黃瓜果實早期發(fā)育中基因的時空表達與調(diào)控
發(fā)布時間：2021-09-30 14:36
黃瓜（Cucumis sativus L.）是世界十大蔬菜之一,具有重要的經(jīng)濟價值。黃瓜以其幼嫩的瓠果為產(chǎn)品器官,但果實發(fā)育中相關(guān)基因及其調(diào)控機制研究較少。為進一步揭示黃瓜商品果形成過程中的關(guān)鍵基因和調(diào)控機制,本研究首先提高了黃瓜參考基因組的準(zhǔn)確性和連續(xù)性,并進一步對黃瓜早期果實發(fā)育關(guān)鍵時間節(jié)點（開花前3天以及花后0、1、3、5、8、16天）和組織部位（頭部胎座和中果皮、中部胎座和中果皮、瓜把）的基因和microRNA進行動態(tài)變化分析;同時發(fā)掘果實形態(tài)建成過程中的基因表達變化規(guī)律,得到了一系列具有重要功能的候選基因,并分析了基因表達與microRNA調(diào)控的關(guān)系,主要結(jié)果如下:1)獲得高連續(xù)性和完整性的參考基因組（V3.0）。新拼接的基因組總長度為226.2 Mb,僅包含174條contgs,N50長度為8.9 Mb,與上一版本（V2.0）相比,基因組的連接性改善約234.8倍,長度增加29.0Mb。V3.0基因組鑒定出82.0Mb重復(fù)序列,占基因組36.43%,比V2.0（54.4Mb）中預(yù)測的重復(fù)序列增加27.6Mb。在V3.0中預(yù)測得到1,374個FL-LTR,比V2.0中的（26...
【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】：56 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
圖１．１番前果實生長發(fā)育時期（引自Ｓｔｅｉｎｈａｕｓｅｒｅｔａｌ．，２０１０）??Ｆｉｕｒｅ．?１．１?Ｇｒｏｗｔｈ?ａｎｄ?ｄｅｖｅｌｏｍｅｎｔ?ｏｆ?ｔｏｍａｔｏ?ｆｒｕｉｔｓｃｉｔｅｄ?ｆｒｏｍ?Ｓｔｅｉｎｈａｕｓｅｒ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１０
段：細(xì)胞分裂、細(xì)胞伸長和果實成熟期（Ｇｉｌｌａｓｐｙｅｔａｌ．，１９９３）：開花后０－３天是細(xì)胞的快速分裂階??段，果實長度和直徑增長緩慢；３－５天由快速分裂轉(zhuǎn)入快速伸長，果實長度増長尤其明顯，５－８天??快速伸長時期；１２天后趨于平緩，１６天基本完成果實成熟（圖１．２）。??在黃瓜早期果實發(fā)育過程中，細(xì)胞數(shù)目和體積也隨之呈現(xiàn)動態(tài)變化趨勢：開花之前主要是細(xì)??胞數(shù)目的增加，開花前到花后５天為細(xì)胞快速分裂期；５天后轉(zhuǎn)換為細(xì)胞快速膨大期，一直持續(xù)??到開花后１６天左右，開花后的１２－１６天的細(xì)胞膨大主要與果實直徑的增長相關(guān)。果實的快速生長??和伸長階段是果實發(fā)育過程中的重要階段，細(xì)胞分裂時期是影響果實大小和產(chǎn)量的重要階段。此??夕卜，細(xì)胞伸長時期也越來越被認(rèn)為是果實品質(zhì)性狀的重要決定因素，例如此過程中糖和有機酸的??積累以及細(xì)胞壁和角質(zhì)層的建立（Ａｎｄｏｅｔａｌ．，２０１２）。同時１０－１２天的細(xì)胞伸長期被發(fā)現(xiàn)存在果實??敏感性的轉(zhuǎn)變，可能與抗性變化有關(guān)。??在果實發(fā)育過程中還伴隨著棱和刺瘤的變化
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文?第二章基因組組裝與分析??額外的１９．１１＼＾序列（圖２．２）。由于缺乏１１丨－（：數(shù)據(jù)的支持，其余７８個超級３〇３０＇〇記３（１５．２：＼＜１１））??不能錨定到七條染色體中的任何一條，這表明這些序列可能主要由重復(fù)序列覆蓋，難以錨定到染??色體上。??１－１?－?１－３?＇?１－５?１－７?１－８?１－１０?１－１２??ｃｈｒ１?＇?？??Ｃｏｎｔｉｇ?ｉ．ｉｉ?丨丨——??Ｒｅｐｅａｔ??ｔｙｐｅ?Ｉ川?ｏｒ?ｔｙｐｅ?ＩＶ??ｃｈｒ２?＇?Ｙ?。Ｘ?＞?ｕｍ?ｔｙｐｅｌｌｌ??＇＿Ｂ■■丨?＿＿■■?＿■?１?＿■■？？■■＿?丨１?■＿??