臭氧（O₃）作為一種危害型溫室氣體,進入植物體后會誘發(fā)活性氧產(chǎn)生,影響植物的正常生長,造成農(nóng)業(yè)生產(chǎn)力下降。近年來隨著合成臭氧的前體物含量增加,空氣中臭氧的濃度也隨之增加。其濃度高峰期與植物的生長期相重疊,說明臭氧對植物的影響已經(jīng)不容忽視,所以全面了解植物長期受到臭氧脅迫引起的一系列分子應答機制就顯得尤為重要。水稻（Oryza sativa L.）作為重要的糧食作物,是世界一半以上人口的主要食物來源。目前水稻全基因組測序已經(jīng)完成,其基因組小,注釋信息較全面,是農(nóng)作物中的模式植物。本研究以水稻品種日本晴為材料,利用開頂箱（OTC）的方法模擬臭氧脅迫,處理濃度為80nmol·mol^-1,160nmol·mol^-1和200nmol·mol^-1,以未過濾的空氣做對照,對處于營養(yǎng)生長時期的水稻葉片進行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,得到如下結(jié)果:1.在差異表達基因功能富集分類中,發(fā)現(xiàn)長期臭氧處理下上調(diào)差異表達基因在細胞死亡、信號轉(zhuǎn)導、響應非生物刺激、響應脅迫、氧結(jié)合、激酶活性、細胞壁組分等功能上顯著富集,下調(diào)差異表達基因在光合... 

【文章來源】：遼寧大學遼寧省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-13個處理時間點不同臭氧濃度處理下差異表達基因柱狀圖

圖 3-2 3 個處理時間點不同臭氧濃度處理下差異表達基因維恩圖注：80、160、200 分別代表 80nmol·mol-1、160nmol·mol-1、200nmol·mol-1處理臭氧濃度3.2 響應臭氧脅迫差異表達基因的 GO 功能富集分析Gene Ontology（簡稱 GO）是一個國際標準化的基因功能分類體系，總共分為三類，分別是描述基因參與的生物過程（biological process）、細胞組分（cellularcomponent）、分子功能（molecular function）。我們利用 AgriGO 網(wǎng)站分別將得到的每組上、下調(diào) DEGs 分別進行 GO 功能富集分析，將得到的結(jié)果按照三個分類進行整理。通過數(shù)據(jù)我們可以看出在同一天數(shù)不同濃度處理下，功能富集的分類不同。在生物過程這一分類中，共在 33 個分類中顯著富集如圖 3-3，其中包括碳水化合物代謝過程，分解代謝過程、細胞通訊、細胞死亡、基因表達、生物過程的調(diào)節(jié)、細胞過程的調(diào)節(jié)、對非生物脅迫的反應、對刺激的反應、應對脅迫、次生代謝過

17圖 3-3 GO 分類中生物過程涉及差異表達基因富集基因功能分類注：Induced Genes 代表上調(diào)差異表達基因，Supressed Genes 代表下調(diào)差異表達基因，*代表該差異表達基因該功能中顯著富集


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