青海湖裸鯉AP-1基因的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-06 22:00
AP-1是細(xì)胞增殖和分化的重要轉(zhuǎn)錄因子,在動(dòng)物免疫、發(fā)育等方面發(fā)揮著重要作用。本研究采用RACE方法克隆了青海湖裸鯉AP-1基因的c DNA全長(zhǎng)序列,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR探究了其在不同組織中的表達(dá)情況。結(jié)果顯示,青海湖裸鯉AP-1的cDNA序列全長(zhǎng)為1 832 bp,CDS區(qū)918 bp,共編碼305個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)該蛋白的分子量為33.69 kD,等電點(diǎn)9.20。系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果顯示青海湖裸鯉與犀角金線鲃?dòng)休^高的同源性。蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示該基因編碼的蛋白C端具有一個(gè)典型的堿性區(qū)和一個(gè)高度保守的亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)能與DNA相結(jié)合。qRT-PCR結(jié)果表明,AP-1基因在肌肉、肝臟、鰓、心、腎、腦、腸和脾臟中均有表達(dá)。在肌肉中具有最高表達(dá)量(p<0.01),其次為肝臟和鰓(p<0.01),在脾臟中表達(dá)量最低。本研究為進(jìn)一步了解青海湖裸鯉AP-1基因的功能提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
【文章來(lái)源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【部分圖文】:
AP-1蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)
實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果顯示,該基因在肌肉、肝臟、鰓、心、腦、腸、腎和脾臟中都有表達(dá),表達(dá)具有普遍性。吳冰等(2014)在對(duì)凡納濱對(duì)蝦進(jìn)行研究時(shí),得出結(jié)論AP-1表達(dá)于多種組織中,不存在組織表達(dá)的特異性,且具有普遍的表達(dá)性。但在不同的組織中其表達(dá)量不同,在肌肉中表達(dá)量最高,脾臟中表達(dá)量最低。Baresic等(2014)研究表明,AP-1含有的JUN和ATF蛋白復(fù)合物在肌肉細(xì)胞中的表達(dá)量是最高的,激活蛋白1復(fù)合物(AP-1)在肌肉中的高表達(dá)對(duì)于過(guò)氧化物酶體增殖激活受體輔激活因子1 (PGC-1)調(diào)控缺氧反應(yīng)基因起到重要作用,AP-1與PGC-1的相互作用對(duì)缺氧反應(yīng)起到協(xié)同作用,該基因缺失會(huì)降低PGC-1對(duì)靶基因的正向調(diào)控能力。因此,表明AP-1基因在肌肉中表達(dá)量較高,這與本實(shí)驗(yàn)得出的AP-1基因在肌肉中的表達(dá)量是最高的結(jié)論一致。也有研究表明,AP-1基因在青蛤5個(gè)組織中的表達(dá)時(shí),得出在閉殼肌中該基因的表達(dá)量排第二,是比較高的,與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果也有相似之處(丁丹等,2018)。Zoysa等(2010)在研究鮑魚免疫相關(guān)基因的表達(dá)時(shí),檢測(cè)出AP-1在肌肉和鰓中有高表達(dá)量,這與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果相一致。AP-1是與免疫相關(guān)的基因,本研究中AP-1基因在鰓中的表達(dá)量比較高,而在脾臟中的表達(dá)量相對(duì)較低。因此,推測(cè)AP-1在青海湖裸鯉中可能只參與了部分免疫過(guò)程。圖5 基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]《轉(zhuǎn)錄因子JunB/AP-1調(diào)節(jié)多發(fā)性骨髓瘤在骨髓微環(huán)境中的細(xì)胞增殖與耐藥》解讀[J]. 范鳳娟,江沁月,孫春艷,胡豫. 臨床血液學(xué)雜志. 2018(04)
[2]中華蜜蜂轉(zhuǎn)錄因子AP-1基因的克隆及特性分析[J]. 郗學(xué)鵬,魏偉,張衛(wèi)星,王紅芳,胥保華. 昆蟲學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]青蛤(Cyclina sinensis)AP-1基因的克隆及在鰻弧菌(Vibrio anguillarum)侵染下的表達(dá)分析[J]. 丁丹,潘寶平,王玉梅,侯梓園,閆春財(cái). 海洋與湖沼. 2018(01)
