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痤瘡發(fā)病機(jī)制關(guān)鍵基因和通路的生物信息學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-08-31 12:05
  目的通過生物信息學(xué)分析方法探討?zhàn)畀彴l(fā)病機(jī)制中可能起重要作用的關(guān)鍵基因和通路。方法從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲取GSE6475和GSE53795數(shù)據(jù)集比較18個(gè)痤瘡皮損組織和18個(gè)正常皮膚組織。用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異基因進(jìn)行基因本體論分析和基因組百科全書關(guān)鍵通路分析,建立差異基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò),獲取關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的樞紐基因和重要的模塊。結(jié)果篩選出痤瘡組織和正常皮膚組織中314個(gè)上調(diào)差異基因和62個(gè)下調(diào)差異基因。KEGG通路分析顯示,這些差異基因主要富集在金黃色葡萄球菌感染、破骨細(xì)胞分化、戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互轉(zhuǎn)化、趨化因子信號(hào)途徑、藥物代謝-其他酶等通路中。建立的PPI網(wǎng)絡(luò)篩選出379個(gè)節(jié)點(diǎn)及10個(gè)樞紐基因(CXCL8、PTPRC、IL1B、ITGB2、CXCR4、ICAM1、CCR5、SELL、C3AR1、PLEK)。結(jié)論樞紐基因和關(guān)鍵通路可能是痤瘡發(fā)病機(jī)制中可進(jìn)行干預(yù)的新靶點(diǎn)。 

【文章來源】:中華醫(yī)學(xué)美學(xué)美容雜志. 2020,26(04)

【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)


本文編號(hào):3374865

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