2010年-2015年重慶地區(qū)手足口病患兒腸道病毒71型VP1基因序列分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-25 12:21
目的:了解重慶地區(qū)近6年來(lái)手足口病患兒腸道病毒71型(EV71)VP1基因特征,并為腸道病毒71型VP1基因相關(guān)研究提供依據(jù)。方法:收集2011年至2015年手足口病住院患兒糞便標(biāo)本,檢測(cè)病原類型,利用巢式PCR方法,使用特異性診斷引物進(jìn)行腸道病毒71型VP1基因片段的擴(kuò)增,得到VP1基因全長(zhǎng)段并測(cè)序。通過(guò)隨機(jī)抽樣的方法,共選擇出116株病毒分離株,進(jìn)行同源性分析,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),用疫苗株FY7VP5為對(duì)照比較重慶地區(qū)腸道病毒71型VP1氨基酸變異情況。結(jié)果:1.2011年至2015年重慶地區(qū)病毒分離株全為C4a亞型,與Genebank上下載的C4a亞型代表株同源性高,且同時(shí)存在兩個(gè)大的流行分支,其中一個(gè)大流行分支中還存在4個(gè)小流行分支。重慶地區(qū)EV71病毒存在時(shí)間聚集性,每年EV71流行分布也存在差異。2.3株EV71疫苗株FY7VP5、H07、FY-23K-B與該地區(qū)病毒分離株同源性高。3.以疫苗株FY7VP5為對(duì)照病毒株,共39株病毒分離株發(fā)現(xiàn)存在氨基酸變異,共發(fā)現(xiàn)15個(gè)氨基酸變異位點(diǎn)。結(jié)論:基因序列研究分析表明,2010年到2015年重慶地區(qū)EV71病毒分離株均屬于C4a亞型,...
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
病毒檢測(cè)流程
本文編號(hào):3409729
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病毒檢測(cè)流程
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