[4]AP-1的研究進(jìn)展[J]. 伍培,趙建美. 南通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(01)
[5]凡納濱對(duì)蝦AP-1基因的克隆和表達(dá)特征分析[J]. 吳冰,劉逸塵,張亦陳,耿緒云,孫金生. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2014(09)
[6]青海湖裸鯉與花斑裸鯉肌肉理化特性比較[J]. 孫萬(wàn)成,申志新,羅毅皓,王國(guó)杰. 食品研究與開發(fā). 2013(14)
本文編號(hào):3388250
【文章來(lái)源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【部分圖文】:
AP-1蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)
實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果顯示,該基因在肌肉、肝臟、鰓、心、腦、腸、腎和脾臟中都有表達(dá),表達(dá)具有普遍性。吳冰等(2014)在對(duì)凡納濱對(duì)蝦進(jìn)行研究時(shí),得出結(jié)論AP-1表達(dá)于多種組織中,不存在組織表達(dá)的特異性,且具有普遍的表達(dá)性。但在不同的組織中其表達(dá)量不同,在肌肉中表達(dá)量最高,脾臟中表達(dá)量最低。Baresic等(2014)研究表明,AP-1含有的JUN和ATF蛋白復(fù)合物在肌肉細(xì)胞中的表達(dá)量是最高的,激活蛋白1復(fù)合物(AP-1)在肌肉中的高表達(dá)對(duì)于過(guò)氧化物酶體增殖激活受體輔激活因子1 (PGC-1)調(diào)控缺氧反應(yīng)基因起到重要作用,AP-1與PGC-1的相互作用對(duì)缺氧反應(yīng)起到協(xié)同作用,該基因缺失會(huì)降低PGC-1對(duì)靶基因的正向調(diào)控能力。因此,表明AP-1基因在肌肉中表達(dá)量較高,這與本實(shí)驗(yàn)得出的AP-1基因在肌肉中的表達(dá)量是最高的結(jié)論一致。也有研究表明,AP-1基因在青蛤5個(gè)組織中的表達(dá)時(shí),得出在閉殼肌中該基因的表達(dá)量排第二,是比較高的,與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果也有相似之處(丁丹等,2018)。Zoysa等(2010)在研究鮑魚免疫相關(guān)基因的表達(dá)時(shí),檢測(cè)出AP-1在肌肉和鰓中有高表達(dá)量,這與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果相一致。AP-1是與免疫相關(guān)的基因,本研究中AP-1基因在鰓中的表達(dá)量比較高,而在脾臟中的表達(dá)量相對(duì)較低。因此,推測(cè)AP-1在青海湖裸鯉中可能只參與了部分免疫過(guò)程。圖5 基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
基于青海湖裸鯉AP-1氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]《轉(zhuǎn)錄因子JunB/AP-1調(diào)節(jié)多發(fā)性骨髓瘤在骨髓微環(huán)境中的細(xì)胞增殖與耐藥》解讀[J]. 范鳳娟,江沁月,孫春艷,胡豫. 臨床血液學(xué)雜志. 2018(04)
[2]中華蜜蜂轉(zhuǎn)錄因子AP-1基因的克隆及特性分析[J]. 郗學(xué)鵬,魏偉,張衛(wèi)星,王紅芳,胥保華. 昆蟲學(xué)報(bào). 2018(04)
[3]青蛤(Cyclina sinensis)AP-1基因的克隆及在鰻弧菌(Vibrio anguillarum)侵染下的表達(dá)分析[J]. 丁丹,潘寶平,王玉梅,侯梓園,閆春財(cái). 海洋與湖沼. 2018(01)
[4]AP-1的研究進(jìn)展[J]. 伍培,趙建美. 南通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(01)
[5]凡納濱對(duì)蝦AP-1基因的克隆和表達(dá)特征分析[J]. 吳冰,劉逸塵,張亦陳,耿緒云,孫金生. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2014(09)
[6]青海湖裸鯉與花斑裸鯉肌肉理化特性比較[J]. 孫萬(wàn)成,申志新,羅毅皓,王國(guó)杰. 食品研究與開發(fā). 2013(14)
本文編號(hào):3388250
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