丨■■■丨丨＿＿丨丨ｉ?丨丨■丨，■丨一??Ｉ?ｉｔ?Ｉ?ｒａ??Ｃｅｎ??３－１?：?３－３＾－４?３－５?丄?３－６??３－８??１，１，１?■■?＿■■丨?―丨１１?，■■■■?－丨》＿?丨?圓丨丨Ｉ??ｒ．，ｌ繫■?出丨ｄ：‘＇?＇?ｒ：！?＇??４－１?４－２?４－３?４－４?４－５?＾?４?６?４－７?４－６?４－９－?：４－ｔ１??ｃｈｒ４?＾９??—圓丨丨丨■■■丨■？?？■■??■■Ｗ丨丨丨１?■ＭＩＮＩ??ｉ?？?Ｐ?：?１?曬Ｉ??—■－ｒ－—ｖ－ｖ＿＿■■?■—■■■■■■■■＿??—■■一?■?■??？?ｓ＊？ｉＬｆｒｗ?ｆａｍｍ?＾?＊：?ｉ??ｃｈｒ６?纖??—＿丨丨—ｎ
本文編號：3416066
【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】：56 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
圖１．１番前果實生長發(fā)育時期（引自Ｓｔｅｉｎｈａｕｓｅｒｅｔａｌ．，２０１０）??Ｆｉｕｒｅ．?１．１?Ｇｒｏｗｔｈ?ａｎｄ?ｄｅｖｅｌｏｍｅｎｔ?ｏｆ?ｔｏｍａｔｏ?ｆｒｕｉｔｓｃｉｔｅｄ?ｆｒｏｍ?Ｓｔｅｉｎｈａｕｓｅｒ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１０
段：細(xì)胞分裂、細(xì)胞伸長和果實成熟期（Ｇｉｌｌａｓｐｙｅｔａｌ．，１９９３）：開花后０－３天是細(xì)胞的快速分裂階??段，果實長度和直徑增長緩慢；３－５天由快速分裂轉(zhuǎn)入快速伸長，果實長度増長尤其明顯，５－８天??快速伸長時期；１２天后趨于平緩，１６天基本完成果實成熟（圖１．２）。??在黃瓜早期果實發(fā)育過程中，細(xì)胞數(shù)目和體積也隨之呈現(xiàn)動態(tài)變化趨勢：開花之前主要是細(xì)??胞數(shù)目的增加，開花前到花后５天為細(xì)胞快速分裂期；５天后轉(zhuǎn)換為細(xì)胞快速膨大期，一直持續(xù)??到開花后１６天左右，開花后的１２－１６天的細(xì)胞膨大主要與果實直徑的增長相關(guān)。果實的快速生長??和伸長階段是果實發(fā)育過程中的重要階段，細(xì)胞分裂時期是影響果實大小和產(chǎn)量的重要階段。此??夕卜，細(xì)胞伸長時期也越來越被認(rèn)為是果實品質(zhì)性狀的重要決定因素，例如此過程中糖和有機酸的??積累以及細(xì)胞壁和角質(zhì)層的建立（Ａｎｄｏｅｔａｌ．，２０１２）。同時１０－１２天的細(xì)胞伸長期被發(fā)現(xiàn)存在果實??敏感性的轉(zhuǎn)變，可能與抗性變化有關(guān)。??在果實發(fā)育過程中還伴隨著棱和刺瘤的變化
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文?第二章基因組組裝與分析??額外的１９．１１＼＾序列（圖２．２）。由于缺乏１１丨－（：數(shù)據(jù)的支持，其余７８個超級３〇３０＇〇記３（１５．２：＼＜１１））??不能錨定到七條染色體中的任何一條，這表明這些序列可能主要由重復(fù)序列覆蓋，難以錨定到染??色體上。??１－１?－?１－３?＇?１－５?１－７?１－８?１－１０?１－１２??ｃｈｒ１?＇?？??Ｃｏｎｔｉｇ?ｉ．ｉｉ?丨丨——??Ｒｅｐｅａｔ??ｔｙｐｅ?Ｉ川?ｏｒ?ｔｙｐｅ?ＩＶ??ｃｈｒ２?＇?Ｙ?。Ｘ?＞?ｕｍ?ｔｙｐｅｌｌｌ??＇＿Ｂ■■丨?＿＿■■?＿■?１?＿■■？？■■＿?丨１?■＿??丨■■■丨丨＿＿丨丨ｉ?丨丨■丨，■丨一??Ｉ?ｉｔ?Ｉ?ｒａ??Ｃｅｎ??３－１?：?３－３＾－４?３－５?丄?３－６??３－８??１，１，１?■■?＿■■丨?―丨１１?，■■■■?－丨》＿?丨?圓丨丨Ｉ??ｒ．，ｌ繫■?出丨ｄ：‘＇?＇?ｒ：！?＇??４－１?４－２?４－３?４－４?４－５?＾?４?６?４－７?４－６?４－９－?：４－ｔ１??ｃｈｒ４?＾９??—圓丨丨丨■■■丨■？?？■■??■■Ｗ丨丨丨１?■ＭＩＮＩ??ｉ?？?Ｐ?：?１?曬Ｉ??—■－ｒ－—ｖ－ｖ＿＿■■?■—■■■■■■■■＿??—■■一?■?■??？?ｓ＊？ｉＬｆｒｗ?ｆａｍｍ?＾?＊：?ｉ??ｃｈｒ６?纖??—＿丨丨—ｎ
本文編號：3416066
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