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2010年-2015年重慶地區(qū)手足口病患兒腸道病毒71型VP1基因序列分析

發(fā)布時間:2021-09-25 12:21
  目的:了解重慶地區(qū)近6年來手足口病患兒腸道病毒71型(EV71)VP1基因特征,并為腸道病毒71型VP1基因相關(guān)研究提供依據(jù)。方法:收集2011年至2015年手足口病住院患兒糞便標(biāo)本,檢測病原類型,利用巢式PCR方法,使用特異性診斷引物進(jìn)行腸道病毒71型VP1基因片段的擴(kuò)增,得到VP1基因全長段并測序。通過隨機(jī)抽樣的方法,共選擇出116株病毒分離株,進(jìn)行同源性分析,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,用疫苗株FY7VP5為對照比較重慶地區(qū)腸道病毒71型VP1氨基酸變異情況。結(jié)果:1.2011年至2015年重慶地區(qū)病毒分離株全為C4a亞型,與Genebank上下載的C4a亞型代表株同源性高,且同時存在兩個大的流行分支,其中一個大流行分支中還存在4個小流行分支。重慶地區(qū)EV71病毒存在時間聚集性,每年EV71流行分布也存在差異。2.3株EV71疫苗株FY7VP5、H07、FY-23K-B與該地區(qū)病毒分離株同源性高。3.以疫苗株FY7VP5為對照病毒株,共39株病毒分離株發(fā)現(xiàn)存在氨基酸變異,共發(fā)現(xiàn)15個氨基酸變異位點(diǎn)。結(jié)論:基因序列研究分析表明,2010年到2015年重慶地區(qū)EV71病毒分離株均屬于C4a亞型,... 

【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】:44 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

2010年-2015年重慶地區(qū)手足口病患兒腸道病毒71型VP1基因序列分析


病毒檢測流程


本文編號:3409729

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