臭氧（O₃）作為一種危害型溫室氣體,進(jìn)入植物體后會(huì)誘發(fā)活性氧產(chǎn)生,影響植物的正常生長(zhǎng),造成農(nóng)業(yè)生產(chǎn)力下降。近年來隨著合成臭氧的前體物含量增加,空氣中臭氧的濃度也隨之增加。其濃度高峰期與植物的生長(zhǎng)期相重疊,說明臭氧對(duì)植物的影響已經(jīng)不容忽視,所以全面了解植物長(zhǎng)期受到臭氧脅迫引起的一系列分子應(yīng)答機(jī)制就顯得尤為重要。水稻（Oryza sativa L.）作為重要的糧食作物,是世界一半以上人口的主要食物來源。目前水稻全基因組測(cè)序已經(jīng)完成,其基因組小,注釋信息較全面,是農(nóng)作物中的模式植物。本研究以水稻品種日本晴為材料,利用開頂箱（OTC）的方法模擬臭氧脅迫,處理濃度為80nmol·mol^-1,160nmol·mol^-1和200nmol·mol^-1,以未過濾的空氣做對(duì)照,對(duì)處于營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)時(shí)期的水稻葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,得到如下結(jié)果:1.在差異表達(dá)基因功能富集分類中,發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)期臭氧處理下上調(diào)差異表達(dá)基因在細(xì)胞死亡、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、響應(yīng)非生物刺激、響應(yīng)脅迫、氧結(jié)合、激酶活性、細(xì)胞壁組分等功能上顯著富集,下調(diào)差異表達(dá)基因在光合... 

【文章來源】：遼寧大學(xué)遼寧省 211工程院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-13個(gè)處理時(shí)間點(diǎn)不同臭氧濃度處理下差異表達(dá)基因柱狀圖

圖 3-2 3 個(gè)處理時(shí)間點(diǎn)不同臭氧濃度處理下差異表達(dá)基因維恩圖注：80、160、200 分別代表 80nmol·mol-1、160nmol·mol-1、200nmol·mol-1處理臭氧濃度3.2 響應(yīng)臭氧脅迫差異表達(dá)基因的 GO 功能富集分析Gene Ontology（簡(jiǎn)稱 GO）是一個(gè)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化的基因功能分類體系，總共分為三類，分別是描述基因參與的生物過程（biological process）、細(xì)胞組分（cellularcomponent）、分子功能（molecular function）。我們利用 AgriGO 網(wǎng)站分別將得到的每組上、下調(diào) DEGs 分別進(jìn)行 GO 功能富集分析，將得到的結(jié)果按照三個(gè)分類進(jìn)行整理。通過數(shù)據(jù)我們可以看出在同一天數(shù)不同濃度處理下，功能富集的分類不同。在生物過程這一分類中，共在 33 個(gè)分類中顯著富集如圖 3-3，其中包括碳水化合物代謝過程，分解代謝過程、細(xì)胞通訊、細(xì)胞死亡、基因表達(dá)、生物過程的調(diào)節(jié)、細(xì)胞過程的調(diào)節(jié)、對(duì)非生物脅迫的反應(yīng)、對(duì)刺激的反應(yīng)、應(yīng)對(duì)脅迫、次生代謝過

17圖 3-3 GO 分類中生物過程涉及差異表達(dá)基因富集基因功能分類注：Induced Genes 代表上調(diào)差異表達(dá)基因，Supressed Genes 代表下調(diào)差異表達(dá)基因，*代表該差異表達(dá)基因該功能中顯著富集


本文編號(hào)：3377456