花楸樹小熱激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)克隆與表達分析
發(fā)布時間:2021-09-02 07:12
以花楸樹[Sorbus pohuashanensis(Hance) Hedl.]為研究對象,對其小熱激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)的克隆、組織特異性表達以及響應(yīng)非生物脅迫的表達進行研究。結(jié)果表明:SpHSP23.8基因開放閱讀框(ORF)包含648個堿基,編碼215個氨基酸,其編碼氨基酸序列的理論相對分子質(zhì)量約23 800,該基因包含1個內(nèi)含子。氨基酸序列比對結(jié)果顯示:SpHSP23.8蛋白與枇杷[Eriobotrya japonica(Thunb.) Lindl.]EjsHSP6蛋白(登錄號AKP06201.1)的同源性最高。根據(jù)SpHSP23.8蛋白與模式植物小熱激蛋白氨基酸序列的聚類分析結(jié)果,推測SpHSP23.8蛋白定位于線粒體中。組織特異性表達結(jié)果顯示:SpHSP23.8基因在莖中的相對表達量最高,其次為果實和根,而花中的相對表達量最低。高溫、NaCl及干旱脅迫下,花楸樹葉片中SpHSP23.8基因的相對表達量顯著升高。隨著高溫脅迫時間的延長,SpHSP23.8基因的相對表達量呈先升高后降低的變化趨勢,且在脅迫2.00 h達到峰值;在NaCl和干旱脅迫下,SpHSP...
【文章來源】:植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2020,29(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
花楸樹SpHSP23.8基因的PCR擴增圖譜(A)和結(jié)構(gòu)示意圖(B)
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測結(jié)果(圖3)顯示:花楸樹SpHSP23.8蛋白中α螺旋包含50個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的23.26%;β轉(zhuǎn)角包含9個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的4.19%;延伸鏈包含28個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的13.02%;無規(guī)卷曲包含128個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的59.53%。圖3 花楸樹SpHSP23.8蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
由圖8可以看出:花楸樹莖中SpHSP23.8基因的相對表達量最高,顯著(P<0.05)高于其他器官;果實和根中的相對表達量也較高;花中的相對表達量最低。由圖9可以看出:隨著高溫脅迫時間的延長,花楸樹葉片中SpHSP23.8基因的相對表達量呈先升高后降低的變化趨勢。高溫脅迫0.25 h,SpHSP23.8基因的相對表達量即顯著升高,隨后急劇升高;高溫脅迫2.00 h,其相對表達量達到峰值,隨后其相對表達量顯著降低。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]花楸樹熱激蛋白70基因的克隆及表達分析[J]. 劉聰聰,張澤,關(guān)雪蓮,裴鑫,鄭健. 分子植物育種. 2019(19)
[2]茶樹小分子熱激蛋白基因CsHSP22.4、CsHSP27.4、CsHSP17.5和CsHSP25.2的克隆與表達分析[J]. 陳江飛,高童,萬思卿,張永恒,周天山,余有本,楊亞軍,肖斌,王偉東. 園藝學(xué)報. 2018(06)
[3]巴西橡膠樹sHSP23.8基因的克隆、生物信息學(xué)及表達分析[J]. 李德軍,郭會娜,鄧治,劉輝,陳江淑,姜達,夏立瓊,夏志輝. 植物生理學(xué)報. 2015(11)
[4]哈爾濱市主栽花楸生物學(xué)特性研究[J]. 張妍妍,白卉,盧慧穎,曹炎,王艷敏. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(36)
[5]茶樹小分子量熱激蛋白基因CsHSP17.2的克隆與表達分析[J]. 王明樂,朱旭君,王偉東,王炫清,林明露,黎星輝. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(03)
[6]不同種源花楸樹幼苗越夏能力的比較[J]. 彭松,馬淼,鄭勇奇,張川紅. 生態(tài)學(xué)雜志. 2014(02)
