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花楸樹小熱激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)克隆與表達分析

發(fā)布時間:2021-09-02 07:12
  以花楸樹[Sorbus pohuashanensis(Hance) Hedl.]為研究對象,對其小熱激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)的克隆、組織特異性表達以及響應(yīng)非生物脅迫的表達進行研究。結(jié)果表明:SpHSP23.8基因開放閱讀框(ORF)包含648個堿基,編碼215個氨基酸,其編碼氨基酸序列的理論相對分子質(zhì)量約23 800,該基因包含1個內(nèi)含子。氨基酸序列比對結(jié)果顯示:SpHSP23.8蛋白與枇杷[Eriobotrya japonica(Thunb.) Lindl.]EjsHSP6蛋白(登錄號AKP06201.1)的同源性最高。根據(jù)SpHSP23.8蛋白與模式植物小熱激蛋白氨基酸序列的聚類分析結(jié)果,推測SpHSP23.8蛋白定位于線粒體中。組織特異性表達結(jié)果顯示:SpHSP23.8基因在莖中的相對表達量最高,其次為果實和根,而花中的相對表達量最低。高溫、NaCl及干旱脅迫下,花楸樹葉片中SpHSP23.8基因的相對表達量顯著升高。隨著高溫脅迫時間的延長,SpHSP23.8基因的相對表達量呈先升高后降低的變化趨勢,且在脅迫2.00 h達到峰值;在NaCl和干旱脅迫下,SpHSP... 

【文章來源】:植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2020,29(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:12 頁

【部分圖文】:

花楸樹小熱激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)克隆與表達分析


花楸樹SpHSP23.8基因的PCR擴增圖譜(A)和結(jié)構(gòu)示意圖(B)

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蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測結(jié)果(圖3)顯示:花楸樹SpHSP23.8蛋白中α螺旋包含50個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的23.26%;β轉(zhuǎn)角包含9個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的4.19%;延伸鏈包含28個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的13.02%;無規(guī)卷曲包含128個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的59.53%。圖3 花楸樹SpHSP23.8蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

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由圖8可以看出:花楸樹莖中SpHSP23.8基因的相對表達量最高,顯著(P<0.05)高于其他器官;果實和根中的相對表達量也較高;花中的相對表達量最低。由圖9可以看出:隨著高溫脅迫時間的延長,花楸樹葉片中SpHSP23.8基因的相對表達量呈先升高后降低的變化趨勢。高溫脅迫0.25 h,SpHSP23.8基因的相對表達量即顯著升高,隨后急劇升高;高溫脅迫2.00 h,其相對表達量達到峰值,隨后其相對表達量顯著降低。

【參考文獻】:
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本文編號:3378572

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