北方旱地紅小豆DREB2A基因克隆及表達分析
發(fā)布時間:2021-09-03 10:19
脫水響應(yīng)元件結(jié)合蛋白(DREB)轉(zhuǎn)錄因子在植物干旱和熱脅迫應(yīng)激調(diào)控中具有重要功能。為提高紅小豆在北方干旱缺水條件下的產(chǎn)量,本研究以擬南芥DREB2A基因序列為依據(jù),從紅小豆基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定出了1個DREB2A的同源基因(Vigna angularis,登錄號為XP017429189.1)。經(jīng)基因表達分析,結(jié)果表明:此基因為擬南芥DREB2A的直系同源基因,編碼的蛋白不具有信號肽的作用,二級結(jié)構(gòu)主要以無規(guī)則卷曲為主,而且含有多種逆境性轉(zhuǎn)錄因子。通過物種間系統(tǒng)進化樹分析發(fā)現(xiàn),該基因與紅小豆DREB2A親緣關(guān)系近的植物是沙冬青。熒光定量PCR技術(shù)分析結(jié)果表明,在紅小豆非生物脅迫的調(diào)控中紅小豆DREB2A也起到重要作用。本研究為闡釋紅小豆抗逆分子機制提供理論基礎(chǔ)。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
紅小豆DREB2A與其他物種DREB2A的氨基酸序列比對
DREB2A蛋白的親水性預(yù)測
信號肽是引導(dǎo)新合成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈,信號肽預(yù)測的功能是預(yù)測給定的氨基酸序列中是否存在潛在的信號肽剪切位點及其所在位置。存在于分泌蛋白的N端序列可作為信號肽,而分泌蛋白是先在細胞內(nèi)合成,行使蛋白功能時需要分泌到細胞外,信號肽能夠引導(dǎo)分泌性蛋白移動到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上合成,信號肽一般在蛋白合成結(jié)束前就會被切除。利用信號肽預(yù)測程序SignalP進行預(yù)測,DREB2A的mean S值為0.101,小于0.5,結(jié)果表明DREB2A不屬于分泌蛋白(圖5)。游離的核糖體將其合成后,DREB2A進入胞質(zhì)溶膠蛋白質(zhì)中,參與細胞核、線粒體、過氧化物酶體等的生化反應(yīng)。圖4 DREB2A蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大豆GmABI4基因克隆及表達分析[J]. 江如,周文冠,趙思華,尹晗,楊文鈺,舒凱. 西北植物學(xué)報. 2018(06)
[2]煙草NtCBL1基因的克隆、表達載體構(gòu)建及表達分析[J]. 張雪薇,劉侖,魯黎明,李立芹. 植物研究. 2017(03)
[3]DREB/CBF轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫中的作用及研究進展[J]. 柏星軒,閆雪,要宇晨,寧蕾,王曙光,孫黛珍. 生物學(xué)雜志. 2017(04)
[4]植物應(yīng)答非生物脅迫的蛋白質(zhì)組學(xué)研究進展[J]. 付晨熙,肖自華,高飛,周宜君. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(12)
[5]梭梭中HaDREB2A的克隆與表達分析[J]. 劉超,馬麗,李月,代培紅,姚正培,張樺. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(09)
[6]DREB1A基因植物表達載體的構(gòu)建[J]. 李杰,李晶,朱延明,張晶,代翠紅,紀(jì)巍,才華. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2003(02)
碩士論文
[1]巨桉抗寒相關(guān)基因EgrCT和EgrDREB2A的脅迫響應(yīng)表達分析[D]. 魏曉玲.浙江農(nóng)林大學(xué) 2014
本文編號:3380932
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
紅小豆DREB2A與其他物種DREB2A的氨基酸序列比對
DREB2A蛋白的親水性預(yù)測
信號肽是引導(dǎo)新合成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈,信號肽預(yù)測的功能是預(yù)測給定的氨基酸序列中是否存在潛在的信號肽剪切位點及其所在位置。存在于分泌蛋白的N端序列可作為信號肽,而分泌蛋白是先在細胞內(nèi)合成,行使蛋白功能時需要分泌到細胞外,信號肽能夠引導(dǎo)分泌性蛋白移動到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上合成,信號肽一般在蛋白合成結(jié)束前就會被切除。利用信號肽預(yù)測程序SignalP進行預(yù)測,DREB2A的mean S值為0.101,小于0.5,結(jié)果表明DREB2A不屬于分泌蛋白(圖5)。游離的核糖體將其合成后,DREB2A進入胞質(zhì)溶膠蛋白質(zhì)中,參與細胞核、線粒體、過氧化物酶體等的生化反應(yīng)。圖4 DREB2A蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
【參考文獻】:
期刊論文
[1]大豆GmABI4基因克隆及表達分析[J]. 江如,周文冠,趙思華,尹晗,楊文鈺,舒凱. 西北植物學(xué)報. 2018(06)
[2]煙草NtCBL1基因的克隆、表達載體構(gòu)建及表達分析[J]. 張雪薇,劉侖,魯黎明,李立芹. 植物研究. 2017(03)
[3]DREB/CBF轉(zhuǎn)錄因子在植物非生物脅迫中的作用及研究進展[J]. 柏星軒,閆雪,要宇晨,寧蕾,王曙光,孫黛珍. 生物學(xué)雜志. 2017(04)
[4]植物應(yīng)答非生物脅迫的蛋白質(zhì)組學(xué)研究進展[J]. 付晨熙,肖自華,高飛,周宜君. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(12)
[5]梭梭中HaDREB2A的克隆與表達分析[J]. 劉超,馬麗,李月,代培紅,姚正培,張樺. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(09)
[6]DREB1A基因植物表達載體的構(gòu)建[J]. 李杰,李晶,朱延明,張晶,代翠紅,紀(jì)巍,才華. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2003(02)
碩士論文
[1]巨桉抗寒相關(guān)基因EgrCT和EgrDREB2A的脅迫響應(yīng)表達分析[D]. 魏曉玲.浙江農(nóng)林大學(xué) 2014
本文編號:3380932
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