熱激蛋白基因OsHSP40對水稻結實率的影響
發(fā)布時間:2021-09-18 08:42
熱激蛋白(Heat shock protein,HSP)是一類廣泛存在于生物體內的高度保守的應激蛋白,在生物的生長發(fā)育和逆境適應中扮演著十分重要的角色。目前,HSPs在動物中的研究居多,有關植物熱激蛋白基因對植物產(chǎn)量性狀形成相關的研究報道較少。本研究以粳稻Dongjin(DJ)為材料,運用分子生物學、轉基因技術、細胞生物學等方法對實驗室前期所獲得的T-DNA插入純合突變體oshsp40進行分子鑒定和功能研究。主要研究結果如下:1.OsHSP40基因位于水稻的第2號染色體上,含有10個外顯子和9個內含子,編碼409個氨基酸,預測蛋白大小為44279.60Da,等電點為4.96;啟動子序列中含有多種與生長發(fā)育和逆境響應相關的功能元件,如干旱誘導的MYB結合位點MBS,同時也含有與激素相關的順式作用元件如MeJA響應元件CGTCA-motif;系統(tǒng)進化樹分析結果表明OsHSP40與sHSP的親緣關系更近。2.熒光定量PCR結果表明,在粳稻中花11中,正常情況下,OsHSP40基因在水稻不同組織部位中均有表達,說明該基因可能在水稻整個生長發(fā)育過程中都具有重要的作用。在低溫、干旱和高鹽脅迫下,O...
【文章來源】:南昌大學江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
HSP轉錄調控(源自Yuki等[39]
第三章 結果與分析第三章 結果與分析1 OsHSP40 基因生物信息學分析.1 水稻 OsHSP40 基因結構信息根據(jù) NCBI 和 phytozome 水稻基因組數(shù)據(jù)庫中有關 OsHSP40 基因的信息析其基因基本信息和結構(圖 3.1 和表 3.1),發(fā)現(xiàn) OsHSP40 基因分布在基因組的第 2 號染色體上,序列全長為 4538bp,含有 10 個外顯子和 9 個子,mRNA 序列為 1691bp、CDS 序列是 1230bp。
第三章 結果與分析白的氨基酸序列與水稻、擬南芥、玉米、大豆等物種中的同源蛋白進行序列對比分析,并借助 MEGA4.1 軟件構建系統(tǒng)進化樹。結果顯sHSP40 與小分子熱激蛋白的同源性更高,在同一分枝上,但相較于分子十幾 kDa 的 sHSP,OsHSP40 與它們的親緣關系較遠(圖 3.2)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物熱激蛋白研究進展[J]. 栗振義,龍瑞才,張鐵軍,楊青川,康俊梅. 生物技術通報. 2016(02)
[2]利用染色體單片段代換系定位水稻結實率QTL[J]. 高云,陶亞軍,王立廣,于小鳳,陳達,董桂春,梁國華. 江蘇農業(yè)科學. 2014(11)
[3]玉米熱激蛋白基因ZmHsp90-1的克隆及表達分析[J]. 劉玲玲,柳思思,翁建峰,王昌濤,李新海,張世煌,石慶華,王麗娟,郝轉芳. 作物學報. 2012(10)
[4]影響水稻結實率的主要因素及對策[J]. 李松柏. 種業(yè)導刊. 2010(12)
[5]熱激蛋白與植物的抗冷性概述[J]. 從心黎,黃綿佳. 現(xiàn)代農業(yè)科學. 2009(11)
[6]過表達番茄葉綠體小分子熱激蛋白提高植株的耐熱性[J]. 楊傳燕,王翠,張景霞,王佳穎,王麗,劉箭. 山東師范大學學報(自然科學版). 2008(04)
[7]植物熱激蛋白HSP100/ClpB及其在提高植物抗熱性和抗寒性中的應用[J]. 許聲濤,孫文香,田進平,王崇英. 植物生理學通訊. 2008(04)
[8]不同生長環(huán)境下水稻結實率數(shù)量性狀位點的檢測[J]. 韓龍植,張三元,喬永利,金鐘煥,徐福榮,曹桂蘭,南鐘浩,戴陸園,芮鐘斗,高熙宗. 作物學報. 2006(07)
[9]植物熱激蛋白研究進展[J]. 張建國,何彩云,段愛國,殷繼艷. 福建林學院學報. 2005(02)
[10]水稻花粉發(fā)育過程及其分期[J]. 馮九煥,盧永根,劉向東,徐雪賓. 中國水稻科學. 2001(01)
博士論文
[1]OsDCL3b下調表達對稻米產(chǎn)量和品質的影響[D]. 廖鵬飛.南昌大學 2017