[7]長白山區(qū)三種觀賞樹木物候與生長節(jié)律研究[J]. 林玉梅,任軍,楊軼囡,王曉娜,王超,劉亞軍. 吉林林業(yè)科技. 2013(05)
[8]花楸樹種源間表型性狀的地理變異分析[J]. 鄭健,胡增輝,鄭勇奇,謝育常. 植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2012(03)
[9]花楸樹體細胞胚與合子胚的發(fā)生發(fā)育[J]. 楊玲,沈海龍. 林業(yè)科學(xué). 2011(10)
[10]高溫脅迫下花楸樹幼苗的生理響應(yīng)[J]. 彭松,鄭勇奇,馬淼,張川紅,杜小娟,李濤,倪延生. 林業(yè)科學(xué)研究. 2011(05)
本文編號:3378572
【文章來源】:植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2020,29(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
花楸樹SpHSP23.8基因的PCR擴增圖譜(A)和結(jié)構(gòu)示意圖(B)
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測結(jié)果(圖3)顯示:花楸樹SpHSP23.8蛋白中α螺旋包含50個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的23.26%;β轉(zhuǎn)角包含9個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的4.19%;延伸鏈包含28個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的13.02%;無規(guī)卷曲包含128個氨基酸殘基,占總氨基酸殘基數(shù)的59.53%。圖3 花楸樹SpHSP23.8蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
由圖8可以看出:花楸樹莖中SpHSP23.8基因的相對表達量最高,顯著(P<0.05)高于其他器官;果實和根中的相對表達量也較高;花中的相對表達量最低。由圖9可以看出:隨著高溫脅迫時間的延長,花楸樹葉片中SpHSP23.8基因的相對表達量呈先升高后降低的變化趨勢。高溫脅迫0.25 h,SpHSP23.8基因的相對表達量即顯著升高,隨后急劇升高;高溫脅迫2.00 h,其相對表達量達到峰值,隨后其相對表達量顯著降低。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]花楸樹熱激蛋白70基因的克隆及表達分析[J]. 劉聰聰,張澤,關(guān)雪蓮,裴鑫,鄭健. 分子植物育種. 2019(19)
[2]茶樹小分子熱激蛋白基因CsHSP22.4、CsHSP27.4、CsHSP17.5和CsHSP25.2的克隆與表達分析[J]. 陳江飛,高童,萬思卿,張永恒,周天山,余有本,楊亞軍,肖斌,王偉東. 園藝學(xué)報. 2018(06)
[3]巴西橡膠樹sHSP23.8基因的克隆、生物信息學(xué)及表達分析[J]. 李德軍,郭會娜,鄧治,劉輝,陳江淑,姜達,夏立瓊,夏志輝. 植物生理學(xué)報. 2015(11)
[4]哈爾濱市主栽花楸生物學(xué)特性研究[J]. 張妍妍,白卉,盧慧穎,曹炎,王艷敏. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(36)
[5]茶樹小分子量熱激蛋白基因CsHSP17.2的克隆與表達分析[J]. 王明樂,朱旭君,王偉東,王炫清,林明露,黎星輝. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(03)
[6]不同種源花楸樹幼苗越夏能力的比較[J]. 彭松,馬淼,鄭勇奇,張川紅. 生態(tài)學(xué)雜志. 2014(02)
[7]長白山區(qū)三種觀賞樹木物候與生長節(jié)律研究[J]. 林玉梅,任軍,楊軼囡,王曉娜,王超,劉亞軍. 吉林林業(yè)科技. 2013(05)
[8]花楸樹種源間表型性狀的地理變異分析[J]. 鄭健,胡增輝,鄭勇奇,謝育常. 植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2012(03)
[9]花楸樹體細胞胚與合子胚的發(fā)生發(fā)育[J]. 楊玲,沈海龍. 林業(yè)科學(xué). 2011(10)
[10]高溫脅迫下花楸樹幼苗的生理響應(yīng)[J]. 彭松,鄭勇奇,馬淼,張川紅,杜小娟,李濤,倪延生. 林業(yè)科學(xué)研究. 2011(05)
本文編號:3378572
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