采用Mi Seq高通量測序技術(shù)對來鳳地區(qū)鹽漬藠頭鹽水細菌多樣性進行解析,并采用PICRUSt技術(shù)對其基因功能進行預測。結(jié)果表明,99.58%的基因序列長度為425～451 bp,基本覆蓋16S r RNA V₃-V₄區(qū)序列;優(yōu)勢細菌門為硬壁菌門（Firmicutes）、變形菌門（Proteobacteria）和放線菌門（Actinobacteria）,平均相對含量分別為43.94%、33.12%和18.21%;優(yōu)勢細菌屬為乳桿菌屬（Lactobacillus）、假單胞菌屬（Pseudomonas）和嗜熱油菌屬（Thermoleophilum）,平均相對含量分別為30.28%、18.21%和16.13%;共有219個核心操作分類單元（OTU）,包含的序列數(shù)占總序列數(shù)的75.56%;鹽漬藠頭鹽水中可能共有大量具有較強氨基酸轉(zhuǎn)運和代謝功能的細菌類群。 

【文章來源】：中國釀造. 2020,39(10)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

鹽漬藠頭鹽水中平均相對含量>1.0%的細菌屬

若某一OTU在6個鹽漬藠頭鹽水樣品中均存在，則將其定義為核心OTU[31],OTU在每個樣品中的分布情況見圖4。由圖4可知，樣品JT1～JT6分別含有3 256、2 843、3 272、4 296、2 636和2 980個OTU，其中219個為核心OTU，占OTU總數(shù)的1.63%，但包含了217998條序列，占總序列數(shù)的75.56%,14個核心OTU的平均相對含量>1.0%，累計平均相對含量為43.14%，其平均相對含量的分布見圖5。

由圖4可知，樣品JT1～JT6分別含有3 256、2 843、3 272、4 296、2 636和2 980個OTU，其中219個為核心OTU，占OTU總數(shù)的1.63%，但包含了217998條序列，占總序列數(shù)的75.56%,14個核心OTU的平均相對含量>1.0%，累計平均相對含量為43.14%，其平均相對含量的分布見圖5。由圖5可知，分別有5、3、3、2和1個OTU被鑒定隸屬于Thermoleophilum、Lactobacillus、Pseudomonas、Bacillus和Lactococcus，累計平均相對含量分別為7.98%、15.58%、11.96%、2.27%和5.35%。平均相對含量>1.0%核心OTU相關(guān)性的熱圖見圖6。

【參考文獻】：
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博士論文
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本文編號：3378496