[2]蠟梅熱激蛋白70(HSP70)基因的克隆及功能分析[D]. NGUYEN VAN TIEN(阮文進).西南大學 2015
[3]水稻雄性不育突變體gsl5的基因克隆及不育機理研究[D]. 師曉.中國農業(yè)科學院 2015
碩士論文
[1]水稻OsGPRP家族基因結構與表達分析[D]. 童普國.南昌大學 2017
[2]紫花苜蓿熱激蛋白基因MsHSP70的克隆及功能分析[D]. 栗振義.中國農業(yè)科學院 2015
[3]高溫脅迫下水稻熱激蛋白的作用機理研究[D]. 陳新海.福建農林大學 2011
本文編號:3399832
【文章來源】:南昌大學江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
HSP轉錄調控(源自Yuki等[39]
第三章 結果與分析第三章 結果與分析1 OsHSP40 基因生物信息學分析.1 水稻 OsHSP40 基因結構信息根據(jù) NCBI 和 phytozome 水稻基因組數(shù)據(jù)庫中有關 OsHSP40 基因的信息析其基因基本信息和結構(圖 3.1 和表 3.1),發(fā)現(xiàn) OsHSP40 基因分布在基因組的第 2 號染色體上,序列全長為 4538bp,含有 10 個外顯子和 9 個子,mRNA 序列為 1691bp、CDS 序列是 1230bp。
第三章 結果與分析白的氨基酸序列與水稻、擬南芥、玉米、大豆等物種中的同源蛋白進行序列對比分析,并借助 MEGA4.1 軟件構建系統(tǒng)進化樹。結果顯sHSP40 與小分子熱激蛋白的同源性更高,在同一分枝上,但相較于分子十幾 kDa 的 sHSP,OsHSP40 與它們的親緣關系較遠(圖 3.2)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物熱激蛋白研究進展[J]. 栗振義,龍瑞才,張鐵軍,楊青川,康俊梅. 生物技術通報. 2016(02)
[2]利用染色體單片段代換系定位水稻結實率QTL[J]. 高云,陶亞軍,王立廣,于小鳳,陳達,董桂春,梁國華. 江蘇農業(yè)科學. 2014(11)
[3]玉米熱激蛋白基因ZmHsp90-1的克隆及表達分析[J]. 劉玲玲,柳思思,翁建峰,王昌濤,李新海,張世煌,石慶華,王麗娟,郝轉芳. 作物學報. 2012(10)
[4]影響水稻結實率的主要因素及對策[J]. 李松柏. 種業(yè)導刊. 2010(12)
[5]熱激蛋白與植物的抗冷性概述[J]. 從心黎,黃綿佳. 現(xiàn)代農業(yè)科學. 2009(11)
[6]過表達番茄葉綠體小分子熱激蛋白提高植株的耐熱性[J]. 楊傳燕,王翠,張景霞,王佳穎,王麗,劉箭. 山東師范大學學報(自然科學版). 2008(04)
[7]植物熱激蛋白HSP100/ClpB及其在提高植物抗熱性和抗寒性中的應用[J]. 許聲濤,孫文香,田進平,王崇英. 植物生理學通訊. 2008(04)
[8]不同生長環(huán)境下水稻結實率數(shù)量性狀位點的檢測[J]. 韓龍植,張三元,喬永利,金鐘煥,徐福榮,曹桂蘭,南鐘浩,戴陸園,芮鐘斗,高熙宗. 作物學報. 2006(07)
[9]植物熱激蛋白研究進展[J]. 張建國,何彩云,段愛國,殷繼艷. 福建林學院學報. 2005(02)
[10]水稻花粉發(fā)育過程及其分期[J]. 馮九煥,盧永根,劉向東,徐雪賓. 中國水稻科學. 2001(01)
博士論文
[1]OsDCL3b下調表達對稻米產(chǎn)量和品質的影響[D]. 廖鵬飛.南昌大學 2017
[2]蠟梅熱激蛋白70(HSP70)基因的克隆及功能分析[D]. NGUYEN VAN TIEN(阮文進).西南大學 2015
[3]水稻雄性不育突變體gsl5的基因克隆及不育機理研究[D]. 師曉.中國農業(yè)科學院 2015
碩士論文
[1]水稻OsGPRP家族基因結構與表達分析[D]. 童普國.南昌大學 2017
[2]紫花苜蓿熱激蛋白基因MsHSP70的克隆及功能分析[D]. 栗振義.中國農業(yè)科學院 2015
[3]高溫脅迫下水稻熱激蛋白的作用機理研究[D]. 陳新海.福建農林大學 2011
本文編號:3399832
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