦線(xiàn)粒體DNA細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ,基因長(zhǎng)度為632 bp的序列片段,共檢測(cè)到101個(gè)變異位點(diǎn),其中簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)99個(gè),哈氏仿對(duì)蝦有4種單倍型,細(xì)巧仿對(duì)蝦有3種單倍型。統(tǒng)計(jì)堿基組成發(fā)現(xiàn),二者在目的片段上的A+T含量分別為62.0%、62.9%,均顯著高于C+G含量。細(xì)巧仿對(duì)蝦的單倍型多樣性與核苷酸多樣性均高于哈氏仿對(duì)蝦,采用鄰接法構(gòu)建分子系統(tǒng)樹(shù),并基于木村雙參數(shù)遺傳距離計(jì)算2種仿對(duì)蝦的分化時(shí)間約在5.93百萬(wàn)年前。初步摸清了哈氏仿對(duì)蝦和細(xì)巧仿對(duì)蝦遺傳多樣性現(xiàn)狀并比較了兩者間的遺傳差異,研究結(jié)果以期為仿對(duì)蝦屬經(jīng)濟(jì)物種的遺傳信息和系統(tǒng)發(fā)育提供分子生物學(xué)參考依據(jù)。
【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(16)
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料采集和DNA提取
1.2 PCR擴(kuò)增
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 COⅠ基因序列分析
2.2 遺傳多樣性分析
2.3 遺傳距離和聚類(lèi)分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于線(xiàn)粒體Cyt b和COⅠ基因序列的華南鯉群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王楨璐,姚東林,謝少林,范蘭芬,鄒記興,周愛(ài)國(guó). 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(18)
[2]基于線(xiàn)粒體COⅠ的DNA條形碼在對(duì)蝦科種類(lèi)鑒定中的研究[J]. 易嘯,王攀攀,王軍,蘇永全,毛勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]哈氏仿對(duì)蝦線(xiàn)粒體16S rRNA和COⅠ基因的序列比較及其與仿對(duì)蝦屬之間的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 毛智超,段亞飛,劉萍,李健,陳萍. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2016(07)
[4]哈氏仿對(duì)蝦人工育苗技術(shù)研究[J]. 張曹進(jìn),姚國(guó)興,吳國(guó)鈞,任忠宏,陳愛(ài)華. 水產(chǎn)科技情報(bào). 2011(06)
[5]基于線(xiàn)粒體Cytb基因探討我國(guó)日本囊對(duì)蝦4個(gè)地理群體的遺傳結(jié)構(gòu)及種群分化[J]. 曾凡榮,王軍,周孔霖,游欣欣,毛勇. 廈門(mén)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[6]東海北部哈氏仿對(duì)蝦資源量評(píng)估[J]. 徐開(kāi)達(dá),薛利建,賀舟挺,宋海棠. 福建水產(chǎn). 2010(01)
[7]東海哈氏仿對(duì)蝦的數(shù)量分布和生長(zhǎng)特性研究[J]. 宋海棠,俞存根,薛利建. 水生生物學(xué)報(bào). 2009(01)
[8]3種中華絨螯蟹群體線(xiàn)粒體CO Ⅱ基因序列測(cè)定與進(jìn)化分析[J]. 王成輝,李思發(fā),劉至治,龔小玲,黃雷,宋曉,趙巖. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2008(01)
[9]遺傳多樣性及其保存[J]. 施立明. 生物科學(xué)信息. 1990(04)
[10]中國(guó)近海仿對(duì)蝦屬的研究[J]. 劉瑞玉,王永良. 海洋與湖沼. 1987(06)
博士論文
[1]密碼子及密碼子對(duì)使用偏好性的研究[D]. 譚生軍.南京大學(xué) 2012
碩士論文
[1]中國(guó)近海仿對(duì)蝦屬分子系統(tǒng)演化和近似種問(wèn)題的研究[D]. 徐琰.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2005
本文編號(hào):3435445
【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(16)
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料采集和DNA提取
1.2 PCR擴(kuò)增
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 COⅠ基因序列分析
2.2 遺傳多樣性分析
2.3 遺傳距離和聚類(lèi)分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于線(xiàn)粒體Cyt b和COⅠ基因序列的華南鯉群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王楨璐,姚東林,謝少林,范蘭芬,鄒記興,周愛(ài)國(guó). 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(18)
[2]基于線(xiàn)粒體COⅠ的DNA條形碼在對(duì)蝦科種類(lèi)鑒定中的研究[J]. 易嘯,王攀攀,王軍,蘇永全,毛勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]哈氏仿對(duì)蝦線(xiàn)粒體16S rRNA和COⅠ基因的序列比較及其與仿對(duì)蝦屬之間的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 毛智超,段亞飛,劉萍,李健,陳萍. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2016(07)
[4]哈氏仿對(duì)蝦人工育苗技術(shù)研究[J]. 張曹進(jìn),姚國(guó)興,吳國(guó)鈞,任忠宏,陳愛(ài)華. 水產(chǎn)科技情報(bào). 2011(06)
[5]基于線(xiàn)粒體Cytb基因探討我國(guó)日本囊對(duì)蝦4個(gè)地理群體的遺傳結(jié)構(gòu)及種群分化[J]. 曾凡榮,王軍,周孔霖,游欣欣,毛勇. 廈門(mén)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[6]東海北部哈氏仿對(duì)蝦資源量評(píng)估[J]. 徐開(kāi)達(dá),薛利建,賀舟挺,宋海棠. 福建水產(chǎn). 2010(01)
[7]東海哈氏仿對(duì)蝦的數(shù)量分布和生長(zhǎng)特性研究[J]. 宋海棠,俞存根,薛利建. 水生生物學(xué)報(bào). 2009(01)
[8]3種中華絨螯蟹群體線(xiàn)粒體CO Ⅱ基因序列測(cè)定與進(jìn)化分析[J]. 王成輝,李思發(fā),劉至治,龔小玲,黃雷,宋曉,趙巖. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2008(01)
[9]遺傳多樣性及其保存[J]. 施立明. 生物科學(xué)信息. 1990(04)
[10]中國(guó)近海仿對(duì)蝦屬的研究[J]. 劉瑞玉,王永良. 海洋與湖沼. 1987(06)
博士論文
[1]密碼子及密碼子對(duì)使用偏好性的研究[D]. 譚生軍.南京大學(xué) 2012
碩士論文
[1]中國(guó)近海仿對(duì)蝦屬分子系統(tǒng)演化和近似種問(wèn)題的研究[D]. 徐琰.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2005
本文編號(hào):3435445
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