長角血蜱Haemaphysalis longicornis是一種專性吸血的體外寄生蟲,廣泛分布于澳大利亞、新西蘭和東亞等地區(qū)。在我國,長角血蜱是華北地區(qū)的優(yōu)勢種之一,具有極強的繁殖擴散能力,包括兩性生殖種群（H.longicornis bisexual population,HLBP）和孤雌生殖種群（H.longicornis parthenogenetic population,HLPP）,對其繁殖機制和種群特性的深入比較研究具有重要的科學(xué)意義。本文對HLBP和HLPP線粒體基因組進行測序和比較分析,發(fā)現(xiàn)兩個生殖種群在基因結(jié)構(gòu)、數(shù)量和位置上無明顯變化。系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,HLBP和HLPP的分化水平較低,親緣關(guān)系緊密,遺傳距離小于亞種水平。線粒體蛋白編碼基因的定量分析顯示,在HLBP和HLPP不同發(fā)育時期線粒體基因的轉(zhuǎn)錄模式存在明顯差異,但遺傳序列的研究結(jié)果依然支持兩個生殖種群隸屬同一物種。為從分子水平闡明長角血蜱卵巢發(fā)育相關(guān)的基因功能,對HLBP和HLPP不同吸血時期的卵巢進行轉(zhuǎn)錄組測序。分析結(jié)果顯示,參與卵巢發(fā)育功能的基因主要集中在細胞分化、組織發(fā)育、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、翻譯修飾、脂類代謝、... 

【文章來源】：河北師范大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：114 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

蜱類線粒體基因組的重排特征Fig.1.1Generearrangementinthetickmitochondrialgenomes

10圖1.2蜱類完整線粒體基因組構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育分析Fig.1.2Phylogeneticanalysisofthetickscompletemitochondrialgenome1.4.6線粒體基因組研究方向蜱螨類占螯肢亞門寄生動物的53%（ShaoandBarker,2007），對農(nóng)業(yè)發(fā)展和人類健康造成了巨大危害，線粒體基因組已被證明可以有效應(yīng)用于蜱類分類學(xué)研究，但90%以上的蜱類完整蜱線粒體基因組還未報道，一些物種線粒體基因組數(shù)據(jù)的缺失和物種采集的地理偏差會影響系統(tǒng)發(fā)育研究的可靠性，因此需要更多完

2.2.1 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控 對測序 reads 進行堿基含量分布和堿基錯誤率統(tǒng)計，可以反映出樣本的測序質(zhì)量，針對每個樣本原始數(shù)據(jù)進行測序相關(guān)的質(zhì)量評估。堿基含量分布可以檢查樣本有無堿基分離現(xiàn)象，理論上每個測序循環(huán)上 GC 和 AT 的含量相等，且在整個測序過程基本不變（圖 2.1）。測序錯誤率會隨著序列長度的增加而升高，在測序片段前端和末端幾個循環(huán)的錯誤率會偏高（圖 2.2）。測序結(jié)果顯示，該文庫堿基質(zhì)量良好，可用于后續(xù)分析。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]孤雌生殖長角血蜱的哈氏器超微結(jié)構(gòu)與發(fā)育[J]. 王多,胡永紅,劉敬澤.  昆蟲學(xué)報. 2013(03)
[2]孤雌生殖長角血蜱各蟲期形態(tài)的掃描電鏡觀察[J]. 楊彩明,楊光友,謝幼新,吳開波,賈小勇.  寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報. 2007(02)
[3]我國長角血蜱孤雌生殖種群的發(fā)現(xiàn)和生物學(xué)特性的研究[J]. 周金林,周勇志,龔海燕,陳靈芝,曹杰.  中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2004(03)



本文編號：3378157